1     M         1.359   1.360   1.374   1.470   1.472   1.495   1.425   1.427   1.443
2     I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
3     L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
4     L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
5     K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
6     R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
7     T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
8     K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
9     I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
10    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
11    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
12    V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
13    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
14    V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
15    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
16    F        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
17    V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
18    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
19    L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
20    Q        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
21    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
22    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
23    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
24    H        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
25    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
26    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
27    L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
28    V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
29    N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
30    P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
31    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
32    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
33    Q        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
34    Q        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
35    H        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
36    Q        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
37    Q        -0.295  -0.294  -0.273  -0.443  -0.440  -0.405  -0.479  -0.476  -0.442
38    I        -0.295  -0.294  -0.273  -0.170  -0.167  -0.134  -0.479  -0.476  -0.442
39    T        -0.295  -0.294  -0.273  -0.454  -0.452  -0.417  -0.479  -0.476  -0.442
40    K         1.359   1.360   1.374   1.123   1.126   1.150   1.425   1.427   1.443
41    Q        -1.262  -1.259  -1.236  -1.266  -1.271  -1.223  -1.113  -1.108  -1.071
42    R        -0.160  -0.146  -0.210  -0.291  -0.265  -0.404  -0.267  -0.246  -0.343
43    S        -1.262  -1.259  -1.236  -1.077  -1.071  -1.034  -1.113  -1.108  -1.071
44    S        -1.262  -1.259  -1.236  -1.131  -1.120  -1.088  -1.113  -1.108  -1.071
45    K        -1.262  -1.259  -1.236  -1.307  -1.298  -1.264  -1.113  -1.108  -1.071
46    I        -0.160  -0.146  -0.210   0.046   0.069  -0.046  -0.267  -0.246  -0.343
47    L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
48    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
49    N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
50    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
51    H        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
52    F        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
53    Y        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
54    D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
55    F        -0.160  -0.146  -0.210   0.052   0.077  -0.040  -0.267  -0.246  -0.343
