1     M         1.894   1.895   1.916   2.257   2.258   2.290   2.035   2.036   2.064
2     E        -0.968  -0.967  -0.956  -0.855  -0.855  -0.831  -0.865  -0.864  -0.841
3     K        -0.968  -0.967  -0.956  -0.864  -0.859  -0.840  -0.865  -0.864  -0.841
4     D        -0.968  -0.967  -0.956  -0.971  -0.971  -0.947  -0.865  -0.864  -0.841
5     A         0.088   0.089   0.104  -0.034  -0.033  -0.007  -0.140  -0.139  -0.115
6     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
7     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
8     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
9     L         1.894   1.895   1.916   1.485   1.489   1.516   2.035   2.036   2.064
10    E         0.236   0.219   0.198   0.167   0.138   0.093   0.102   0.075   0.040
11    V        -0.968  -0.967  -0.956  -0.776  -0.777  -0.752  -0.865  -0.864  -0.841
12    R         1.894   1.895   1.916   1.943   1.943   1.975   2.035   2.036   2.064
13    L         0.236   0.219   0.198  -0.154  -0.176  -0.202   0.102   0.075   0.040
14    K        -0.968  -0.967  -0.956  -1.336  -1.330  -1.313  -0.865  -0.864  -0.841
15    S        -0.968  -0.967  -0.956  -0.928  -0.923  -0.904  -0.865  -0.864  -0.841
16    I         0.236   0.252   0.210  -0.178  -0.153  -0.213   0.102   0.127   0.060
17    R         0.236   0.252   0.210   0.111   0.136   0.068   0.102   0.127   0.060
18    H         0.236   0.252   0.210   0.302   0.326   0.264   0.102   0.127   0.060
19    S        -0.968  -0.967  -0.956  -0.962  -0.958  -0.939  -0.865  -0.864  -0.841
20    L         1.894   1.895   1.916   1.485   1.489   1.516   2.035   2.036   2.064
21    D         1.894   1.895   1.916   1.936   1.935   1.968   2.035   2.036   2.064
22    K        -0.968  -0.967  -0.956  -0.997  -0.990  -0.974  -0.865  -0.864  -0.841
23    N        -0.968  -0.967  -0.956  -0.821  -0.821  -0.798  -0.865  -0.864  -0.841
24    T        -0.968  -0.967  -0.956  -0.796  -0.798  -0.772  -0.865  -0.864  -0.841
25    K        -0.968  -0.967  -0.956  -0.923  -0.920  -0.900  -0.865  -0.864  -0.841
26    L        -0.968  -0.967  -0.956  -1.091  -1.080  -1.068  -0.865  -0.864  -0.841
27    L         0.236   0.219   0.198  -0.271  -0.295  -0.334   0.102   0.075   0.040
28    P         0.236   0.252   0.210   0.427   0.449   0.391   0.102   0.127   0.060
29    G         0.088   0.089   0.104   0.043   0.044   0.070  -0.140  -0.139  -0.115
30    K         1.894   1.895   1.916   1.802   1.803   1.834   2.035   2.036   2.064
31    Y         0.236   0.239   0.206   0.390   0.394   0.343   0.102   0.107   0.053
32    R         0.236   0.219   0.198   0.368   0.344   0.320   0.102   0.075   0.040
33    N         0.236   0.219   0.198   0.365   0.338   0.301   0.102   0.075   0.040
34    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
35    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
36    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
37    T         0.236   0.252   0.210   0.270   0.296   0.229   0.102   0.127   0.060
38    -         0.088   0.089   0.104   0.032   0.033   0.058  -0.140  -0.139  -0.115
39    -         0.088   0.089   0.104   0.232   0.233   0.259  -0.140  -0.139  -0.115
40    -         0.088   0.089   0.104   0.039   0.040   0.066  -0.140  -0.139  -0.115
41    -         1.894   1.895   1.916   1.912   1.913   1.944   2.035   2.036   2.064
42    L        -0.968  -0.967  -0.956  -1.055  -1.042  -1.032  -0.865  -0.864  -0.841
43    G        -0.968  -0.967  -0.956  -0.801  -0.805  -0.777  -0.865  -0.864  -0.841
44    E         0.236   0.219   0.198   0.174   0.143   0.100   0.102   0.075   0.040
45    R         1.894   1.895   1.916   1.943   1.943   1.975   2.035   2.036   2.064
46    L         0.088   0.089   0.104  -0.378  -0.377  -0.352  -0.140  -0.139  -0.115
47    I         0.236   0.252   0.210   0.333   0.359   0.289   0.102   0.127   0.060
