1     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
2     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
3     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
4     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
5     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
6     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
7     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
8     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
9     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
10    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
11    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
12    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
13    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
14    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
15    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
16    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
17    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
18    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
19    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
20    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
21    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
22    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
23    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
24    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
25    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
26    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
27    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
28    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
29    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
30    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
31    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
32    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
33    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
34    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
35    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
36    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
37    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
38    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
39    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
40    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
41    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
42    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
43    M         1.129   1.049   1.020   1.639   1.575   1.518   1.168   1.021   0.922
44    D        -0.133  -0.133  -0.032  -0.051  -0.103   0.029  -0.446  -0.459  -0.329
45    S        -0.462  -0.441  -0.468  -0.207  -0.202  -0.203  -0.571  -0.533  -0.544
46    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
47    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
48    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
49    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
50    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
51    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
52    K        -0.197  -0.217  -0.386  -0.736  -0.760  -0.953  -0.198  -0.225  -0.431
53    E        -1.122  -0.974  -0.980  -0.594  -0.418  -0.433  -1.067  -0.906  -0.861
54    Y         1.129   1.020   1.002   1.576   1.456   1.400   1.168   0.969   0.889
55    L         1.846   1.939   2.070   1.932   2.048   2.203   2.037   2.182   2.413
56    I        -0.997  -0.938  -0.940  -1.023  -0.975  -0.835  -0.943  -0.861  -0.820
57    S         1.846   1.939   2.070   1.730   1.835   1.997   2.037   2.182   2.413
58    Y         0.133  -0.013   0.064   0.703   0.530   0.609  -0.074  -0.282  -0.198
59    G         1.846   1.939   2.070   1.841   1.957   2.110   2.037   2.182   2.413
60    W         1.846   1.939   2.070   2.140   2.269   2.414   2.037   2.182   2.413
61    K        -0.462  -0.580  -0.480  -0.833  -0.940  -0.754  -0.571  -0.677  -0.557
62    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
63    E         0.446   0.404   0.223   0.679   0.534   0.272   0.423   0.349   0.066
