1     M         1.941   1.954   2.075   2.199   2.216   2.420   2.205   2.226   2.452
2     A        -0.456  -0.434  -0.440  -0.631  -0.592  -0.577  -0.572  -0.544  -0.517
3     W        -0.912  -0.909  -0.893  -0.689  -0.706  -0.631  -0.824  -0.820  -0.771
4     T         0.023  -0.006   0.054  -0.133  -0.150  -0.051  -0.268  -0.296  -0.211
5     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
6     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
7     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
8     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
9     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
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11    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
12    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
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15    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
16    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
17    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
18    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
19    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
20    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
21    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
22    S        -0.598  -0.583  -0.504  -0.815  -0.795  -0.671  -0.712  -0.695  -0.586
23    T        -1.039  -0.967  -0.952  -1.127  -1.012  -1.029  -0.936  -0.860  -0.823
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25    P         1.221   1.180   1.047   1.424   1.368   1.159   1.321   1.252   0.985
26    A        -1.243  -1.290  -1.265  -1.035  -1.134  -1.088  -0.950  -0.993  -0.937
27    H        -0.581  -0.609  -0.528  -0.601  -0.642  -0.528  -0.698  -0.723  -0.614
28    L         0.080   0.061   0.094  -0.212  -0.215  -0.161  -0.193  -0.203  -0.153
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30    N        -1.368  -1.321  -1.285  -1.223  -1.138  -1.108  -1.077  -1.035  -0.958
31    L         0.867   0.814   0.827   0.732   0.654   0.687   0.690   0.581   0.538
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43    C         1.221   1.286   1.064   1.628   1.708   1.422   1.321   1.424   1.018
44    S        -0.912  -0.978  -0.934  -1.052  -1.116  -1.031  -0.824  -0.879  -0.808
45    K        -0.456  -0.511  -0.472  -0.470  -0.526  -0.470  -0.572  -0.621  -0.552
46    D         0.617   0.630   0.752   0.298   0.316   0.500   0.185   0.203   0.378
47    C        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
48    I        -0.912  -0.899  -0.899  -0.691  -0.669  -0.667  -0.824  -0.817  -0.777
49    P         1.941   1.954   2.075   2.092   2.108   2.312   2.205   2.226   2.452
50    S        -0.044  -0.012   0.031  -0.177  -0.113  -0.118  -0.319  -0.272  -0.233
51    V         1.221   1.163   1.039   1.245   1.164   0.967   1.321   1.222   0.970
52    A         0.536   0.504   0.283   0.510   0.467   0.149   0.564   0.515   0.164
53    L         1.941   1.954   2.075   1.788   1.805   2.006   2.205   2.226   2.452
54    M         1.941   1.954   2.075   2.199   2.216   2.420   2.205   2.226   2.452
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59    V        -0.581  -0.566  -0.512  -0.763  -0.766  -0.653  -0.698  -0.687  -0.598
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62    E        -1.132  -1.103  -0.998  -1.090  -1.070  -0.898  -1.026  -0.996  -0.866
63    K         0.126   0.016   0.062  -0.003  -0.201  -0.175  -0.057  -0.228  -0.184
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66    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
67    Q        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
68    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
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70    N        -1.699  -1.680  -1.600  -1.566  -1.559  -1.413  -1.203  -1.184  -1.075
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72    N        -0.581  -0.537  -0.497  -0.850  -0.780  -0.725  -0.698  -0.647  -0.579
73    D        -0.706  -0.708  -0.828  -0.370  -0.371  -0.554  -0.572  -0.574  -0.693
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83    T         0.617   0.634   0.756   0.182   0.204   0.386   0.185   0.212   0.386
84    Q        -0.581  -0.547  -0.517  -0.633  -0.597  -0.539  -0.698  -0.666  -0.602
85    K         1.221   1.180   1.047   1.308   1.266   1.070   1.321   1.252   0.985
86    F         0.222   0.211   0.143   0.465   0.461   0.364   0.059   0.051  -0.074
87    Y        -1.699  -1.703  -1.623  -1.435  -1.447  -1.325  -1.203  -1.201  -1.092
88    N         1.941   1.954   2.075   1.843   1.863   2.062   2.205   2.226   2.452
89    I        -0.125  -0.130  -0.010  -0.240  -0.270  -0.093  -0.446  -0.450  -0.295
90    K        -0.912  -0.873  -0.880  -1.083  -1.047  -1.060  -0.824  -0.791  -0.759
91    E        -0.375  -0.412  -0.423  -0.367  -0.436  -0.456  -0.446  -0.491  -0.490