56    R         1.359   1.360   1.374   1.406   1.405   1.431   1.425   1.427   1.443
57    S        -1.262  -1.259  -1.236  -1.266  -1.269  -1.223  -1.113  -1.108  -1.071
58    L         1.359   1.360   1.374   1.234   1.237   1.261   1.425   1.427   1.443
59    P         1.359   1.360   1.374   1.261   1.265   1.287   1.425   1.427   1.443
60    K        -0.160  -0.146  -0.210  -0.429  -0.404  -0.501  -0.267  -0.246  -0.343
61    V         1.359   1.360   1.374   1.470   1.468   1.495   1.425   1.427   1.443
62    P         1.359   1.360   1.374   1.261   1.265   1.287   1.425   1.427   1.443
63    T        -0.160  -0.191  -0.213  -0.046  -0.093  -0.138  -0.267  -0.314  -0.347
64    T         1.359   1.360   1.374   1.496   1.504   1.520   1.425   1.427   1.443
65    Q        -0.160  -0.135  -0.205  -0.057  -0.022  -0.119  -0.267  -0.229  -0.335
66    Y        -0.160  -0.146  -0.210   0.000   0.020  -0.076  -0.267  -0.246  -0.343
67    L         1.359   1.360   1.374   1.234   1.237   1.261   1.425   1.427   1.443
68    E        -0.160  -0.146  -0.210  -0.134  -0.116  -0.203  -0.267  -0.246  -0.343
69    A        -1.262  -1.259  -1.236  -1.162  -1.153  -1.119  -1.113  -1.108  -1.071
70    R        -0.160  -0.146  -0.210  -0.057  -0.038  -0.127  -0.267  -0.246  -0.343
71    E        -0.160  -0.191  -0.213  -0.297  -0.359  -0.401  -0.267  -0.314  -0.347
72    L         1.359   1.360   1.374   1.234   1.237   1.261   1.425   1.427   1.443
73    T        -0.160  -0.191  -0.213  -0.075  -0.123  -0.172  -0.267  -0.314  -0.347
74    R        -1.262  -1.259  -1.236  -1.154  -1.156  -1.112  -1.113  -1.108  -1.071
75    D         1.359   1.360   1.374   1.634   1.637   1.658   1.425   1.427   1.443
76    I        -0.160  -0.191  -0.213   0.046  -0.008  -0.051  -0.267  -0.314  -0.347
77    L         1.359   1.360   1.374   1.234   1.237   1.261   1.425   1.427   1.443
78    Y        -0.160  -0.146  -0.210   0.000   0.020  -0.076  -0.267  -0.246  -0.343
79    S        -0.160  -0.191  -0.213  -0.128  -0.177  -0.215  -0.267  -0.314  -0.347
80    G         1.359   1.360   1.374   1.406   1.408   1.431   1.425   1.427   1.443
81    Y         1.359   1.360   1.374   1.483   1.482   1.507   1.425   1.427   1.443
82    R         1.359   1.360   1.374   1.406   1.405   1.431   1.425   1.427   1.443
83    P         1.359   1.360   1.374   1.261   1.265   1.287   1.425   1.427   1.443
84    V        -0.160  -0.135  -0.205   0.046   0.086  -0.036  -0.267  -0.229  -0.335
85    M        -1.262  -1.259  -1.236  -1.250  -1.257  -1.207  -1.113  -1.108  -1.071
86    Y        -0.160  -0.146  -0.210  -0.087  -0.066  -0.179  -0.267  -0.246  -0.343
87    P         1.359   1.360   1.374   1.261   1.265   1.287   1.425   1.427   1.443
88    V        -1.262  -1.259  -1.236  -1.250  -1.245  -1.207  -1.113  -1.108  -1.071
89    K        -0.160  -0.135  -0.205  -0.291  -0.244  -0.392  -0.267  -0.229  -0.335
90    E        -0.160  -0.146  -0.210  -0.110  -0.095  -0.175  -0.267  -0.246  -0.343
91    N         1.359   1.360   1.374   1.470   1.473   1.495   1.425   1.427   1.443
92    P         1.359   1.360   1.374   1.261   1.265   1.287   1.425   1.427   1.443
93    L         1.359   1.360   1.374   1.234   1.237   1.261   1.425   1.427   1.443
94    F        -0.160  -0.191  -0.213  -0.057  -0.115  -0.175  -0.267  -0.314  -0.347
95    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
96    R        -1.262  -1.259  -1.236  -0.905  -0.890  -0.864  -1.113  -1.108  -1.071
97    D        -1.262  -1.259  -1.236  -0.978  -0.977  -0.937  -1.113  -1.108  -1.071
98    K        -0.160  -0.191  -0.213  -0.397  -0.438  -0.467  -0.267  -0.314  -0.347
99    -         1.359   1.360   1.374   1.390   1.393   1.415   1.425   1.427   1.443