64    G         1.846   1.939   2.070   1.841   1.957   2.110   2.037   2.182   2.413
65    E         0.446   0.204   0.176   0.846   0.573   0.544   0.423   0.063  -0.008
66    A         0.446   0.440   0.226   0.860   0.815   0.520   0.423   0.396   0.071
67    F         1.129   1.296   1.050   1.403   1.593   1.327   1.168   1.430   0.981
68    R        -0.008  -0.032   0.071  -0.495  -0.531  -0.374  -0.322  -0.314  -0.185
69    E        -0.997  -1.006  -0.943  -1.132  -1.029  -0.878  -0.943  -0.934  -0.826
70    G         1.129   1.020   1.002   1.296   1.172   1.138   1.168   0.969   0.889
71    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
72    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
73    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
74    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
75    G         1.129   1.319   1.051   1.256   1.478   1.127   1.168   1.464   0.983
76    L         1.846   1.939   2.070   1.932   2.048   2.203   2.037   2.182   2.413
77    K        -0.197  -0.383  -0.430  -0.700  -0.929  -0.921  -0.198  -0.435  -0.489
78    R         0.446   0.420   0.224  -0.111  -0.116  -0.322   0.423   0.369   0.067
79    P         1.846   1.939   2.070   2.143   2.273   2.417   2.037   2.182   2.413
80    I         1.129   1.020   1.002   1.556   1.440   1.381   1.168   0.969   0.889
81    L         1.129   1.020   1.002   1.388   1.264   1.231   1.168   0.969   0.889
82    V         0.446   0.204   0.176   0.916   0.642   0.594   0.423   0.063  -0.008
83    K         0.776   0.679   0.771  -0.112  -0.261  -0.163   0.547   0.317   0.417
84    H         0.776   0.679   0.771   1.127   0.949   1.038   0.547   0.317   0.417
85    K         1.129   1.020   1.002   0.418   0.332   0.282   1.168   0.969   0.889
86    R        -0.997  -1.050  -0.967  -1.063  -1.070  -0.846  -0.943  -0.964  -0.845
87    D         1.129   1.049   1.020   1.293   1.243   1.168   1.168   1.021   0.922
88    K        -0.008  -0.032   0.071  -0.340  -0.263  -0.193  -0.322  -0.314  -0.185
89    K         0.446   0.204   0.176  -0.097  -0.325  -0.334   0.423   0.063  -0.008
90    G         1.846   1.939   2.070   1.841   1.957   2.110   2.037   2.182   2.413
91    L         1.129   1.020   1.002   1.402   1.291   1.262   1.168   0.969   0.889
92    G         1.846   1.939   2.070   1.841   1.957   2.110   2.037   2.182   2.413
93    N        -1.327  -1.320  -1.311  -0.348  -0.347  -0.316  -1.067  -1.047  -0.984
94    A        -0.543  -0.665  -0.522  -0.467  -0.745  -0.600  -0.695  -0.790  -0.612
95    P        -0.584  -0.405  -0.491  -0.028   0.167   0.091  -0.720  -0.485  -0.571
96    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
97    G         0.894   1.071   0.934   1.229   1.473   1.224   0.766   1.059   0.753
98    N        -0.462  -0.521  -0.491   0.024  -0.044  -0.041  -0.571  -0.637  -0.576
99    D        -0.197  -0.359  -0.434   0.273   0.105   0.016  -0.198  -0.408  -0.493
100   G        -0.667  -0.555  -0.521  -0.442  -0.332  -0.231  -0.819  -0.681  -0.612
101   E         0.527   0.617   0.754   0.425   0.550   0.700   0.050   0.190   0.381
102   A         0.133   0.081   0.063   0.599   0.501   0.528  -0.074  -0.194  -0.201
103   W         1.846   1.939   2.070   2.140   2.269   2.414   2.037   2.182   2.413
104   W         1.846   1.939   2.070   2.140   2.269   2.414   2.037   2.182   2.413
105   E         0.446   0.204   0.176   0.776   0.464   0.397   0.423   0.063  -0.008
106   R        -0.462  -0.608  -0.505  -0.334  -0.507  -0.492  -0.571  -0.713  -0.590
107   L        -0.197  -0.359  -0.434   0.374   0.162   0.108  -0.198  -0.408  -0.493
108   F         1.846   1.939   2.070   2.126   2.255   2.400   2.037   2.182   2.413
109   D         1.129   1.049   1.020   1.247   1.172   1.069   1.168   1.021   0.922
110   G         0.446   0.204   0.176   0.748   0.445   0.398   0.423   0.063  -0.008
111   H        -0.197  -0.166  -0.378   0.370   0.308   0.028  -0.198  -0.162  -0.421
112   L         1.846   1.939   2.070   1.932   2.048   2.203   2.037   2.182   2.413
