1     M        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
2     E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
3     P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
4     L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
5     I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
6     S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
7     A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
8     P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
9     Y        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
10    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
11    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
12    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
13    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
14    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
15    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
16    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
17    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
18    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
19    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
20    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
21    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
22    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
23    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
24    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
25    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
26    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
27    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
28    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
29    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
30    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
31    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
32    L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
33    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
34    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
35    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
36    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
37    M         0.594   0.328   0.360   0.926   0.539   0.537   0.587   0.146   0.157
38    S         0.344   0.182   0.278   0.454   0.147   0.298   0.198  -0.113   0.006
39    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
40    P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
41    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
42    T        -0.254  -0.344  -0.453  -0.215  -0.395  -0.495  -0.297  -0.455  -0.571
43    L        -1.227  -1.148  -1.048  -1.170  -1.011  -0.958  -1.238  -1.095  -0.951
44    D        -0.977  -0.623  -0.963  -0.810  -0.358  -0.809  -0.924  -0.464  -0.858
45    A         0.527   0.258   0.324   0.475   0.120   0.166   0.486   0.025   0.091
46    A        -1.183  -1.203  -1.040  -1.194  -1.223  -0.951  -1.213  -1.144  -0.944
47    C         1.357   1.490   1.533   1.552   1.725   1.793   1.427   1.616   1.691
48    I         0.594   0.328   0.360   0.533   0.158   0.210   0.587   0.146   0.157
49    F         1.357   1.490   1.533   1.461   1.635   1.710   1.427   1.616   1.691
50    C         1.357   1.490   1.533   1.552   1.725   1.793   1.427   1.616   1.691
51    K         0.594   0.328   0.360   0.487   0.197   0.197   0.587   0.146   0.157
52    I         1.357   1.490   1.533   1.183   1.384   1.457   1.427   1.616   1.691
53    I        -0.465  -0.652  -0.493  -0.575  -0.855  -0.597  -0.613  -0.815  -0.629
54    K         0.594   0.328   0.360   0.471   0.155   0.155   0.587   0.146   0.157
55    S        -0.132  -0.233  -0.410   0.082  -0.119  -0.309  -0.133  -0.305  -0.513
56    E        -0.132  -0.419  -0.437   0.029  -0.368  -0.444  -0.133  -0.517  -0.550
57    I         0.594   0.328   0.360   0.544   0.187   0.237   0.587   0.146   0.157
58    P         0.594   0.328   0.360   0.725   0.357   0.404   0.587   0.146   0.157
59    S        -0.465  -0.652  -0.493  -0.292  -0.618  -0.356  -0.613  -0.815  -0.629
60    F         0.594   0.643   0.410   0.811   0.871   0.531   0.587   0.658   0.245
61    K         1.357   1.490   1.533   1.122   1.378   1.401   1.427   1.616   1.691
62    L         0.594   0.328   0.360   0.422   0.095   0.148   0.587   0.146   0.157
63    I        -0.614  -0.533  -0.462  -0.870  -0.734  -0.605  -0.853  -0.694  -0.592
64    E         0.594   0.328   0.360   0.668   0.319   0.314   0.587   0.146   0.157
65    T         0.594   0.328   0.360   0.825   0.443   0.475   0.587   0.146   0.157
66    K        -1.666  -1.608  -1.470  -1.747  -1.591  -1.410  -1.453  -1.315  -1.136
67    Y        -1.798  -1.675  -1.478  -1.922  -1.728  -1.477  -1.573  -1.364  -1.144
68    S        -0.614  -0.325  -0.437  -0.578  -0.188  -0.314  -0.853  -0.435  -0.559
69    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
70    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
71    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
72    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
73    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
74    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
75    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