100   K        -0.160  -0.191  -0.213  -0.429  -0.474  -0.505  -0.267  -0.314  -0.347
101   R        -0.160  -0.135  -0.205  -0.218  -0.183  -0.293  -0.267  -0.229  -0.335
102   K        -1.262  -1.259  -1.236  -1.460  -1.433  -1.415  -1.113  -1.108  -1.071
103   S        -1.262  -1.259  -1.236  -1.069  -1.053  -1.027  -1.113  -1.108  -1.071
104   L        -1.262  -1.259  -1.236  -1.242  -1.236  -1.199  -1.113  -1.108  -1.071
105   Q        -1.262  -1.259  -1.236  -1.084  -1.083  -1.042  -1.113  -1.108  -1.071
106   T        -0.295  -0.294  -0.273  -0.365  -0.362  -0.327  -0.479  -0.476  -0.442
107   L        -0.295  -0.294  -0.273  -0.523  -0.521  -0.485  -0.479  -0.476  -0.442
108   L        -0.295  -0.294  -0.273  -0.750  -0.747  -0.710  -0.479  -0.476  -0.442
109   T        -0.295  -0.294  -0.273  -0.310  -0.307  -0.273  -0.479  -0.476  -0.442
110   M        -0.295  -0.294  -0.273  -0.266  -0.263  -0.230  -0.479  -0.476  -0.442
111   N        -0.295  -0.294  -0.273  -0.299  -0.296  -0.262  -0.479  -0.476  -0.442
112   E        -0.160  -0.135  -0.205  -0.187  -0.147  -0.271  -0.267  -0.229  -0.335
113   K        -0.160  -0.191  -0.213  -0.461  -0.510  -0.543  -0.267  -0.314  -0.347
114   T        -1.262  -1.259  -1.236  -1.274  -1.264  -1.231  -1.113  -1.108  -1.071
115   N        -1.262  -1.259  -1.236  -1.366  -1.354  -1.322  -1.113  -1.108  -1.071
116   A        -1.262  -1.259  -1.236  -1.077  -1.070  -1.034  -1.113  -1.108  -1.071
117   E        -0.160  -0.146  -0.210  -0.353  -0.329  -0.463  -0.267  -0.246  -0.343
118   A        -0.160  -0.191  -0.213  -0.069  -0.127  -0.186  -0.267  -0.314  -0.347
119   K        -1.262  -1.259  -1.236  -1.154  -1.128  -1.112  -1.113  -1.108  -1.071
120   T        -1.262  -1.259  -1.236  -1.226  -1.227  -1.183  -1.113  -1.108  -1.071
121   I        -1.262  -1.259  -1.236  -1.170  -1.177  -1.127  -1.113  -1.108  -1.071
122   D        -0.160  -0.146  -0.210   0.052   0.077  -0.048  -0.267  -0.246  -0.343
123   E         1.359   1.360   1.374   1.340   1.338   1.366   1.425   1.427   1.443
124   K        -0.295  -0.294  -0.273  -0.646  -0.643  -0.607  -0.479  -0.476  -0.442
125   K        -0.160  -0.135  -0.205  -0.429  -0.379  -0.524  -0.267  -0.229  -0.335
126   H        -1.262  -1.259  -1.236  -1.031  -1.036  -0.989  -1.113  -1.108  -1.071
127   K        -1.262  -1.259  -1.236  -1.162  -1.149  -1.119  -1.113  -1.108  -1.071
128   N        -1.262  -1.259  -1.236  -1.316  -1.315  -1.272  -1.113  -1.108  -1.071
129   I        -1.262  -1.259  -1.236  -1.092  -1.097  -1.050  -1.113  -1.108  -1.071
130   L        -0.160  -0.146  -0.210  -0.285  -0.263  -0.358  -0.267  -0.246  -0.343
131   F        -1.262  -1.259  -1.236  -0.956  -0.952  -0.915  -1.113  -1.108  -1.071
132   G         1.359   1.360   1.374   1.406   1.408   1.431   1.425   1.427   1.443
133   E        -0.160  -0.135  -0.205  -0.322  -0.282  -0.398  -0.267  -0.229  -0.335
134   R        -1.262  -1.259  -1.236  -1.226  -1.229  -1.183  -1.113  -1.108  -1.071
135   G         1.359   1.360   1.374   1.406   1.408   1.431   1.425   1.427   1.443
136   T        -0.160  -0.191  -0.213  -0.075  -0.125  -0.172  -0.267  -0.314  -0.347
137   G         1.359   1.360   1.374   1.406   1.408   1.431   1.425   1.427   1.443
138   G         1.359   1.360   1.374   1.406   1.408   1.431   1.425   1.427   1.443
139   I         1.359   1.360   1.374   1.597   1.600   1.620   1.425   1.427   1.443
140   M        -1.262  -1.259  -1.236  -1.291  -1.284  -1.247  -1.113  -1.108  -1.071
141   S        -0.160  -0.191  -0.213  -0.116  -0.161  -0.201  -0.267  -0.314  -0.347
142   G        -0.160  -0.191  -0.213  -0.128  -0.178  -0.215  -0.267  -0.314  -0.347
143   G         1.359   1.360   1.374   1.406   1.408   1.431   1.425   1.427   1.443