113   K         0.133   0.202   0.120  -0.406  -0.310  -0.335  -0.074   0.004  -0.110
114   N         0.446   0.204   0.176   0.901   0.574   0.477   0.423   0.063  -0.008
115   L         1.129   1.049   1.020   1.402   1.326   1.284   1.168   1.021   0.922
116   D        -0.008  -0.039   0.057   0.123   0.127   0.235  -0.322  -0.335  -0.213
117   V         0.446   0.403   0.236   0.916   0.861   0.673   0.423   0.347   0.086
118   S        -0.667  -0.584  -0.540  -0.937  -0.769  -0.764  -0.819  -0.716  -0.633
119   T        -0.997  -0.963  -0.946  -0.672  -0.759  -0.728  -0.943  -0.888  -0.826
120   D        -0.462  -0.299  -0.435  -0.366  -0.092  -0.417  -0.571  -0.348  -0.504
121   S        -0.133  -0.161  -0.039  -0.091  -0.143   0.024  -0.446  -0.492  -0.340
122   N        -0.997  -0.930  -0.917  -1.252  -1.235  -1.138  -0.943  -0.842  -0.795
123   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
124   N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
125   G         0.894   0.797   0.872   0.995   0.849   0.924   0.766   0.553   0.627
126   S        -1.781  -1.741  -1.651  -1.429  -1.476  -1.300  -1.316  -1.257  -1.121
127   I        -0.008  -0.082   0.047   0.371   0.277   0.433  -0.322  -0.399  -0.229
128   K        -0.997  -0.959  -0.956  -0.814  -0.746  -0.807  -0.943  -0.896  -0.837
129   F         0.446   0.204   0.176   1.038   0.747   0.680   0.423   0.063  -0.008
130   T        -0.667  -0.592  -0.555  -0.953  -0.697  -0.642  -0.819  -0.732  -0.650
131   Q        -0.462  -0.435  -0.497   0.077  -0.011  -0.014  -0.571  -0.562  -0.586
132   N         0.446   0.404   0.223   0.773   0.653   0.296   0.423   0.349   0.066
133   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
134   E         0.027   0.083   0.039   0.133   0.149   0.074  -0.234  -0.193  -0.235
135   A        -0.997  -0.944  -0.914  -0.603  -0.543  -0.557  -0.943  -0.857  -0.792
136   V         1.846   1.939   2.070   1.977   2.100   2.248   2.037   2.182   2.413
137   A        -0.997  -1.091  -0.978  -0.465  -0.628  -0.459  -0.943  -1.004  -0.857
138   T        -0.997  -0.978  -0.934  -0.779  -0.716  -0.779  -0.943  -0.892  -0.813
139   A        -1.451  -1.460  -1.339  -1.211  -1.329  -1.121  -1.192  -1.168  -1.009
140   V        -0.462  -0.542  -0.490   0.097  -0.001   0.087  -0.571  -0.658  -0.576
141   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
142   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
143   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
144   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
145   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
146   S        -1.480  -1.470  -1.365  -0.718  -0.668  -0.506  -1.207  -1.172  -1.028
147   K        -0.197  -0.359  -0.434  -0.671  -0.864  -0.867  -0.198  -0.408  -0.493
148   S        -0.792  -0.901  -0.919  -0.638  -0.932  -0.955  -0.695  -0.807  -0.794
149   S        -1.451  -1.406  -1.330  -0.778  -0.684  -0.577  -1.192  -1.121  -1.002
150   S         1.129   1.020   1.002   1.161   1.017   0.976   1.168   0.969   0.889
151   P         0.446   0.204   0.176   1.035   0.731   0.653   0.423   0.063  -0.008
152   L         1.846   1.939   2.070   1.932   2.048   2.203   2.037   2.182   2.413
153   Y         1.129   1.049   1.020   1.549   1.454   1.369   1.168   1.021   0.922
154   R        -0.792  -0.884  -0.909  -0.299  -0.495  -0.586  -0.695  -0.791  -0.782
155   W        -0.667  -0.681  -0.549  -0.146  -0.202  -0.035  -0.819  -0.806  -0.643
156   F         1.846   1.939   2.070   2.126   2.255   2.400   2.037   2.182   2.413
157   V         1.129   1.049   1.020   1.432   1.351   1.298   1.168   1.021   0.922
158   K         0.133   0.010   0.074  -0.429  -0.503  -0.360  -0.074  -0.251  -0.183
159   G         1.129   1.049   1.020   1.296   1.211   1.164   1.168   1.021   0.922
160   E        -0.462  -0.403  -0.450  -0.016   0.022   0.004  -0.571  -0.482  -0.524
161   G         0.446   0.430   0.257   0.763   0.739   0.537   0.423   0.390   0.119
162   L         1.846   1.939   2.070   1.932   2.048   2.203   2.037   2.182   2.413
163   K        -0.008  -0.066   0.051  -0.476  -0.394  -0.209  -0.322  -0.380  -0.223