76    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
77    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
78    Y        -0.465  -0.652  -0.493  -0.345  -0.697  -0.532  -0.613  -0.815  -0.629
79    A        -0.046   0.155   0.254  -0.353  -0.056   0.088  -0.493  -0.162  -0.038
80    F         1.357   1.490   1.533   1.461   1.635   1.710   1.427   1.616   1.691
81    L         1.357   1.490   1.533   1.054   1.264   1.339   1.427   1.616   1.691
82    D         1.357   1.490   1.533   1.309   1.490   1.572   1.427   1.616   1.691
83    I         1.357   1.490   1.533   1.183   1.384   1.457   1.427   1.616   1.691
84    Q        -0.132  -0.419  -0.437   0.224  -0.151  -0.260  -0.133  -0.517  -0.550
85    P         1.357   1.490   1.533   1.358   1.538   1.617   1.427   1.616   1.691
86    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
87    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
88    T        -0.815  -0.847  -0.986  -0.524  -0.636  -0.913  -0.733  -0.774  -0.884
89    A        -0.614  -0.264  -0.426  -0.738  -0.170  -0.422  -0.853  -0.342  -0.541
90    E        -1.448  -1.524  -1.468  -1.117  -1.214  -1.151  -1.213  -1.235  -1.133
91    G        -1.097  -1.013  -1.008  -1.000  -0.857  -0.843  -1.093  -0.946  -0.908
92    H         1.357   1.490   1.533   1.324   1.517   1.585   1.427   1.616   1.691
93    A        -1.097  -0.830  -1.003  -1.157  -0.890  -1.009  -1.093  -0.808  -0.909
94    L         1.357   1.490   1.533   1.054   1.264   1.339   1.427   1.616   1.691
95    I        -0.614  -0.705  -0.493  -0.902  -1.091  -0.727  -0.853  -0.886  -0.631
96    I         1.357   1.490   1.533   1.183   1.384   1.457   1.427   1.616   1.691
97    P         1.357   1.490   1.533   1.358   1.538   1.617   1.427   1.616   1.691
98    K         0.594   0.328   0.360   0.509   0.239   0.256   0.587   0.146   0.157
99    Y        -1.666  -1.615  -1.464  -1.395  -1.383  -1.123  -1.453  -1.314  -1.131
100   H         1.357   1.490   1.533   1.324   1.517   1.585   1.427   1.616   1.691
101   G        -0.132  -0.419  -0.437   0.031  -0.436  -0.473  -0.133  -0.517  -0.550
102   A        -0.815  -0.891  -0.993  -0.755  -0.911  -1.072  -0.733  -0.815  -0.891
103   K         0.594   0.328   0.360   0.489   0.204   0.205   0.587   0.146   0.157
104   L         0.594   0.643   0.410   0.440   0.549   0.263   0.587   0.658   0.245
105   H        -0.132  -0.345  -0.421   0.005  -0.334  -0.474  -0.133  -0.429  -0.527
106   D        -1.666  -1.588  -1.469  -1.562  -1.581  -1.324  -1.453  -1.296  -1.135
107   I         0.219   0.123   0.230  -0.084  -0.346  -0.194  -0.013  -0.222  -0.083
108   P        -0.132  -0.419  -0.437   0.079  -0.372  -0.380  -0.133  -0.517  -0.550
109   D         1.357   1.490   1.533   1.309   1.490   1.572   1.427   1.616   1.691
110   E        -0.465  -0.561  -0.471  -0.468  -0.584  -0.509  -0.613  -0.693  -0.600
111   F        -1.097  -1.120  -1.037  -0.718  -0.788  -0.655  -1.093  -1.076  -0.941
112   L        -0.132  -0.419  -0.437  -0.179  -0.540  -0.508  -0.133  -0.517  -0.550
113   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
114   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
115   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
116   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
117   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
118   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
119   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
120   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
121   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
122   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
123   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
124   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
125   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
126   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
127   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
128   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
129   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
130   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
131   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
132   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
133   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
134   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
135   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
136   T        -1.097  -0.705  -0.965  -1.076  -0.532  -0.869  -1.093  -0.590  -0.865
137   D         0.594   0.736   0.421   0.656   0.850   0.409   0.587   0.795   0.264
138   A        -1.097  -0.731  -0.976  -1.326  -0.775  -1.166  -1.093  -0.625  -0.877
139   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
140   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
141   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
142   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
143   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
144   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
145   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
146   M        -0.132  -0.233  -0.410  -0.222  -0.430  -0.574  -0.133  -0.305  -0.513
147   P         1.357   1.490   1.533   1.358   1.538   1.617   1.427   1.616   1.691
