1     M         2.124   2.128   2.219   2.343   2.349   2.492   2.385   2.391   2.540
2     R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
3     S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
4     S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
5     V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
6     Y        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
7     S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
8     E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
9     N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
10    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
11    Y        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
12    N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
13    C        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
14    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
15    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
16    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
17    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
18    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
19    E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
20    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
21    H        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
22    L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
23    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
24    E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
25    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
26    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
27    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
28    V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
29    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
30    M        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
31    A        -0.682  -0.679  -0.622  -0.782  -0.766  -0.691  -0.736  -0.732  -0.654
32    P         0.019  -0.016   0.028  -0.115  -0.165  -0.102  -0.216  -0.267  -0.211
33    M         0.019  -0.016   0.028   0.002  -0.054   0.008  -0.216  -0.267  -0.211
34    F        -0.682  -0.679  -0.622  -0.635  -0.630  -0.541  -0.736  -0.732  -0.654
35    Q         0.019  -0.016   0.028  -0.117  -0.164  -0.105  -0.216  -0.267  -0.211
36    H        -0.011   0.003   0.026  -0.045  -0.021   0.013  -0.278  -0.260  -0.224
37    F         0.201   0.237   0.139   0.167   0.232   0.023   0.054   0.110  -0.045
38    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
39    L         1.111   1.131   1.033   0.833   0.859   0.721   1.053   1.089   0.879
40    N        -0.573  -0.592  -0.557  -0.527  -0.563  -0.510  -0.611  -0.634  -0.581
41    L        -1.134  -1.132  -1.079  -1.152  -1.133  -1.068  -0.944  -0.942  -0.866
42    C        -1.134  -1.132  -1.079  -1.158  -1.150  -1.074  -0.944  -0.942  -0.866
43    V        -0.573  -0.540  -0.552  -0.799  -0.760  -0.751  -0.611  -0.571  -0.574
44    E        -0.011  -0.031   0.024  -0.188  -0.210  -0.131  -0.278  -0.301  -0.226
45    K        -1.134  -1.132  -1.079  -0.976  -0.970  -0.888  -0.944  -0.942  -0.866
46    F         1.111   1.071   1.033   1.225   1.162   1.094   1.053   0.981   0.879
47    P         1.111   1.140   1.043   1.349   1.393   1.242   1.053   1.104   0.897
48    E        -1.134  -1.132  -1.079  -1.340  -1.323  -1.259  -0.944  -0.942  -0.866
49    S        -1.134  -1.132  -1.079  -1.042  -1.033  -0.956  -0.944  -0.942  -0.866
50    I         0.986   0.990   0.962   1.031   1.038   0.990   0.824   0.832   0.742
51    E        -0.682  -0.682  -0.622  -0.746  -0.744  -0.655  -0.736  -0.735  -0.654
52    H         0.019   0.023   0.045   0.014   0.021   0.046  -0.216  -0.210  -0.186
53    K         0.019   0.020   0.037  -0.102  -0.101  -0.076  -0.216  -0.214  -0.198
54    D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
55    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
56    D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
57    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
58    N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
59    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
60    N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
61    F        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