164   G         1.846   1.939   2.070   1.841   1.957   2.110   2.037   2.182   2.413
165   T         1.846   1.939   2.070   2.003   2.111   2.275   2.037   2.182   2.413
166   I        -0.008  -0.066   0.051   0.394   0.334   0.475  -0.322  -0.380  -0.223
167   T        -0.997  -0.845  -0.941  -0.831  -0.639  -0.837  -0.943  -0.793  -0.825
168   N        -1.451  -1.389  -1.332  -1.457  -1.405  -1.200  -1.192  -1.113  -1.004
169   L        -0.997  -0.928  -0.939  -0.824  -0.716  -0.850  -0.943  -0.857  -0.819
170   G        -1.781  -1.683  -1.639  -1.298  -1.175  -1.145  -1.316  -1.210  -1.113
171   K        -1.781  -1.730  -1.658  -1.208  -1.136  -1.123  -1.316  -1.250  -1.127
172   K        -1.781  -1.730  -1.658  -1.408  -1.328  -1.333  -1.316  -1.250  -1.127
173   E        -0.792  -0.739  -0.858  -1.150  -1.120  -1.133  -0.695  -0.626  -0.728
174   E        -0.997  -1.007  -0.950  -0.600  -0.677  -0.537  -0.943  -0.936  -0.832
175   A        -1.327  -1.358  -1.307  -1.071  -1.118  -1.107  -1.067  -1.078  -0.980
176   S        -0.792  -0.712  -0.856  -0.564  -0.447  -0.725  -0.695  -0.594  -0.726
177   F        -0.792  -0.728  -0.861  -0.100  -0.080  -0.195  -0.695  -0.611  -0.731
178   V        -1.327  -1.390  -1.324  -0.808  -0.903  -0.892  -1.067  -1.104  -0.994
179   V        -0.667  -0.604  -0.543  -0.225  -0.159  -0.056  -0.819  -0.732  -0.637
180   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
181   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
182   S        -1.327  -1.225  -1.268  -1.105  -0.970  -1.088  -1.067  -0.952  -0.945
183   S        -1.781  -1.748  -1.648  -1.463  -1.343  -1.312  -1.316  -1.261  -1.120
184   A        -0.667  -0.585  -0.547  -0.445  -0.344  -0.284  -0.819  -0.720  -0.642
185   S        -0.997  -0.968  -0.947  -1.460  -1.354  -1.249  -0.943  -0.903  -0.829
186   S        -0.197  -0.243  -0.399   0.115   0.025  -0.135  -0.198  -0.256  -0.449
187   S        -1.122  -1.010  -0.976  -1.139  -1.073  -0.971  -1.067  -0.944  -0.858
188   K         0.133   0.283   0.147  -0.535  -0.352  -0.493  -0.074   0.145  -0.063
189   G        -1.122  -1.039  -0.976  -0.682  -0.595  -0.484  -1.067  -0.969  -0.859
190   K        -0.997  -0.978  -0.934  -1.383  -1.374  -1.201  -0.943  -0.892  -0.813
191   K        -0.584  -0.522  -0.522  -1.004  -0.780  -0.761  -0.720  -0.647  -0.613
192   R        -0.584  -0.473  -0.479  -1.030  -0.903  -0.863  -0.720  -0.585  -0.563
193   R        -0.584  -0.430  -0.472  -0.933  -0.836  -0.788  -0.720  -0.509  -0.546
194   R        -1.103  -1.062  -0.975  -1.079  -0.906  -0.810  -1.045  -0.980  -0.854
195   R        -1.103  -1.052  -0.972  -1.122  -1.025  -0.879  -1.045  -0.971  -0.851
196   D        -0.584  -0.544  -0.485  -0.591  -0.509  -0.559  -0.720  -0.645  -0.563
197   E        -1.103  -1.124  -1.000  -1.038  -1.210  -1.001  -1.045  -1.036  -0.877
198   D        -1.124  -1.050  -0.968  -0.663  -0.583  -0.473  -1.054  -0.954  -0.843
199   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
200   D         0.635   0.797   0.844   0.470   0.695   0.718   0.271   0.553   0.571
201   N        -1.124  -1.044  -0.975  -0.536  -0.477  -0.363  -1.054  -0.952  -0.851
202   K         0.027   0.173   0.099  -0.491  -0.333  -0.341  -0.234  -0.012  -0.140
203   V        -1.103  -1.124  -1.000  -0.744  -0.900  -0.705  -1.045  -1.036  -0.877
204   K         0.331   0.357   0.221  -0.351  -0.308  -0.528   0.253   0.282   0.062
205   R        -1.124  -1.112  -0.998  -1.055  -1.101  -0.963  -1.054  -1.018  -0.873
206   K        -0.584  -0.618  -0.526  -1.169  -1.142  -0.954  -0.720  -0.746  -0.617
207   K         1.065   1.187   1.026   0.345   0.506   0.294   1.064   1.256   0.934
208   L        -1.480  -1.444  -1.359  -1.312  -1.416  -1.191  -1.207  -1.152  -1.024
209   K         0.446   0.363   0.221  -0.211  -0.299  -0.530   0.423   0.293   0.062
210   K         0.776   0.885   0.865  -0.112   0.042  -0.052   0.547   0.723   0.613
211   D        -0.197  -0.383  -0.430   0.047  -0.286  -0.405  -0.198  -0.435  -0.489
212   K         0.446   0.363   0.221  -0.147  -0.221  -0.396   0.423   0.293   0.062