148   I        -1.183  -0.978  -0.996  -1.324  -1.069  -1.057  -1.213  -0.910  -0.899
149   A        -1.316  -1.273  -1.057  -1.422  -1.411  -1.057  -1.333  -1.198  -0.960
150   K         0.594   0.328   0.360   0.482   0.182   0.185   0.587   0.146   0.157
151   R         0.219   0.177   0.238   0.035   0.018   0.106  -0.013  -0.122  -0.069
152   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
153   L        -0.815  -0.966  -1.009  -0.842  -1.007  -1.073  -0.733  -0.893  -0.908
154   A        -1.097  -1.105  -1.027  -1.141  -1.241  -1.061  -1.093  -1.051  -0.931
155   K        -0.132  -0.345  -0.421  -0.201  -0.448  -0.643  -0.133  -0.429  -0.527
156   A        -0.465  -0.337  -0.463  -0.621  -0.489  -0.668  -0.613  -0.485  -0.594
157   M        -1.097  -0.845  -0.988  -1.277  -0.943  -1.053  -1.093  -0.761  -0.891
158   K        -0.614  -0.276  -0.420  -0.827  -0.265  -0.466  -0.853  -0.355  -0.532
159   L        -1.448  -1.515  -1.463  -1.400  -1.443  -1.354  -1.213  -1.228  -1.129
160   D        -0.815  -1.030  -1.018  -0.586  -0.909  -0.897  -0.733  -0.953  -0.918
161   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
162   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
163   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
164   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
165   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
166   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
167   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
168   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
169   T        -1.316  -1.111  -1.048  -1.279  -1.061  -0.896  -1.333  -1.065  -0.953
170   Y         0.594   0.328   0.360   0.917   0.557   0.563   0.587   0.146   0.157
171   N         1.357   1.490   1.533   1.446   1.632   1.697   1.427   1.616   1.691
172   V         0.219   0.414   0.305   0.120   0.379   0.177  -0.013   0.292   0.056
173   L         0.594   0.328   0.360   0.404   0.042   0.099   0.587   0.146   0.157
174   Q         1.357   1.490   1.533   1.499   1.709   1.746   1.427   1.616   1.691
175   N         1.357   1.490   1.533   1.446   1.632   1.697   1.427   1.616   1.691
176   N         1.357   1.490   1.533   1.446   1.632   1.697   1.427   1.616   1.691
177   G         1.357   1.490   1.533   1.344   1.513   1.603   1.427   1.616   1.691
178   K        -0.465  -0.572  -0.471  -0.290  -0.481  -0.420  -0.613  -0.708  -0.600
179   I        -0.465  -0.588  -0.476  -0.704  -0.883  -0.763  -0.613  -0.729  -0.607
180   A         1.357   1.490   1.533   1.209   1.430   1.480   1.427   1.616   1.691
181   H         0.594   0.328   0.360   0.673   0.290   0.327   0.587   0.146   0.157
182   Q         1.357   1.490   1.533   1.499   1.709   1.746   1.427   1.616   1.691
183   E        -0.614  -0.549  -0.480  -0.702  -0.602  -0.471  -0.853  -0.719  -0.616
184   V         1.357   1.490   1.533   1.349   1.505   1.608   1.427   1.616   1.691
185   D         0.594   0.736   0.421   0.659   0.844   0.416   0.587   0.795   0.264
186   H         1.357   1.490   1.533   1.324   1.517   1.585   1.427   1.616   1.691
187   V         1.357   1.490   1.533   1.349   1.505   1.608   1.427   1.616   1.691
188   H         1.357   1.490   1.533   1.324   1.517   1.585   1.427   1.616   1.691
189   F         0.594   0.736   0.421   0.811   0.988   0.549   0.587   0.795   0.264
190   H         1.357   1.490   1.533   1.324   1.517   1.585   1.427   1.616   1.691
191   L        -0.132  -0.068  -0.371  -0.222  -0.113  -0.520  -0.133  -0.024  -0.460
192   I         1.357   1.490   1.533   1.183   1.384   1.457   1.427   1.616   1.691
193   P         0.594   0.328   0.360   0.689   0.281   0.305   0.587   0.146   0.157
194   K         0.594   0.328   0.360   0.509   0.239   0.256   0.587   0.146   0.157
195   R        -0.833  -0.711  -0.532  -1.035  -0.780  -0.534  -1.093  -0.894  -0.678
196   D        -1.097  -1.138  -1.040  -0.965  -1.075  -0.868  -1.093  -1.089  -0.944
197   E        -0.132  -0.257  -0.415  -0.051  -0.278  -0.597  -0.133  -0.331  -0.520
198   K        -1.666  -1.601  -1.471  -1.778  -1.558  -1.453  -1.453  -1.303  -1.136
199   S        -1.448  -1.180  -1.397  -1.027  -0.651  -1.023  -1.213  -0.872  -1.070
200   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
201   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
202   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
203   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
204   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
205   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
206   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
207   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
208   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
209   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
210   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
211   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
212   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
213   G         1.357   1.490   1.533   1.344   1.513   1.603   1.427   1.616   1.691
214   L         0.594   0.328   0.360   0.404   0.042   0.099   0.587   0.146   0.157
215   I        -0.614  -0.693  -0.491  -0.818  -0.884  -0.576  -0.853  -0.870  -0.628