48    T        -0.968  -0.967  -0.956  -0.910  -0.906  -0.887  -0.865  -0.864  -0.841
49    K         0.236   0.239   0.206   0.098   0.104   0.048   0.102   0.107   0.053
50    W        -0.968  -0.967  -0.956  -0.723  -0.725  -0.698  -0.865  -0.864  -0.841
51    R         0.236   0.239   0.206   0.161   0.166   0.101   0.102   0.107   0.053
52    Y         1.894   1.895   1.916   2.040   2.040   2.073   2.035   2.036   2.064
53    K         0.236   0.239   0.206   0.098   0.104   0.048   0.102   0.107   0.053
54    K        -0.968  -0.967  -0.956  -1.055  -1.050  -1.032  -0.865  -0.864  -0.841
55    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
56    K         0.088   0.089   0.104  -0.012  -0.011   0.015  -0.140  -0.139  -0.115
57    S         0.088   0.089   0.104   0.111   0.112   0.138  -0.140  -0.139  -0.115
58    H         0.088   0.089   0.104  -0.322  -0.321  -0.297  -0.140  -0.139  -0.115
59    N         0.088   0.089   0.104  -0.130  -0.129  -0.104  -0.140  -0.139  -0.115
60    G         0.088   0.089   0.104   0.068   0.069   0.095  -0.140  -0.139  -0.115
61    S        -0.968  -0.967  -0.956  -0.958  -0.955  -0.934  -0.865  -0.864  -0.841
62    S        -0.968  -0.967  -0.956  -0.971  -0.968  -0.947  -0.865  -0.864  -0.841
63    M        -0.968  -0.967  -0.956  -0.595  -0.598  -0.570  -0.865  -0.864  -0.841
64    L         0.236   0.219   0.198  -0.203  -0.226  -0.258   0.102   0.075   0.040
65    P        -0.968  -0.967  -0.956  -1.146  -1.156  -1.123  -0.865  -0.864  -0.841
66    E        -0.968  -0.967  -0.956  -1.028  -1.029  -1.005  -0.865  -0.864  -0.841
67    K         0.236   0.219   0.198   0.042   0.013  -0.028   0.102   0.075   0.040
68    C        -0.968  -0.967  -0.956  -0.654  -0.651  -0.630  -0.865  -0.864  -0.841
69    K         0.236   0.239   0.206   0.248   0.253   0.214   0.102   0.107   0.053
70    S        -0.968  -0.967  -0.956  -0.993  -0.986  -0.969  -0.865  -0.864  -0.841
71    H        -0.968  -0.967  -0.956  -0.805  -0.809  -0.781  -0.865  -0.864  -0.841
72    V         0.236   0.239   0.206   0.311   0.315   0.257   0.102   0.107   0.053
73    Q        -0.968  -0.967  -0.956  -0.821  -0.818  -0.798  -0.865  -0.864  -0.841
74    L         0.236   0.219   0.198  -0.074  -0.092  -0.112   0.102   0.075   0.040
75    Y         1.894   1.895   1.916   2.040   2.040   2.073   2.035   2.036   2.064
76    D         0.236   0.252   0.210   0.225   0.252   0.180   0.102   0.127   0.060
77    D        -0.968  -0.967  -0.956  -0.889  -0.888  -0.865  -0.865  -0.864  -0.841
78    L         0.236   0.219   0.198  -0.154  -0.176  -0.202   0.102   0.075   0.040
79    V         0.236   0.219   0.198   0.108   0.071   0.013   0.102   0.075   0.040
80    Q        -0.968  -0.967  -0.956  -0.855  -0.857  -0.831  -0.865  -0.864  -0.841
81    -         1.894   1.895   1.916   2.013   2.014   2.046   2.035   2.036   2.064
82    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
83    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
84    E         1.894   1.895   1.916   1.950   1.952   1.982   2.035   2.036   2.064
85    S         0.236   0.239   0.206   0.048   0.053  -0.009   0.102   0.107   0.053
86    S        -0.968  -0.967  -0.956  -0.962  -0.958  -0.939  -0.865  -0.864  -0.841
87    K         1.894   1.895   1.916   1.808   1.811   1.840   2.035   2.036   2.064
88    H        -0.968  -0.967  -0.956  -0.686  -0.684  -0.662  -0.865  -0.864  -0.841
89    F        -0.968  -0.967  -0.956  -0.706  -0.707  -0.682  -0.865  -0.864  -0.841
90    V        -0.968  -0.967  -0.956  -1.178  -1.178  -1.155  -0.865  -0.864  -0.841
91    G        -0.968  -0.967  -0.956  -0.690  -0.691  -0.666  -0.865  -0.864  -0.841
92    F         0.236   0.239   0.206   0.436   0.440   0.384   0.102   0.107   0.053
93    R        -0.968  -0.967  -0.956  -0.830  -0.826  -0.806  -0.865  -0.864  -0.841