213   K         1.129   1.020   1.002   0.412   0.315   0.269   1.168   0.969   0.889
214   T        -1.327  -1.320  -1.311  -1.025  -1.183  -1.102  -1.067  -1.047  -0.984
215   S        -0.197  -0.203  -0.386  -0.699  -0.683  -0.885  -0.198  -0.208  -0.432
216   N        -0.667  -0.672  -0.541  -0.982  -0.930  -0.742  -0.819  -0.790  -0.634
217   D         0.027   0.049   0.059   0.216   0.239   0.255  -0.234  -0.215  -0.205
218   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
219   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
220   S         0.446   0.631   0.286  -0.211   0.030  -0.446   0.423   0.697   0.164
221   K         1.129   1.049   1.020   0.396   0.330   0.254   1.168   1.021   0.922
222   K         0.446   0.682   0.290  -0.162   0.130  -0.349   0.423   0.770   0.171
223   K         0.446   0.376   0.222  -0.156  -0.226  -0.415   0.423   0.310   0.064
224   K        -0.197  -0.243  -0.399  -0.732  -0.785  -0.958  -0.198  -0.256  -0.449
225   K        -0.543  -0.559  -0.495  -1.057  -1.133  -1.028  -0.695  -0.684  -0.584
226   K         1.846   1.939   2.070   0.962   1.098   1.216   2.037   2.182   2.413
227   K         0.446   0.204   0.176  -0.121  -0.368  -0.385   0.423   0.063  -0.008
228   S        -0.462  -0.534  -0.489  -0.187  -0.295  -0.186  -0.571  -0.647  -0.575
229   K         1.129   1.278   1.058   0.430   0.620   0.370   1.168   1.400   0.995
230   K        -0.197  -0.194  -0.370  -0.775  -0.742  -1.008  -0.198  -0.191  -0.411
231   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
232   S        -0.197  -0.203  -0.386   0.166   0.178  -0.112  -0.198  -0.208  -0.432
233   K         1.129   1.049   1.020   0.359   0.274   0.173   1.168   1.021   0.922
234   K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
235   G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
236   K        -0.065   0.046   0.045  -0.558  -0.323  -0.302  -0.396  -0.242  -0.228
237   K        -0.584  -0.483  -0.508  -1.237  -1.128  -1.121  -0.720  -0.573  -0.593
238   S        -0.584  -0.614  -0.529  -1.158  -1.135  -0.998  -0.720  -0.735  -0.617
239   K         1.065   0.901   0.936   0.346   0.174   0.199   1.064   0.752   0.759
240   H        -1.103  -1.121  -1.000  -0.558  -0.565  -0.428  -1.045  -1.033  -0.876
241   S         0.331   0.503   0.204  -0.273  -0.047  -0.405   0.253   0.512   0.037
242   S        -0.349  -0.416  -0.476  -0.831  -0.856  -0.874  -0.396  -0.487  -0.546
243   D         0.894   0.773   0.850   0.998   0.841   0.905   0.766   0.506   0.583
244   E        -0.161  -0.089  -0.001  -0.672  -0.474  -0.365  -0.506  -0.399  -0.286
245   G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
246   D        -1.216  -1.167  -1.031  -1.103  -0.962  -0.882  -1.142  -1.069  -0.904
247   K         0.446   0.403   0.241  -0.186  -0.213  -0.453   0.423   0.353   0.094
248   S        -0.997  -1.084  -0.964  -0.882  -0.944  -0.926  -0.943  -0.998  -0.845
249   K         1.129   1.020   1.002   0.389   0.281   0.216   1.168   0.969   0.889
250   H        -0.161  -0.075   0.005   0.155   0.252   0.351  -0.506  -0.380  -0.279
251   K         0.038   0.185   0.126  -0.560  -0.389  -0.456  -0.188   0.033  -0.086
252   K        -0.197  -0.394  -0.432  -0.631  -0.813  -0.792  -0.198  -0.448  -0.491
253   S        -0.792  -0.889  -0.911  -0.483  -0.697  -0.755  -0.695  -0.796  -0.784
254   K        -0.197  -0.220  -0.382  -0.744  -0.748  -0.964  -0.198  -0.222  -0.426
255   K        -0.197  -0.220  -0.382  -0.721  -0.728  -0.921  -0.198  -0.222  -0.426
256   S         0.133   0.093   0.099   0.240   0.218   0.140  -0.074  -0.109  -0.141
257   K         1.129   1.020   1.002   0.412   0.315   0.269   1.168   0.969   0.889
258   K        -0.792  -0.930  -0.931  -1.077  -1.172  -1.034  -0.695  -0.836  -0.805
259   H        -0.197  -0.345  -0.427   0.221   0.025  -0.071  -0.198  -0.394  -0.485
260   K         1.129   1.248   1.046   0.396   0.558   0.287   1.168   1.353   0.973
261   K         0.776   0.885   0.865  -0.043   0.107   0.043   0.547   0.723   0.613
262   E        -0.518  -0.472  -0.465  -0.522  -0.466  -0.576  -0.612  -0.541  -0.533