216   V         0.594   0.328   0.360   0.713   0.319   0.388   0.587   0.146   0.157
217   G         0.594   0.328   0.360   0.690   0.287   0.337   0.587   0.146   0.157
218   W         0.594   0.328   0.360   0.933   0.500   0.476   0.587   0.146   0.157
219   P         0.594   0.328   0.360   0.677   0.264   0.272   0.587   0.146   0.157
220   A        -0.815  -1.030  -1.018  -0.659  -0.972  -0.916  -0.733  -0.953  -0.918
221   Q        -1.666  -1.459  -1.447  -1.448  -1.132  -1.210  -1.453  -1.194  -1.118
222   E        -1.666  -1.639  -1.474  -1.631  -1.606  -1.378  -1.453  -1.336  -1.140
223   T        -0.815  -0.966  -1.009  -0.496  -0.775  -0.899  -0.733  -0.893  -0.908
224   D        -0.132  -0.419  -0.437   0.033  -0.407  -0.412  -0.133  -0.517  -0.550
225   F        -0.465  -0.350  -0.444  -0.239  -0.089  -0.235  -0.613  -0.413  -0.564
226   D        -1.097  -0.789  -0.985  -1.079  -0.670  -0.946  -1.093  -0.720  -0.887
227   K        -1.097  -1.035  -1.024  -1.181  -1.060  -1.007  -1.093  -0.989  -0.929
228   L        -0.132  -0.419  -0.437  -0.222  -0.566  -0.612  -0.133  -0.517  -0.550
229   G        -2.149  -1.917  -1.823  -2.134  -1.814  -1.682  -1.693  -1.414  -1.265
230   K        -0.747  -0.620  -0.522  -1.121  -0.895  -0.798  -0.973  -0.793  -0.666
231   L        -0.132   0.200  -0.342  -0.174   0.253  -0.381  -0.133   0.325  -0.420
232   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
233   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
234   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
235   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
236   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
237   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
238   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
239   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
240   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
241   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
242   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
243   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
244   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
245   H         0.219   0.123   0.230   0.147  -0.082   0.090  -0.013  -0.222  -0.083
246   K        -1.097  -1.169  -1.038  -1.195  -1.162  -1.055  -1.093  -1.105  -0.942
247   E        -0.614  -0.653  -0.478  -0.843  -0.755  -0.587  -0.853  -0.816  -0.610
248   L         0.219   0.309   0.279  -0.170  -0.034  -0.118  -0.013   0.114   0.009
249   L        -2.149  -1.991  -1.827  -2.120  -1.760  -1.585  -1.693  -1.463  -1.268
250   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
251   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
252   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
253   A        -0.465  -0.488  -0.487  -0.542  -0.585  -0.561  -0.613  -0.658  -0.624
254   K        -0.132  -0.218  -0.407  -0.148  -0.270  -0.500  -0.133  -0.289  -0.509
255   L        -0.132   0.081  -0.349  -0.265   0.020  -0.574  -0.133   0.158  -0.429
256   E        -1.227  -1.089  -1.033  -1.232  -1.035  -0.988  -1.238  -1.037  -0.937
257   G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
258   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
259   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
260   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
261   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
262   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
263   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
264   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
265   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
266   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
267   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
268   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
269   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
270   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
271   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
272   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
273   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
274   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
275   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
276   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
277   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
278   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
279   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
280   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
281   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
282   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
283   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
284   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
285   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
286   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
287   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
288   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
289   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
290   D        -1.157  -0.815  -1.007  -1.304  -0.835  -1.065  -1.133  -0.680  -0.906
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/Q04344
Output conservation file - output/Q04344
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