92    N         1.941   1.954   2.075   1.843   1.863   2.062   2.205   2.226   2.452
93    P         1.941   1.954   2.075   2.092   2.108   2.312   2.205   2.226   2.452
94    K        -1.243  -1.236  -1.258  -1.237  -1.226  -1.291  -0.950  -0.943  -0.930
95    V         1.941   1.954   2.075   1.913   1.931   2.132   2.205   2.226   2.452
96    A         1.221   1.239   1.056   1.145   1.170   0.933   1.321   1.349   1.002
97    L         1.221   1.180   1.047   1.138   1.085   0.895   1.321   1.252   0.985
98    L         1.941   1.954   2.075   1.788   1.805   2.006   2.205   2.226   2.452
99    F        -0.581  -0.508  -0.499  -0.645  -0.538  -0.539  -0.698  -0.609  -0.581
100   H         1.941   1.954   2.075   2.162   2.181   2.383   2.205   2.226   2.452
101   D         1.941   1.954   2.075   2.043   2.064   2.263   2.205   2.226   2.452
102   W         1.941   1.954   2.075   2.275   2.291   2.497   2.205   2.226   2.452
103   I        -0.456  -0.457  -0.451  -0.465  -0.473  -0.426  -0.572  -0.569  -0.530
104   I        -0.375  -0.336  -0.422  -0.441  -0.388  -0.532  -0.446  -0.402  -0.489
105   A        -0.109  -0.170  -0.353   0.123   0.029  -0.266  -0.067  -0.149  -0.387
106   N        -0.125  -0.092   0.007  -0.316  -0.239  -0.115  -0.446  -0.399  -0.272
107   N        -1.243  -1.272  -1.256  -1.183  -1.224  -1.218  -0.950  -0.977  -0.929
108   L        -0.912  -0.978  -0.934  -1.059  -1.150  -1.085  -0.824  -0.879  -0.808
109   S        -0.375  -0.417  -0.453  -0.552  -0.627  -0.671  -0.446  -0.506  -0.526
110   V        -0.876  -0.854  -0.903  -0.919  -0.908  -1.002  -0.762  -0.739  -0.772
111   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
112   G        -0.598  -0.564  -0.521  -0.370  -0.324  -0.251  -0.712  -0.671  -0.603
113   K        -0.431  -0.477  -0.495  -0.350  -0.403  -0.454  -0.488  -0.548  -0.568
114   E        -1.039  -1.026  -0.976  -1.142  -1.114  -1.025  -0.936  -0.923  -0.846
115   S         0.010  -0.045   0.033  -0.294  -0.369  -0.240  -0.263  -0.333  -0.235
116   I        -1.480  -1.458  -1.346  -1.636  -1.628  -1.449  -1.161  -1.138  -1.005
117   S         1.080   1.116   0.983   0.922   0.969   0.770   1.083   1.141   0.859
118   G        -0.431  -0.358  -0.427  -0.253  -0.139  -0.297  -0.488  -0.393  -0.483
119   T        -0.431  -0.477  -0.495  -0.479  -0.567  -0.642  -0.488  -0.548  -0.568
120   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
121   T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
122   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
123   T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
124   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
125   I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
126   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
127   H        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
128   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
129   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
130   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
131   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
132   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
133   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
134   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
135   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
136   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
137   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
138   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
139   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
140   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
141   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
142   E        -0.876  -0.891  -0.882  -0.785  -0.810  -0.829  -0.762  -0.779  -0.751
143   Q        -1.396  -1.345  -1.304  -1.118  -1.023  -0.993  -1.092  -1.044  -0.971
144   R        -0.912  -0.892  -0.879  -0.589  -0.569  -0.538  -0.824  -0.803  -0.756
145   Q        -1.368  -1.408  -1.315  -1.108  -1.191  -1.056  -1.077  -1.102  -0.981
146   S         0.222   0.225   0.169  -0.001   0.023  -0.073   0.059   0.077  -0.024
147   E        -0.109  -0.002  -0.314  -0.085   0.058  -0.377  -0.067   0.073  -0.336
148   L         1.941   1.954   2.075   1.788   1.805   2.006   2.205   2.226   2.452
149   L         0.080   0.058   0.081  -0.111  -0.135  -0.075  -0.193  -0.217  -0.176
150   N        -0.456  -0.509  -0.474  -0.615  -0.680  -0.617  -0.572  -0.618  -0.555
151   L         1.221   1.277   1.061   1.178   1.245   0.998   1.321   1.409   1.013
152   L         1.941   1.954   2.075   1.788   1.805   2.006   2.205   2.226   2.452
153   Q        -1.243  -1.224  -1.254  -0.768  -0.745  -0.793  -0.950  -0.931  -0.927
154   E         0.080   0.061   0.094  -0.177  -0.192  -0.139  -0.193  -0.203  -0.153
155   L        -0.109  -0.174  -0.332  -0.002  -0.086  -0.274  -0.067  -0.154  -0.360
156   N         1.941   1.954   2.075   1.843   1.863   2.062   2.205   2.226   2.452