144   V         1.359   1.360   1.374   1.470   1.468   1.495   1.425   1.427   1.443
145   N        -0.160  -0.191  -0.213  -0.098  -0.153  -0.194  -0.267  -0.314  -0.347
146   G        -0.160  -0.191  -0.213  -0.158  -0.211  -0.250  -0.267  -0.314  -0.347
147   T        -0.160  -0.191  -0.213  -0.046  -0.093  -0.138  -0.267  -0.314  -0.347
148   W         1.359   1.360   1.374   1.659   1.662   1.682   1.425   1.427   1.443
149   K        -0.295  -0.294  -0.273  -0.593  -0.591  -0.554  -0.479  -0.476  -0.442
150   Y        -0.160  -0.191  -0.213  -0.005  -0.054  -0.087  -0.267  -0.314  -0.347
151   N        -0.160  -0.191  -0.213   0.006  -0.040  -0.070  -0.267  -0.314  -0.347
152   P         1.359   1.360   1.374   1.261   1.265   1.287   1.425   1.427   1.443
153   T        -1.262  -1.259  -1.236  -1.170  -1.164  -1.127  -1.113  -1.108  -1.071
154   V        -1.262  -1.259  -1.236  -1.242  -1.252  -1.199  -1.113  -1.108  -1.071
155   P        -0.160  -0.191  -0.213  -0.260  -0.309  -0.339  -0.267  -0.314  -0.347
156   N        -0.160  -0.191  -0.213  -0.230  -0.292  -0.352  -0.267  -0.314  -0.347
157   E        -1.262  -1.259  -1.236  -1.567  -1.562  -1.521  -1.113  -1.108  -1.071
158   L        -0.160  -0.191  -0.213  -0.316  -0.365  -0.399  -0.267  -0.314  -0.347
159   L         1.359   1.360   1.374   1.234   1.237   1.261   1.425   1.427   1.443
160   P        -0.295  -0.294  -0.273  -0.443  -0.440  -0.405  -0.479  -0.476  -0.442
161   F        -0.295  -0.294  -0.273  -0.332  -0.329  -0.295  -0.479  -0.476  -0.442
162   N        -0.295  -0.294  -0.273  -0.234  -0.231  -0.197  -0.479  -0.476  -0.442
163   W        -0.295  -0.294  -0.273  -0.343  -0.340  -0.305  -0.479  -0.476  -0.442
164   W         1.359   1.360   1.374   1.659   1.662   1.682   1.425   1.427   1.443
165   S         1.359   1.360   1.374   1.406   1.410   1.431   1.425   1.427   1.443
166   T        -1.262  -1.259  -1.236  -1.123  -1.115  -1.080  -1.113  -1.108  -1.071
167   S         1.359   1.360   1.374   1.406   1.410   1.431   1.425   1.427   1.443
168   S        -1.262  -1.259  -1.236  -1.001  -0.987  -0.959  -1.113  -1.108  -1.071
169   M         1.359   1.360   1.374   1.470   1.472   1.495   1.425   1.427   1.443
170   G         1.359   1.360   1.374   1.406   1.408   1.431   1.425   1.427   1.443
171   M         1.359   1.360   1.374   1.470   1.472   1.495   1.425   1.427   1.443
172   E         1.359   1.360   1.374   1.340   1.338   1.366   1.425   1.427   1.443
173   Y        -0.160  -0.146  -0.210   0.000   0.020  -0.076  -0.267  -0.246  -0.343
174   F        -0.160  -0.135  -0.205   0.000   0.036  -0.067  -0.267  -0.229  -0.335
175   P         1.359   1.360   1.374   1.261   1.265   1.287   1.425   1.427   1.443
176   E         1.359   1.360   1.374   1.340   1.338   1.366   1.425   1.427   1.443
177   W         1.359   1.360   1.374   1.672   1.677   1.695   1.425   1.427   1.443
178   K        -1.262  -1.259  -1.236  -1.408  -1.399  -1.364  -1.113  -1.108  -1.071
179   N        -1.262  -1.259  -1.236  -1.218  -1.225  -1.175  -1.113  -1.108  -1.071
180   V         1.359   1.360   1.374   1.470   1.468   1.495   1.425   1.427   1.443
181   P         1.359   1.360   1.374   1.261   1.265   1.287   1.425   1.427   1.443
182   P        -1.262  -1.259  -1.236  -1.274  -1.267  -1.231  -1.113  -1.108  -1.071
183   Y        -1.262  -1.259  -1.236  -1.210  -1.193  -1.167  -1.113  -1.108  -1.071
184   M        -0.160  -0.135  -0.205  -0.069  -0.034  -0.146  -0.267  -0.229  -0.335
185   M        -1.262  -1.259  -1.236  -1.146  -1.143  -1.104  -1.113  -1.108  -1.071
186   R        -1.262  -1.259  -1.236  -1.291  -1.295  -1.247  -1.113  -1.108  -1.071
187   K        -1.262  -1.259  -1.236  -1.408  -1.393  -1.364  -1.113  -1.108  -1.071