62    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
63    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
64    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
65    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
66    L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
67    E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
68    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
69    E         0.019   0.009   0.039  -0.165  -0.181  -0.153  -0.216  -0.230  -0.195
70    I         0.019   0.009   0.039  -0.039  -0.055  -0.021  -0.216  -0.230  -0.195
71    I        -0.682  -0.682  -0.622  -0.972  -0.966  -0.884  -0.736  -0.734  -0.654
72    Y         0.019   0.032   0.048  -0.073  -0.051  -0.036  -0.216  -0.196  -0.181
73    I         0.019   0.013   0.037  -0.228  -0.247  -0.240  -0.216  -0.225  -0.198
74    P        -0.682  -0.682  -0.622  -0.528  -0.523  -0.432  -0.736  -0.734  -0.654
75    E        -0.682  -0.682  -0.622  -0.873  -0.862  -0.784  -0.736  -0.734  -0.654
76    D         0.721   0.723   0.799   0.482   0.484   0.595   0.304   0.307   0.412
77    D         0.986   0.966   0.959   0.909   0.869   0.811   0.824   0.786   0.735
78    T        -0.682  -0.682  -0.622  -0.701  -0.698  -0.609  -0.736  -0.734  -0.654
79    D         0.019   0.009   0.039   0.039   0.019   0.062  -0.216  -0.230  -0.195
80    S        -0.682  -0.682  -0.622  -0.905  -0.901  -0.817  -0.736  -0.734  -0.654
81    I        -0.682  -0.682  -0.622  -0.887  -0.882  -0.798  -0.736  -0.734  -0.654
82    D         0.019   0.030   0.050  -0.047  -0.026  -0.013  -0.216  -0.199  -0.178
83    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
84    V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
85    D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
86    S        -1.035  -1.063  -1.019  -0.852  -0.903  -0.825  -0.852  -0.879  -0.811
87    L        -0.567  -0.555  -0.551  -0.648  -0.629  -0.611  -0.621  -0.608  -0.580
88    K        -0.391  -0.356  -0.457  -0.342  -0.286  -0.439  -0.389  -0.344  -0.461
89    C        -0.391  -0.324  -0.441  -0.319  -0.211  -0.407  -0.389  -0.306  -0.441
90    I        -1.503  -1.497  -1.453  -1.140  -1.135  -1.056  -1.083  -1.078  -1.008
91    N        -1.503  -1.497  -1.453  -1.532  -1.541  -1.455  -1.083  -1.078  -1.008
92    Y        -1.035  -1.063  -1.019  -0.961  -0.994  -0.927  -0.852  -0.879  -0.811
93    K        -1.503  -1.497  -1.453  -1.236  -1.241  -1.153  -1.083  -1.078  -1.008
94    L        -1.503  -1.497  -1.453  -1.594  -1.589  -1.518  -1.083  -1.078  -1.008
95    H         2.124   2.128   2.219   2.313   2.318   2.462   2.385   2.391   2.540
96    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
97    S        -1.035  -1.031  -1.018  -0.925  -0.921  -0.890  -0.852  -0.848  -0.810
98    R        -1.035  -1.073  -1.031  -0.956  -1.022  -0.981  -0.852  -0.887  -0.823
99    G        -1.035  -1.020  -1.022  -0.842  -0.817  -0.832  -0.852  -0.836  -0.813
100   D        -0.391  -0.400  -0.449  -0.360  -0.365  -0.457  -0.389  -0.401  -0.451
101   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
102   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
103   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
104   Q        -1.035  -1.041  -1.022  -0.830  -0.843  -0.805  -0.852  -0.857  -0.814
105   V        -1.035  -1.043  -1.024  -1.004  -1.015  -0.993  -0.852  -0.859  -0.816
106   L         1.212   1.277   1.111   0.945   1.030   0.799   1.229   1.338   1.026
107   D        -1.035  -1.051  -1.022  -0.810  -0.833  -0.783  -0.852  -0.867  -0.814
108   A        -1.035  -1.030  -1.021  -0.944  -0.930  -0.914  -0.852  -0.845  -0.813
109   C         0.368   0.390   0.247   0.639   0.660   0.420   0.304   0.335   0.119
110   V        -0.391  -0.341  -0.454  -0.620  -0.552  -0.705  -0.389  -0.327  -0.457
111   Q        -1.035  -1.051  -1.022  -0.937  -0.952  -0.937  -0.852  -0.867  -0.814
112   L         1.212   1.148   1.099   0.945   0.855   0.781   1.229   1.119   1.004
113   I         0.077   0.068   0.077  -0.101  -0.115  -0.131  -0.158  -0.162  -0.155
114   D         0.077   0.095   0.071  -0.045  -0.021  -0.071  -0.158  -0.141  -0.163
115   K        -0.567  -0.518  -0.547  -0.533  -0.449  -0.494  -0.621  -0.569  -0.576