157   Q        -0.109  -0.077  -0.328   0.270   0.306  -0.070  -0.067  -0.026  -0.355
158   A        -0.581  -0.550  -0.512  -0.834  -0.795  -0.758  -0.698  -0.666  -0.598
159   E         0.536   0.439   0.246   0.729   0.596   0.331   0.564   0.419   0.105
160   L        -0.375  -0.450  -0.446  -0.463  -0.559  -0.541  -0.446  -0.531  -0.517
161   N         0.867   0.914   0.894   0.580   0.658   0.588   0.690   0.774   0.680
162   Q        -0.581  -0.609  -0.528  -0.603  -0.682  -0.574  -0.698  -0.723  -0.614
163   M        -0.375  -0.421  -0.449  -0.171  -0.225  -0.307  -0.446  -0.488  -0.516
164   S         1.941   1.954   2.075   1.780   1.799   1.998   2.205   2.226   2.452
165   A         0.617   0.631   0.752   0.329   0.343   0.532   0.185   0.205   0.379
166   S        -0.375  -0.291  -0.407  -0.345  -0.216  -0.423  -0.446  -0.335  -0.463
167   I         0.617   0.630   0.752   0.255   0.270   0.456   0.185   0.204   0.378
168   G        -0.706  -0.589  -0.809  -0.629  -0.454  -0.795  -0.572  -0.435  -0.671
169   G         1.941   1.954   2.075   2.184   2.198   2.406   2.205   2.226   2.452
170   E        -1.368  -1.321  -1.285  -1.387  -1.361  -1.256  -1.077  -1.035  -0.958
171   T         1.221   1.239   1.056   1.373   1.394   1.148   1.321   1.349   1.002
172   E        -0.706  -0.689  -0.571  -0.812  -0.773  -0.620  -0.824  -0.803  -0.659
173   I        -0.456  -0.445  -0.445  -0.562  -0.554  -0.554  -0.572  -0.555  -0.525
174   V         0.080   0.129   0.097  -0.212  -0.150  -0.167  -0.193  -0.135  -0.153
175   N        -0.912  -0.932  -0.882  -0.913  -0.926  -0.872  -0.824  -0.837  -0.755
176   P        -0.912  -0.939  -0.923  -0.743  -0.782  -0.771  -0.824  -0.850  -0.800
177   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
178   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
179   E        -1.699  -1.703  -1.623  -1.603  -1.626  -1.540  -1.203  -1.201  -1.092
180   S        -0.375  -0.306  -0.406  -0.470  -0.383  -0.492  -0.446  -0.366  -0.468
181   E         0.867   0.855   0.839   0.799   0.773   0.706   0.690   0.661   0.564
182   E        -0.109  -0.081  -0.316   0.091   0.126  -0.222  -0.067  -0.031  -0.339
183   S        -0.912  -0.908  -0.924  -0.881  -0.883  -0.826  -0.824  -0.824  -0.800
184   K        -0.912  -0.924  -0.905  -0.848  -0.849  -0.839  -0.824  -0.828  -0.782
185   Y         0.678   0.690   0.780   0.717   0.737   0.860   0.312   0.329   0.438
186   Y         0.222   0.175   0.143   0.391   0.321   0.247   0.059  -0.008  -0.073
187   K        -0.375  -0.402  -0.450  -0.293  -0.334  -0.397  -0.446  -0.491  -0.523
188   D        -1.037  -0.997  -0.952  -1.141  -1.082  -0.982  -0.950  -0.912  -0.828
189   L         0.116   0.112   0.079  -0.087  -0.117  -0.130  -0.103  -0.135  -0.170
190   I         0.222   0.292   0.166   0.336   0.465   0.229   0.059   0.173  -0.031
191   L         1.221   1.180   1.047   1.146   1.093   0.912   1.321   1.252   0.985
192   K        -0.456  -0.442  -0.462  -0.591  -0.572  -0.565  -0.572  -0.555  -0.542
193   A        -0.581  -0.554  -0.516  -0.800  -0.764  -0.700  -0.698  -0.673  -0.602
194   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
195   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
196   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
197   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
198   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
199   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
200   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
201   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
202   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
203   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
204   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
205   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
206   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
207   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
208   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
209   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
210   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
211   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
212   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
213   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
214   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
215   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
216   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
217   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
218   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
219   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
220   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
221   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
222   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
223   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
224   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