94    L         0.236   0.219   0.198  -0.203  -0.226  -0.258   0.102   0.075   0.040
95    H        -0.968  -0.967  -0.956  -0.739  -0.741  -0.715  -0.865  -0.864  -0.841
96    D         0.236   0.252   0.210   0.225   0.252   0.180   0.102   0.127   0.060
97    L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
98    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
99    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
100   L        -0.968  -0.967  -0.956  -1.082  -1.069  -1.059  -0.865  -0.864  -0.841
101   L         0.236   0.219   0.198  -0.115  -0.134  -0.159   0.102   0.075   0.040
102   K        -0.968  -0.967  -0.956  -1.033  -1.028  -1.009  -0.865  -0.864  -0.841
103   R        -0.968  -0.967  -0.956  -0.919  -0.913  -0.895  -0.865  -0.864  -0.841
104   I        -0.968  -0.967  -0.956  -1.141  -1.148  -1.118  -0.865  -0.864  -0.841
105   C        -0.968  -0.967  -0.956  -0.731  -0.732  -0.706  -0.865  -0.864  -0.841
106   S        -0.968  -0.967  -0.956  -0.919  -0.917  -0.895  -0.865  -0.864  -0.841
107   I        -0.968  -0.967  -0.956  -0.997  -0.989  -0.974  -0.865  -0.864  -0.841
108   Q        -0.968  -0.967  -0.956  -1.068  -1.066  -1.045  -0.865  -0.864  -0.841
109   N        -0.968  -0.967  -0.956  -0.792  -0.790  -0.768  -0.865  -0.864  -0.841
110   Y        -0.968  -0.967  -0.956  -0.731  -0.731  -0.706  -0.865  -0.864  -0.841
111   T         1.894   1.895   1.916   2.033   2.033   2.066   2.035   2.036   2.064
112   R         0.236   0.252   0.210   0.098   0.125   0.055   0.102   0.127   0.060
113   H        -0.968  -0.967  -0.956  -0.735  -0.735  -0.711  -0.865  -0.864  -0.841
114   V        -0.968  -0.967  -0.956  -1.169  -1.167  -1.146  -0.865  -0.864  -0.841
115   L        -0.968  -0.967  -0.956  -1.118  -1.106  -1.095  -0.865  -0.864  -0.841
116   I         1.894   1.895   1.916   1.992   1.992   2.024   2.035   2.036   2.064
117   E         0.236   0.219   0.198   0.315   0.290   0.259   0.102   0.075   0.040
118   W         1.894   1.895   1.916   2.224   2.225   2.257   2.035   2.036   2.064
119   D         1.894   1.895   1.916   1.935   1.937   1.968   2.035   2.036   2.064
120   V         0.236   0.252   0.210   0.157   0.180   0.119   0.102   0.127   0.060
121   R        -0.968  -0.967  -0.956  -0.936  -0.931  -0.913  -0.865  -0.864  -0.841
122   W        -0.968  -0.967  -0.956  -0.988  -0.988  -0.965  -0.865  -0.864  -0.841
123   V         0.236   0.239   0.206   0.352   0.355   0.302   0.102   0.107   0.053
124   N         1.894   1.895   1.916   2.054   2.057   2.087   2.035   2.036   2.064
125   P         1.894   1.895   1.916   2.197   2.198   2.230   2.035   2.036   2.064
126   L         0.236   0.219   0.198  -0.178  -0.200  -0.230   0.102   0.075   0.040
127   T         1.894   1.895   1.916   2.033   2.033   2.066   2.035   2.036   2.064
128   L         0.236   0.219   0.198  -0.178  -0.200  -0.230   0.102   0.075   0.040
129   A        -0.968  -0.967  -0.956  -1.050  -1.060  -1.027  -0.865  -0.864  -0.841
130   S         0.236   0.252   0.210   0.340   0.369   0.286   0.102   0.127   0.060
131   K        -0.968  -0.967  -0.956  -0.859  -0.850  -0.835  -0.865  -0.864  -0.841
132   G         1.894   1.895   1.916   2.122   2.124   2.155   2.035   2.036   2.064
133   W         0.236   0.219   0.198   0.283   0.246   0.184   0.102   0.075   0.040
134   E        -0.968  -0.967  -0.956  -1.024  -1.023  -1.000  -0.865  -0.864  -0.841
135   P        -0.968  -0.967  -0.956  -0.583  -0.586  -0.558  -0.865  -0.864  -0.841
136   Y        -0.968  -0.967  -0.956  -0.784  -0.784  -0.760  -0.865  -0.864  -0.841
137   Q         0.088   0.089   0.104   0.097   0.097   0.123  -0.140  -0.139  -0.115
138   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
139   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