116   H         1.212   1.204   1.108   1.386   1.374   1.248   1.229   1.215   1.020
117   L         1.212   1.233   1.094   0.977   1.003   0.824   1.229   1.265   0.995
118   G        -0.391  -0.393  -0.465  -0.308  -0.313  -0.452  -0.389  -0.393  -0.470
119   A        -1.035  -1.032  -1.022  -0.762  -0.754  -0.740  -0.852  -0.850  -0.814
120   K        -0.100  -0.096  -0.032  -0.526  -0.501  -0.432  -0.389  -0.384  -0.299
121   Y         2.124   2.128   2.219   2.193   2.202   2.339   2.385   2.391   2.540
122   R        -0.567  -0.518  -0.547  -0.621  -0.555  -0.586  -0.621  -0.569  -0.576
123   R        -1.503  -1.497  -1.453  -1.511  -1.514  -1.433  -1.083  -1.078  -1.008
124   A        -0.391  -0.413  -0.456  -0.219  -0.254  -0.303  -0.389  -0.418  -0.459
125   S        -0.391  -0.363  -0.461  -0.295  -0.254  -0.405  -0.389  -0.356  -0.466
126   R        -1.134  -1.128  -1.079  -1.016  -1.020  -0.929  -0.944  -0.938  -0.866
127   I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
128   M        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
129   Y         0.368   0.422   0.232   0.429   0.522   0.185   0.304   0.386   0.095
130   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
131   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
132   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
133   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
134   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
135   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
136   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
137   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
138   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
139   G         1.212   1.277   1.111   1.372   1.456   1.228   1.229   1.338   1.026
140   N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
141   R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
142   K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
143   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
144   W         2.124   2.128   2.219   2.427   2.432   2.578   2.385   2.391   2.540
145   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
146   K         0.368   0.329   0.229   0.433   0.378   0.222   0.304   0.246   0.091
147   A        -1.035  -1.055  -1.016  -0.923  -0.957  -0.889  -0.852  -0.871  -0.808
148   N        -0.391  -0.393  -0.465  -0.249  -0.250  -0.376  -0.389  -0.393  -0.470
149   K         2.124   2.128   2.219   2.105   2.113   2.250   2.385   2.391   2.540
150   L        -0.391  -0.418  -0.452  -0.572  -0.597  -0.643  -0.389  -0.424  -0.454
151   A        -0.567  -0.598  -0.547  -0.660  -0.691  -0.616  -0.621  -0.650  -0.577
152   E         2.124   2.128   2.219   2.070   2.080   2.213   2.385   2.391   2.540
153   M         2.124   2.128   2.219   2.343   2.349   2.492   2.385   2.391   2.540
154   K        -1.035  -1.030  -1.021  -1.243  -1.234  -1.204  -0.852  -0.845  -0.813
155   S        -1.035  -1.073  -1.031  -0.935  -0.980  -0.913  -0.852  -0.887  -0.823
156   A        -1.035  -1.021  -1.017  -0.918  -0.904  -0.877  -0.852  -0.838  -0.809
157   G         0.368   0.329   0.229   0.525   0.465   0.303   0.304   0.246   0.091
158   L         1.212   1.176   1.104   0.977   0.929   0.837   1.229   1.167   1.013
159   V         0.077   0.091   0.077  -0.037  -0.015  -0.045  -0.158  -0.139  -0.154
160   Y         2.124   2.128   2.219   2.193   2.202   2.339   2.385   2.391   2.540
161   V         0.721   0.723   0.799   0.492   0.493   0.607   0.304   0.307   0.411
162   C        -0.567  -0.608  -0.556  -0.291  -0.361  -0.277  -0.621  -0.659  -0.586
163   Y        -0.391  -0.379  -0.458  -0.359  -0.354  -0.493  -0.389  -0.376  -0.461
164   W        -0.100  -0.095  -0.031  -0.060  -0.045   0.045  -0.389  -0.382  -0.297
165   -        -0.573  -0.583  -0.554  -0.670  -0.685  -0.643  -0.611  -0.624  -0.577
166   -         0.019   0.017   0.045  -0.063  -0.065  -0.024  -0.216  -0.219  -0.186
167   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
168   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
169   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
170   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
171   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
172   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