225   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
226   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
227   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
228   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
229   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
230   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
231   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
232   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
233   N        -0.706  -0.726  -0.858  -0.589  -0.622  -0.809  -0.572  -0.596  -0.725
234   P        -0.706  -0.726  -0.858  -0.327  -0.353  -0.563  -0.572  -0.596  -0.725
235   D        -0.375  -0.421  -0.449  -0.200  -0.261  -0.305  -0.446  -0.488  -0.516
236   A        -0.109  -0.170  -0.353   0.139   0.049  -0.238  -0.067  -0.149  -0.387
237   K         0.080   0.138   0.117  -0.108  -0.020  -0.054  -0.193  -0.120  -0.130
238   A        -1.368  -1.325  -1.296  -1.126  -1.056  -0.987  -1.077  -1.037  -0.966
239   F         0.678   0.691   0.781   0.697   0.718   0.848   0.312   0.331   0.441
240   I         0.867   0.814   0.827   0.857   0.759   0.728   0.690   0.581   0.538
241   F        -0.912  -0.869  -0.882  -0.876  -0.798  -0.834  -0.824  -0.772  -0.759
242   E        -0.581  -0.573  -0.512  -0.561  -0.559  -0.481  -0.698  -0.688  -0.598
243   K        -0.912  -0.921  -0.902  -0.725  -0.755  -0.696  -0.824  -0.836  -0.779
244   N        -0.125  -0.131  -0.009  -0.402  -0.408  -0.224  -0.446  -0.452  -0.294
245   T        -0.912  -0.976  -0.910  -0.902  -0.970  -0.893  -0.824  -0.877  -0.787
246   A        -0.044  -0.033   0.028  -0.121  -0.102  -0.026  -0.319  -0.307  -0.238
247   V        -0.125  -0.122  -0.017  -0.467  -0.465  -0.312  -0.446  -0.441  -0.305
248   V        -0.456  -0.450  -0.442  -0.509  -0.509  -0.471  -0.572  -0.562  -0.521
249   K        -0.375  -0.409  -0.433  -0.403  -0.443  -0.523  -0.446  -0.474  -0.496
250   V         0.678   0.689   0.775   0.447   0.463   0.584   0.312   0.327   0.428
251   R        -0.375  -0.422  -0.429  -0.258  -0.310  -0.316  -0.446  -0.493  -0.498
252   I         0.536   0.435   0.271   0.769   0.632   0.380   0.564   0.412   0.145
253   D        -1.368  -1.360  -1.282  -1.280  -1.259  -1.167  -1.077  -1.065  -0.956
254   N        -1.037  -1.027  -0.939  -1.304  -1.284  -1.171  -0.950  -0.937  -0.818
255   A        -0.044  -0.040   0.028  -0.067  -0.082   0.020  -0.319  -0.317  -0.238
256   R         0.678   0.663   0.757   0.534   0.512   0.654   0.312   0.272   0.390
257   V         0.678   0.672   0.762   0.447   0.432   0.562   0.312   0.291   0.400
258   S        -0.375  -0.427  -0.428  -0.387  -0.435  -0.447  -0.446  -0.497  -0.492
259   N         0.536   0.504   0.283   0.747   0.705   0.355   0.564   0.515   0.164
260   N        -1.368  -1.408  -1.315  -1.349  -1.375  -1.242  -1.077  -1.102  -0.981
261   E        -0.375  -0.454  -0.452  -0.299  -0.410  -0.407  -0.446  -0.536  -0.526
262   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
263   N         1.158   1.097   0.998   1.152   1.077   0.956   1.216   1.109   0.889
264   R         0.116   0.095   0.105  -0.010  -0.037  -0.023  -0.103  -0.123  -0.127
265   T         0.637   0.672   0.773   0.348   0.415   0.556   0.227   0.293   0.423
266   M        -1.018  -0.950  -0.952  -0.886  -0.775  -0.789  -0.927  -0.860  -0.825
267   F        -1.774  -1.751  -1.640  -1.622  -1.586  -1.436  -1.257  -1.235  -1.103
268   L         0.116   0.080   0.081   0.261   0.201   0.189  -0.103  -0.174  -0.168
269   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
270   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
271   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
272   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
273   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
274   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
275   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
276   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
277   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
278   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
279   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
280   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
281   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
282   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
283   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
284   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
285   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
286   K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
287   G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
288   K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
289   S        -1.480  -1.459  -1.346  -1.435  -1.385  -1.247  -1.161  -1.139  -1.005
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/Q06608
Output conservation file - output/Q06608
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