140   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
141   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
142   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
143   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
144   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
145   S        -0.968  -0.967  -0.956  -0.915  -0.910  -0.891  -0.865  -0.864  -0.841
146   A         0.236   0.219   0.198   0.482   0.456   0.422   0.102   0.075   0.040
147   S        -0.968  -0.967  -0.956  -0.919  -0.918  -0.895  -0.865  -0.864  -0.841
148   Q        -0.968  -0.967  -0.956  -0.743  -0.740  -0.719  -0.865  -0.864  -0.841
149   S         0.236   0.239   0.206   0.154   0.157   0.109   0.102   0.107   0.053
150   Q        -0.968  -0.967  -0.956  -0.694  -0.694  -0.670  -0.865  -0.864  -0.841
151   V         0.236   0.239   0.206   0.362   0.366   0.312   0.102   0.107   0.053
152   P        -0.968  -0.967  -0.956  -0.813  -0.815  -0.789  -0.865  -0.864  -0.841
153   F         0.236   0.252   0.210  -0.108  -0.085  -0.136   0.102   0.127   0.060
154   K         0.236   0.239   0.206   0.121   0.128   0.074   0.102   0.107   0.053
155   C         1.894   1.895   1.916   2.143   2.144   2.176   2.035   2.036   2.064
156   C        -0.968  -0.967  -0.956  -0.780  -0.783  -0.756  -0.865  -0.864  -0.841
157   C         0.236   0.219   0.198   0.352   0.320   0.274   0.102   0.075   0.040
158   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
159   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
160   C         1.894   1.895   1.916   2.143   2.144   2.176   2.035   2.036   2.064
161   H         0.236   0.219   0.198   0.321   0.291   0.243   0.102   0.075   0.040
162   A        -0.968  -0.967  -0.956  -0.739  -0.740  -0.715  -0.865  -0.864  -0.841
163   I        -0.968  -0.967  -0.956  -1.146  -1.142  -1.123  -0.865  -0.864  -0.841
164   M        -0.968  -0.967  -0.956  -0.997  -1.008  -0.974  -0.865  -0.864  -0.841
165   T         0.236   0.252   0.210   0.154   0.177   0.115   0.102   0.127   0.060
166   I        -0.968  -0.967  -0.956  -1.082  -1.089  -1.059  -0.865  -0.864  -0.841
167   P        -0.968  -0.967  -0.956  -0.735  -0.738  -0.711  -0.865  -0.864  -0.841
168   L         0.236   0.239   0.206  -0.102  -0.095  -0.134   0.102   0.107   0.053
169   L        -0.968  -0.967  -0.956  -1.109  -1.096  -1.086  -0.865  -0.864  -0.841
170   K         0.236   0.219   0.198   0.095   0.068   0.032   0.102   0.075   0.040
171   N        -0.968  -0.967  -0.956  -0.902  -0.905  -0.878  -0.865  -0.864  -0.841
172   G         0.088   0.089   0.104   0.068   0.069   0.095  -0.140  -0.139  -0.115
173   D         0.088   0.089   0.104   0.230   0.231   0.257  -0.140  -0.139  -0.115
174   D         1.894   1.895   1.916   1.998   1.999   2.031   2.035   2.036   2.064
175   V         0.088   0.089   0.104  -0.306  -0.306  -0.281  -0.140  -0.139  -0.115
176   A         0.088   0.089   0.104   0.046   0.047   0.073  -0.140  -0.139  -0.115
177   D         1.894   1.895   1.916   1.998   1.999   2.031   2.035   2.036   2.064
178   Y        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
179   T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
180   M        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
181   K         0.236   0.219   0.198   0.102   0.076   0.039   0.102   0.075   0.040
182   L         0.236   0.219   0.198  -0.108  -0.128  -0.151   0.102   0.075   0.040
183   N         0.236   0.239   0.206   0.408   0.415   0.362   0.102   0.107   0.053
184   E        -0.968  -0.967  -0.956  -1.127  -1.120  -1.104  -0.865  -0.864  -0.841
185   K        -0.968  -0.967  -0.956  -0.936  -0.929  -0.913  -0.865  -0.864  -0.841
186   I         0.088   0.089   0.104   0.160   0.161   0.187  -0.140  -0.139  -0.115
187   W         0.236   0.219   0.198   0.521   0.492   0.454   0.102   0.075   0.040