173   D        -0.567  -0.539  -0.545  -0.631  -0.582  -0.590  -0.621  -0.590  -0.575
174   N        -1.035  -1.043  -1.024  -0.887  -0.888  -0.871  -0.852  -0.859  -0.816
175   G        -1.035  -0.982  -1.014  -0.928  -0.830  -0.902  -0.852  -0.798  -0.807
176   V         0.077   0.109   0.083  -0.106  -0.060  -0.103  -0.158  -0.124  -0.144
177   L         0.368   0.281   0.232   0.164   0.041  -0.021   0.304   0.175   0.095
178   G        -0.391  -0.395  -0.449  -0.392  -0.411  -0.510  -0.389  -0.394  -0.451
179   A         0.368   0.327   0.243   0.475   0.403   0.257   0.304   0.244   0.112
180   F         2.124   2.128   2.219   2.236   2.242   2.383   2.385   2.391   2.540
181   T         0.077   0.089   0.076  -0.283  -0.266  -0.268  -0.158  -0.152  -0.156
182   S         2.124   2.128   2.219   2.140   2.141   2.286   2.385   2.391   2.540
183   F         1.212   1.148   1.099   1.373   1.283   1.205   1.229   1.119   1.004
184   M        -0.391  -0.379  -0.458  -0.149  -0.121  -0.272  -0.389  -0.376  -0.461
185   L         1.212   1.233   1.094   0.949   0.976   0.780   1.229   1.265   0.995
186   T         0.077   0.114   0.074   0.091   0.131   0.098  -0.158  -0.115  -0.158
187   E        -0.391  -0.393  -0.465  -0.372  -0.369  -0.488  -0.389  -0.393  -0.470
188   E        -0.391  -0.363  -0.461  -0.334  -0.284  -0.434  -0.389  -0.356  -0.466
189   T        -1.503  -1.497  -1.453  -1.490  -1.509  -1.412  -1.083  -1.078  -1.008
190   G        -0.567  -0.518  -0.547  -0.467  -0.404  -0.422  -0.621  -0.569  -0.576
191   L        -0.391  -0.363  -0.461  -0.569  -0.526  -0.651  -0.389  -0.356  -0.466
192   V        -0.567  -0.575  -0.548  -0.621  -0.630  -0.595  -0.621  -0.628  -0.577
193   E        -0.682  -0.682  -0.622  -0.890  -0.898  -0.801  -0.736  -0.734  -0.654
194   G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
195   D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
196   A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
197   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
198   H        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
199   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
200   V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
201   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
202   V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
203   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
204   V         0.836   0.817   0.850   0.805   0.772   0.823   0.535   0.498   0.516
205   I         0.836   0.817   0.865   0.373   0.341   0.405   0.535   0.497   0.547
206   Y         0.836   0.796   0.851   0.754   0.685   0.754   0.535   0.455   0.518
207   L         1.212   1.233   1.094   0.945   0.972   0.774   1.229   1.265   0.995
208   Y         1.212   1.277   1.111   1.345   1.437   1.204   1.229   1.338   1.026
209   E         2.124   2.128   2.219   2.070   2.080   2.213   2.385   2.391   2.540
210   V         1.212   1.204   1.108   1.335   1.322   1.181   1.229   1.215   1.020
211   H         0.836   0.829   0.850   0.907   0.896   0.913   0.535   0.521   0.517
212   V         0.077   0.059   0.081  -0.332  -0.356  -0.317  -0.158  -0.176  -0.146
213   A        -1.035  -1.043  -1.024  -0.759  -0.771  -0.739  -0.852  -0.859  -0.816
214   S        -1.503  -1.497  -1.453  -1.332  -1.330  -1.251  -1.083  -1.078  -1.008
215   A        -0.391  -0.341  -0.454  -0.324  -0.242  -0.412  -0.389  -0.327  -0.457
216   H        -0.391  -0.411  -0.468  -0.334  -0.370  -0.481  -0.389  -0.414  -0.474
217   R         0.077   0.105   0.073   0.171   0.206   0.179  -0.158  -0.124  -0.158
218   G         0.077   0.045   0.074  -0.008  -0.063  -0.021  -0.158  -0.199  -0.157
219   H        -0.567  -0.553  -0.547  -0.345  -0.328  -0.298  -0.621  -0.605  -0.576
220   G         0.077   0.122   0.086   0.005   0.089   0.023  -0.158  -0.087  -0.138
221   I         0.077   0.099   0.076  -0.321  -0.293  -0.313  -0.158  -0.126  -0.154
222   G         2.124   2.128   2.219   2.223   2.225   2.370   2.385   2.391   2.540
223   R        -0.567  -0.564  -0.550  -0.512  -0.507  -0.483  -0.621  -0.615  -0.580
224   R        -1.503  -1.497  -1.453  -1.313  -1.332  -1.232  -1.083  -1.078  -1.008
225   L         0.368   0.281   0.232   0.137   0.012  -0.059   0.304   0.175   0.095