188   L        -0.160  -0.191  -0.213  -0.224  -0.266  -0.289  -0.267  -0.314  -0.347
189   K         1.359   1.360   1.374   1.113   1.120   1.140   1.425   1.427   1.443
190   P         1.359   1.360   1.374   1.261   1.265   1.287   1.425   1.427   1.443
191   F        -0.160  -0.135  -0.205   0.000   0.036  -0.067  -0.267  -0.229  -0.335
192   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
193   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
194   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
195   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
196   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
197   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
198   D         1.359   1.360   1.374   1.585   1.588   1.609   1.425   1.427   1.443
199   K         1.359   1.360   1.374   1.123   1.126   1.150   1.425   1.427   1.443
200   A        -0.295  -0.294  -0.273  -0.500  -0.497  -0.462  -0.479  -0.476  -0.442
201   L        -0.295  -0.294  -0.273  -0.432  -0.429  -0.394  -0.479  -0.476  -0.442
202   Q        -0.295  -0.294  -0.273  -0.343  -0.340  -0.305  -0.479  -0.476  -0.442
203   M        -0.295  -0.294  -0.273  -0.432  -0.429  -0.394  -0.479  -0.476  -0.442
204   R        -0.295  -0.294  -0.273  -0.593  -0.591  -0.554  -0.479  -0.476  -0.442
205   L        -0.295  -0.294  -0.273  -0.432  -0.429  -0.394  -0.479  -0.476  -0.442
206   T        -0.295  -0.294  -0.273  -0.454  -0.452  -0.417  -0.479  -0.476  -0.442
207   H        -0.295  -0.294  -0.273  -0.266  -0.263  -0.230  -0.479  -0.476  -0.442
208   K         1.359   1.360   1.374   1.123   1.126   1.150   1.425   1.427   1.443
209   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
210   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
211   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
212   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
213   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
214   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
215   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
216   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
217   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
218   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
219   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
220   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
221   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
222   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
223   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
224   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
225   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
226   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
227   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
228   -         1.359   1.360   1.374   1.259   1.263   1.285   1.425   1.427   1.443
229   -        -0.295  -0.294  -0.273  -0.367  -0.364  -0.329  -0.479  -0.476  -0.442
230   -        -0.295  -0.294  -0.273  -0.447  -0.445  -0.410  -0.479  -0.476  -0.442
231   S        -1.262  -1.259  -1.236  -1.266  -1.269  -1.223  -1.113  -1.108  -1.071
232   K        -1.262  -1.259  -1.236  -1.226  -1.212  -1.183  -1.113  -1.108  -1.071
233   K        -0.160  -0.146  -0.210  -0.297  -0.274  -0.346  -0.267  -0.246  -0.343
234   K         1.359   1.360   1.374   1.113   1.120   1.140   1.425   1.427   1.443
235   M        -1.262  -1.259  -1.236  -1.250  -1.242  -1.207  -1.113  -1.108  -1.071
236   K        -0.160  -0.191  -0.213  -0.397  -0.441  -0.467  -0.267  -0.314  -0.347
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/Q06524
Output conservation file - output/Q06524
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