188   N         0.088   0.089   0.104   0.222   0.222   0.249  -0.140  -0.139  -0.115
189   S         1.894   1.895   1.916   1.802   1.803   1.834   2.035   2.036   2.064
190   N         0.088   0.089   0.104   0.236   0.236   0.263  -0.140  -0.139  -0.115
191   I         0.236   0.252   0.210  -0.178  -0.153  -0.213   0.102   0.127   0.060
192   I        -0.968  -0.967  -0.956  -1.146  -1.153  -1.123  -0.865  -0.864  -0.841
193   G        -0.968  -0.967  -0.956  -0.792  -0.794  -0.768  -0.865  -0.864  -0.841
194   N        -0.968  -0.967  -0.956  -0.763  -0.758  -0.739  -0.865  -0.864  -0.841
195   H         1.894   1.895   1.916   2.115   2.118   2.148   2.035   2.036   2.064
196   L         0.236   0.219   0.198  -0.271  -0.295  -0.334   0.102   0.075   0.040
197   Q        -0.968  -0.967  -0.956  -1.010  -1.013  -0.987  -0.865  -0.864  -0.841
198   K        -0.968  -0.967  -0.956  -0.980  -0.976  -0.956  -0.865  -0.864  -0.841
199   C         1.894   1.895   1.916   2.143   2.144   2.176   2.035   2.036   2.064
200   P        -0.968  -0.967  -0.956  -0.755  -0.755  -0.731  -0.865  -0.864  -0.841
201   W         1.894   1.895   1.916   2.224   2.225   2.257   2.035   2.036   2.064
202   R         0.236   0.219   0.198   0.302   0.276   0.246   0.102   0.075   0.040
203   E        -0.968  -0.967  -0.956  -0.788  -0.785  -0.764  -0.865  -0.864  -0.841
204   N        -0.968  -0.967  -0.956  -0.898  -0.900  -0.874  -0.865  -0.864  -0.841
205   Q         0.236   0.219   0.198   0.315   0.282   0.238   0.102   0.075   0.040
206   V         0.236   0.239   0.206   0.396   0.399   0.350   0.102   0.107   0.053
207   D         0.236   0.252   0.210   0.451   0.479   0.401   0.102   0.127   0.060
208   L         1.894   1.895   1.916   1.485   1.489   1.516   2.035   2.036   2.064
209   N        -0.968  -0.967  -0.956  -0.885  -0.885  -0.861  -0.865  -0.864  -0.841
210   K        -0.968  -0.967  -0.956  -1.006  -1.001  -0.983  -0.865  -0.864  -0.841
211   E        -0.968  -0.967  -0.956  -0.893  -0.892  -0.870  -0.865  -0.864  -0.841
212   Y         1.894   1.895   1.916   2.040   2.040   2.073   2.035   2.036   2.064
213   Y         1.894   1.895   1.916   2.040   2.040   2.073   2.035   2.036   2.064
214   L         0.236   0.219   0.198  -0.154  -0.176  -0.202   0.102   0.075   0.040
215   S         0.236   0.252   0.210   0.270   0.301   0.218   0.102   0.127   0.060
216   S         0.236   0.252   0.210   0.042   0.070  -0.007   0.102   0.127   0.060
217   Q        -0.968  -0.967  -0.956  -0.821  -0.825  -0.798  -0.865  -0.864  -0.841
218   N         0.236   0.219   0.198   0.270   0.240   0.194   0.102   0.075   0.040
219   L         0.236   0.219   0.198  -0.154  -0.176  -0.202   0.102   0.075   0.040
220   I         0.236   0.239   0.206   0.062   0.069  -0.014   0.102   0.107   0.053
221   R        -0.968  -0.967  -0.956  -0.780  -0.778  -0.756  -0.865  -0.864  -0.841
222   E         1.894   1.895   1.916   1.950   1.952   1.982   2.035   2.036   2.064
223   I         0.236   0.239   0.206   0.352   0.357   0.308   0.102   0.107   0.053
224   E         0.236   0.239   0.206   0.021   0.030  -0.054   0.102   0.107   0.053
225   R         0.236   0.239   0.206   0.315   0.319   0.272   0.102   0.107   0.053
226   I         0.236   0.239   0.206   0.062   0.069  -0.014   0.102   0.107   0.053
227   H        -0.968  -0.967  -0.956  -0.830  -0.832  -0.806  -0.865  -0.864  -0.841
228   T        -0.968  -0.967  -0.956  -0.949  -0.948  -0.926  -0.865  -0.864  -0.841
229   E        -0.968  -0.967  -0.956  -1.127  -1.120  -1.104  -0.865  -0.864  -0.841
230   I        -0.968  -0.967  -0.956  -0.686  -0.680  -0.662  -0.865  -0.864  -0.841
231   D        -0.968  -0.967  -0.956  -1.118  -1.112  -1.095  -0.865  -0.864  -0.841
232   R         1.894   1.895   1.916   1.943   1.943   1.975   2.035   2.036   2.064