226   L         0.077   0.062   0.075  -0.298  -0.315  -0.287  -0.158  -0.166  -0.155
227   E        -1.035  -1.073  -1.031  -0.982  -1.042  -0.989  -0.852  -0.887  -0.823
228   H        -1.035  -1.021  -1.017  -0.806  -0.785  -0.770  -0.852  -0.838  -0.809
229   A        -0.567  -0.555  -0.551  -0.657  -0.647  -0.610  -0.621  -0.608  -0.580
230   L         0.077   0.122   0.086  -0.255  -0.202  -0.236  -0.158  -0.087  -0.138
231   C         0.019   0.028   0.047   0.054   0.068   0.097  -0.216  -0.202  -0.183
232   D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
233   G        -1.035  -1.073  -1.031  -0.807  -0.842  -0.771  -0.852  -0.887  -0.823
234   V        -1.035  -1.073  -1.031  -0.991  -1.072  -1.003  -0.852  -0.887  -0.823
235   A        -0.391  -0.375  -0.455  -0.185  -0.164  -0.301  -0.389  -0.369  -0.459
236   R         0.368   0.461   0.249   0.537   0.672   0.345   0.304   0.442   0.121
237   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
238   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
239   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
240   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
241   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
242   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
243   H        -0.682  -0.679  -0.622  -0.635  -0.629  -0.541  -0.736  -0.732  -0.654
244   T         0.019   0.021   0.039  -0.104  -0.099  -0.089  -0.216  -0.214  -0.195
245   R        -0.682  -0.679  -0.622  -0.862  -0.869  -0.773  -0.736  -0.732  -0.654
246   R        -0.682  -0.679  -0.622  -0.710  -0.704  -0.618  -0.736  -0.732  -0.654
247   M         0.019   0.021   0.039  -0.354  -0.340  -0.324  -0.216  -0.214  -0.195
248   C         0.019  -0.016   0.028  -0.016  -0.069  -0.011  -0.216  -0.267  -0.211
249   D        -0.682  -0.679  -0.622  -0.688  -0.682  -0.595  -0.736  -0.732  -0.654
250   N        -0.391  -0.418  -0.452  -0.137  -0.182  -0.217  -0.389  -0.424  -0.454
251   F         0.721   0.723   0.799   0.259   0.263   0.366   0.304   0.307   0.411
252   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
253   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
254   F        -1.503  -1.497  -1.453  -1.142  -1.126  -1.058  -1.083  -1.078  -1.008
255   G         0.368   0.329   0.229   0.528   0.465   0.307   0.304   0.246   0.091
256   V         0.077   0.100   0.088   0.042   0.088   0.062  -0.158  -0.115  -0.135
257   A        -0.567  -0.537  -0.546  -0.572  -0.535  -0.537  -0.621  -0.587  -0.576
258   L         2.124   2.128   2.219   1.800   1.802   1.939   2.385   2.391   2.540
259   T         1.212   1.148   1.099   1.426   1.342   1.284   1.229   1.119   1.004
260   V         2.124   2.128   2.219   2.162   2.164   2.308   2.385   2.391   2.540
261   F         2.124   2.128   2.219   2.236   2.242   2.383   2.385   2.391   2.540
262   S         0.368   0.281   0.232   0.499   0.370   0.305   0.304   0.175   0.095
263   D         0.077   0.109   0.075   0.106   0.144   0.109  -0.158  -0.124  -0.157
264   N         2.124   2.128   2.219   2.219   2.222   2.366   2.385   2.391   2.540
265   T        -0.567  -0.575  -0.548  -0.808  -0.826  -0.775  -0.621  -0.628  -0.577
266   R        -1.035  -1.051  -1.022  -0.759  -0.790  -0.729  -0.852  -0.867  -0.814
267   A         2.124   2.128   2.219   2.301   2.302   2.449   2.385   2.391   2.540
268   R        -0.391  -0.466  -0.459  -0.534  -0.629  -0.604  -0.389  -0.482  -0.463
269   R         0.077   0.089   0.076   0.108   0.111   0.117  -0.158  -0.152  -0.156
270   L         0.077   0.079   0.070   0.022   0.005  -0.013  -0.158  -0.160  -0.163
271   Y         2.124   2.128   2.219   2.193   2.202   2.339   2.385   2.391   2.540
272   E        -1.035  -1.030  -1.021  -0.918  -0.899  -0.886  -0.852  -0.845  -0.813
273   A        -0.391  -0.429  -0.465  -0.250  -0.305  -0.345  -0.389  -0.436  -0.470
274   L         0.368   0.440   0.237   0.177   0.271   0.003   0.304   0.412   0.103
275   G         0.368   0.440   0.237   0.552   0.653   0.353   0.304   0.412   0.103
276   F         0.077   0.081   0.084   0.099   0.126   0.124  -0.158  -0.141  -0.140
277   Y        -1.035  -1.020  -1.022  -0.835  -0.796  -0.824  -0.852  -0.836  -0.813