233   I        -0.968  -0.967  -0.956  -0.751  -0.750  -0.727  -0.865  -0.864  -0.841
234   V        -0.968  -0.967  -0.956  -0.910  -0.915  -0.887  -0.865  -0.864  -0.841
235   S        -0.968  -0.967  -0.956  -0.885  -0.879  -0.861  -0.865  -0.864  -0.841
236   G        -0.968  -0.967  -0.956  -1.114  -1.122  -1.091  -0.865  -0.864  -0.841
237   S         0.236   0.239   0.206   0.157   0.160   0.112   0.102   0.107   0.053
238   N         0.236   0.252   0.210   0.267   0.291   0.227   0.102   0.127   0.060
239   E        -0.968  -0.967  -0.956  -0.919  -0.918  -0.895  -0.865  -0.864  -0.841
240   F         1.894   1.895   1.916   2.129   2.130   2.162   2.035   2.036   2.064
241   S        -0.968  -0.967  -0.956  -1.050  -1.050  -1.027  -0.865  -0.864  -0.841
242   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
243   K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
244   R         1.894   1.895   1.916   1.948   1.949   1.980   2.035   2.036   2.064
245   N         1.894   1.895   1.916   1.988   1.989   2.021   2.035   2.036   2.064
246   S         1.894   1.895   1.916   1.823   1.822   1.855   2.035   2.036   2.064
247   S         0.088   0.089   0.104   0.051   0.051   0.077  -0.140  -0.139  -0.115
248   R         0.088   0.089   0.104   0.072   0.073   0.099  -0.140  -0.139  -0.115
249   I         0.088   0.089   0.104  -0.337  -0.336  -0.312  -0.140  -0.139  -0.115
250   F         0.088   0.089   0.104   0.179   0.180   0.206  -0.140  -0.139  -0.115
251   H         0.088   0.089   0.104   0.249   0.250   0.277  -0.140  -0.139  -0.115
252   Y         0.088   0.089   0.104   0.208   0.208   0.235  -0.140  -0.139  -0.115
253   L         1.894   1.895   1.916   1.526   1.527   1.557   2.035   2.036   2.064
254   S         0.088   0.089   0.104   0.043   0.044   0.070  -0.140  -0.139  -0.115
255   E         1.894   1.895   1.916   1.956   1.957   1.988   2.035   2.036   2.064
256   K         1.894   1.895   1.916   1.802   1.803   1.834   2.035   2.036   2.064
257   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
258   I         1.894   1.895   1.916   1.992   1.992   2.024   2.035   2.036   2.064
259   Q        -0.968  -0.967  -0.956  -0.941  -0.944  -0.917  -0.865  -0.864  -0.841
260   K        -0.968  -0.967  -0.956  -1.220  -1.223  -1.198  -0.865  -0.864  -0.841
261   L         0.236   0.239   0.206  -0.178  -0.172  -0.219   0.102   0.107   0.053
262   A        -0.968  -0.967  -0.956  -0.718  -0.716  -0.694  -0.865  -0.864  -0.841
263   F        -0.968  -0.967  -0.956  -0.674  -0.673  -0.650  -0.865  -0.864  -0.841
264   F        -0.968  -0.967  -0.956  -0.556  -0.553  -0.531  -0.865  -0.864  -0.841
265   F         1.894   1.895   1.916   2.129   2.130   2.162   2.035   2.036   2.064
266   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
267   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
268   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
269   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
270   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
271   D        -0.968  -0.967  -0.956  -0.792  -0.788  -0.768  -0.865  -0.864  -0.841
272   C        -0.968  -0.967  -0.956  -0.872  -0.877  -0.848  -0.865  -0.864  -0.841
273   K         0.236   0.219   0.198   0.042   0.013  -0.028   0.102   0.075   0.040
274   D         1.894   1.895   1.916   1.936   1.935   1.968   2.035   2.036   2.064
275   Y        -0.968  -0.967  -0.956  -0.859  -0.859  -0.835  -0.865  -0.864  -0.841
276   S        -0.968  -0.967  -0.956  -0.842  -0.836  -0.819  -0.865  -0.864  -0.841
277   L         0.236   0.239   0.206  -0.147  -0.139  -0.184   0.102   0.107   0.053
278   V         0.236   0.252   0.210  -0.154  -0.130  -0.186   0.102   0.127   0.060
279   G        -0.968  -0.967  -0.956  -0.864  -0.862  -0.840  -0.865  -0.864  -0.841
280   L         0.236   0.219   0.198  -0.154  -0.176  -0.202   0.102   0.075   0.040
281   L         0.236   0.239   0.206  -0.108  -0.102  -0.142   0.102   0.107   0.053
282   L         1.894   1.895   1.916   1.485   1.489   1.516   2.035   2.036   2.064
283   L         0.236   0.252   0.210   0.015   0.049  -0.051   0.102   0.127   0.060
284   G         1.894   1.895   1.916   2.122   2.124   2.155   2.035   2.036   2.064
285   Y         0.236   0.239   0.206   0.396   0.400   0.350   0.102   0.107   0.053
286   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
287   -         0.088   0.089   0.104  -0.020  -0.019   0.006  -0.140  -0.139  -0.115
288   -         0.088   0.089   0.104   0.039   0.040   0.066  -0.140  -0.139  -0.115
289   -         0.088   0.089   0.104   0.119   0.120   0.146  -0.140  -0.139  -0.115
290   T        -0.968  -0.967  -0.956  -0.747  -0.750  -0.723  -0.865  -0.864  -0.841
291   K        -0.968  -0.967  -0.956  -0.997  -0.990  -0.974  -0.865  -0.864  -0.841
292   F        -0.968  -0.967  -0.956  -0.642  -0.641  -0.618  -0.865  -0.864  -0.841
293   Q        -0.968  -0.967  -0.956  -0.872  -0.877  -0.848  -0.865  -0.864  -0.841
294   K        -0.968  -0.967  -0.956  -1.002  -0.997  -0.978  -0.865  -0.864  -0.841
295   D        -0.968  -0.967  -0.956  -0.984  -0.982  -0.961  -0.865  -0.864  -0.841
296   D         1.894   1.895   1.916   1.936   1.935   1.968   2.035   2.036   2.064
297   L         0.236   0.252   0.210   0.193   0.228   0.125   0.102   0.127   0.060
298   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
299   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
300   V         0.236   0.219   0.198   0.108   0.071   0.013   0.102   0.075   0.040
301   Q         0.236   0.239   0.206   0.408   0.413   0.357   0.102   0.107   0.053
302   C         1.894   1.895   1.916   2.143   2.144   2.176   2.035   2.036   2.064
303   T        -0.968  -0.967  -0.956  -0.743  -0.743  -0.719  -0.865  -0.864  -0.841
304   A        -0.968  -0.967  -0.956  -0.674  -0.673  -0.650  -0.865  -0.864  -0.841
305   C         0.236   0.219   0.198   0.352   0.320   0.274   0.102   0.075   0.040
306   F        -0.968  -0.967  -0.956  -0.662  -0.663  -0.638  -0.865  -0.864  -0.841
307   H        -0.968  -0.967  -0.956  -0.993  -1.000  -0.969  -0.865  -0.864  -0.841
308   R         0.236   0.219   0.198   0.264   0.236   0.203   0.102   0.075   0.040
309   A        -0.968  -0.967  -0.956  -0.851  -0.852  -0.827  -0.865  -0.864  -0.841
310   S        -0.968  -0.967  -0.956  -0.915  -0.914  -0.891  -0.865  -0.864  -0.841
311   L         0.236   0.219   0.198  -0.154  -0.176  -0.202   0.102   0.075   0.040
312   K         0.236   0.239   0.206   0.141   0.147   0.096   0.102   0.107   0.053
313   K        -0.968  -0.967  -0.956  -1.010  -1.004  -0.987  -0.865  -0.864  -0.841
314   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
315   L         1.894   1.895   1.916   1.485   1.489   1.516   2.035   2.036   2.064
316   E        -0.968  -0.967  -0.956  -0.898  -0.892  -0.874  -0.865  -0.864  -0.841
317   Y        -0.968  -0.967  -0.956  -0.906  -0.902  -0.882  -0.865  -0.864  -0.841
318   T        -0.968  -0.967  -0.956  -0.902  -0.904  -0.878  -0.865  -0.864  -0.841
319   E         0.236   0.252   0.210   0.219   0.244   0.174   0.102   0.127   0.060
320   F         0.236   0.239   0.206   0.470   0.475   0.422   0.102   0.107   0.053
321   N         0.236   0.239   0.206   0.368   0.374   0.318   0.102   0.107   0.053
322   G         1.894   1.895   1.916   2.122   2.124   2.155   2.035   2.036   2.064
323   H         1.894   1.895   1.916   2.115   2.118   2.148   2.035   2.036   2.064
324   A        -0.968  -0.967  -0.956  -0.630  -0.628  -0.606  -0.865  -0.864  -0.841
325   L        -0.968  -0.967  -0.956  -1.155  -1.147  -1.132  -0.865  -0.864  -0.841
326   W         1.894   1.895   1.916   2.224   2.225   2.257   2.035   2.036   2.064