278   R        -0.391  -0.411  -0.468  -0.519  -0.547  -0.597  -0.389  -0.414  -0.474
279   A         0.368   0.376   0.230   0.612   0.625   0.419   0.304   0.317   0.092
280   P        -0.567  -0.573  -0.550  -0.555  -0.550  -0.526  -0.621  -0.625  -0.580
281   G        -0.567  -0.537  -0.546  -0.634  -0.595  -0.599  -0.621  -0.587  -0.576
282   S         1.212   1.148   1.099   1.293   1.201   1.133   1.229   1.119   1.004
283   P         1.212   1.148   1.099   1.467   1.372   1.296   1.229   1.119   1.004
284   A        -1.503  -1.497  -1.453  -1.200  -1.205  -1.117  -1.083  -1.078  -1.008
285   P        -0.391  -0.429  -0.465  -0.193  -0.243  -0.303  -0.389  -0.436  -0.470
286   A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
287   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
288   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
289   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
290   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
291   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
292   T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
293   I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
294   R         0.762   0.756   0.815   0.592   0.578   0.650   0.387   0.376   0.445
295   H        -0.573  -0.563  -0.554  -0.562  -0.548  -0.528  -0.611  -0.599  -0.577
296   T        -0.011  -0.031   0.020  -0.354  -0.372  -0.297  -0.278  -0.301  -0.231
297   R         2.124   2.128   2.219   2.259   2.265   2.406   2.385   2.391   2.540
298   H         0.201   0.182   0.136   0.311   0.279   0.203   0.054   0.027  -0.050
299   G         1.111   1.124   1.044   1.208   1.224   1.095   1.053   1.076   0.901
300   G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
301   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
302   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
303   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
304   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
305   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
306   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
307   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
308   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
309   G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
310   R         0.077   0.122   0.086   0.063   0.141   0.075  -0.158  -0.087  -0.138
311   V         1.212   1.176   1.104   1.307   1.254   1.150   1.229   1.167   1.013
312   V         0.077   0.059   0.081  -0.101  -0.132  -0.121  -0.158  -0.176  -0.146
313   V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
314   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
315   C        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
316   D         0.201   0.182   0.136   0.205   0.177   0.106   0.054   0.027  -0.050
317   P         2.124   2.128   2.219   2.338   2.343   2.486   2.385   2.391   2.540
318   L        -0.573  -0.571  -0.559  -0.939  -0.931  -0.913  -0.611  -0.609  -0.583
319   Y         1.111   1.140   1.043   1.061   1.109   0.909   1.053   1.104   0.897
320   Y         2.124   2.128   2.219   2.157   2.162   2.302   2.385   2.391   2.540
321   V        -0.573  -0.592  -0.568  -0.812  -0.831  -0.779  -0.611  -0.634  -0.593
322   Y        -0.011   0.003   0.026  -0.371  -0.357  -0.308  -0.278  -0.260  -0.223
323   C        -1.134  -1.132  -1.079  -0.817  -0.814  -0.727  -0.944  -0.942  -0.866
324   L        -0.573  -0.592  -0.568  -0.677  -0.707  -0.706  -0.611  -0.634  -0.593
325   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
326   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
327   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
328   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
329   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
330   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
331   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
332   H        -1.134  -1.132  -1.079  -0.959  -0.952  -0.871  -0.944  -0.942  -0.866
333   M        -1.503  -1.497  -1.453  -1.181  -1.160  -1.097  -1.083  -1.078  -1.008
334   P        -1.035  -1.041  -1.022  -1.060  -1.072  -1.005  -0.852  -0.857  -0.814
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/Q04751
Output conservation file - output/Q04751
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