327   C         0.236   0.219   0.198   0.352   0.320   0.274   0.102   0.075   0.040
328   R         0.236   0.219   0.198   0.167   0.136   0.094   0.102   0.075   0.040
329   Y         0.236   0.219   0.198   0.390   0.363   0.331   0.102   0.075   0.040
330   Y         0.236   0.239   0.206   0.383   0.387   0.337   0.102   0.107   0.053
331   N         0.236   0.252   0.210   0.267   0.291   0.227   0.102   0.127   0.060
332   K         0.236   0.252   0.210   0.308   0.338   0.254   0.102   0.127   0.060
333   E         0.236   0.252   0.210   0.219   0.244   0.174   0.102   0.127   0.060
334   L        -0.968  -0.967  -0.956  -1.073  -1.063  -1.050  -0.865  -0.864  -0.841
335   L         1.894   1.895   1.916   1.403   1.404   1.433   2.035   2.036   2.064
336   P         0.088   0.089   0.104   0.237   0.238   0.264  -0.140  -0.139  -0.115
337   T         0.088   0.089   0.104   0.153   0.154   0.180  -0.140  -0.139  -0.115
338   M         0.088   0.089   0.104  -0.183  -0.182  -0.157  -0.140  -0.139  -0.115
339   L         0.236   0.252   0.210   0.062   0.096  -0.005   0.102   0.127   0.060
340   L         0.236   0.239   0.206  -0.200  -0.192  -0.242   0.102   0.107   0.053
341   E         0.236   0.252   0.210   0.219   0.244   0.174   0.102   0.127   0.060
342   L         0.236   0.239   0.206  -0.108  -0.102  -0.142   0.102   0.107   0.053
343   I         0.236   0.219   0.198   0.062   0.026  -0.033   0.102   0.075   0.040
344   G        -0.968  -0.967  -0.956  -0.682  -0.682  -0.658  -0.865  -0.864  -0.841
345   K         0.236   0.252   0.210   0.154   0.181   0.103   0.102   0.127   0.060
346   E        -0.968  -0.967  -0.956  -0.967  -0.964  -0.943  -0.865  -0.864  -0.841
347   D        -0.968  -0.967  -0.956  -1.326  -1.334  -1.304  -0.865  -0.864  -0.841
348   K        -0.968  -0.967  -0.956  -0.945  -0.941  -0.921  -0.865  -0.864  -0.841
349   L        -0.968  -0.967  -0.956  -1.202  -1.191  -1.179  -0.865  -0.864  -0.841
350   I         0.236   0.239   0.206   0.311   0.315   0.263   0.102   0.107   0.053
351   T        -0.968  -0.967  -0.956  -0.821  -0.816  -0.798  -0.865  -0.864  -0.841
352   K        -0.968  -0.967  -0.956  -1.037  -1.034  -1.014  -0.865  -0.864  -0.841
353   L         0.236   0.219   0.198  -0.200  -0.222  -0.254   0.102   0.075   0.040
354   G        -0.968  -0.967  -0.956  -0.759  -0.764  -0.735  -0.865  -0.864  -0.841
355   V        -0.968  -0.967  -0.956  -0.674  -0.670  -0.650  -0.865  -0.864  -0.841
356   G        -0.968  -0.967  -0.956  -0.690  -0.690  -0.666  -0.865  -0.864  -0.841
357   E        -0.968  -0.967  -0.956  -0.727  -0.722  -0.702  -0.865  -0.864  -0.841
358   R         1.894   1.895   1.916   1.943   1.943   1.975   2.035   2.036   2.064
359   L         0.236   0.219   0.198  -0.178  -0.200  -0.230   0.102   0.075   0.040
360   N         0.236   0.219   0.198   0.270   0.240   0.194   0.102   0.075   0.040
361   K         0.236   0.219   0.198   0.098   0.072   0.035   0.102   0.075   0.040
362   L         1.894   1.895   1.916   1.485   1.489   1.516   2.035   2.036   2.064
363   E         0.236   0.219   0.198   0.167   0.138   0.093   0.102   0.075   0.040
364   A        -0.968  -0.967  -0.956  -0.919  -0.919  -0.895  -0.865  -0.864  -0.841
365   V        -0.968  -0.967  -0.956  -0.809  -0.810  -0.785  -0.865  -0.864  -0.841
366   L         0.236   0.219   0.198  -0.178  -0.200  -0.230   0.102   0.075   0.040
367   Q        -0.968  -0.967  -0.956  -0.796  -0.796  -0.772  -0.865  -0.864  -0.841
368   T         0.236   0.252   0.210   0.141   0.167   0.102   0.102   0.127   0.060
369   L         0.236   0.219   0.198  -0.060  -0.078  -0.097   0.102   0.075   0.040
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/Q03760
Output conservation file - output/Q03760
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