263   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
264   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
265   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
266   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
267   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
268   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
269   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
270   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
271   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
272   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
273   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
274   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
275   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
276   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
277   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
278   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
279   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
280   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
281   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
282   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
283   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
284   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
285   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
286   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
287   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
288   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
289   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
290   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
291   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
292   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
293   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
294   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
295   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
296   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
297   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
298   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
299   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
300   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
301   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
302   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
303   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
304   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
305   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
306   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
307   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
308   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
309   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
310   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
311   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
312   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
313   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
314   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
315   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
316   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
317   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
318   S        -0.079  -0.042   0.051  -0.342  -0.329  -0.284  -0.391  -0.327  -0.213
319   A        -1.781  -1.775  -1.665  -1.245  -1.441  -1.157  -1.316  -1.279  -1.131
320   R        -0.792  -0.732  -0.596  -1.013  -0.881  -0.734  -0.943  -0.859  -0.692
321   R        -0.997  -0.959  -0.945  -1.274  -1.174  -1.057  -0.943  -0.895  -0.828
322   D        -0.462  -0.368  -0.456  -1.020  -0.888  -0.962  -0.571  -0.461  -0.534
323   R        -0.008   0.120   0.070  -0.597  -0.454  -0.476  -0.322  -0.170  -0.198
324   K         1.129   1.020   1.002   0.409   0.312   0.262   1.168   0.969   0.889
325   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
326   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
327   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
328   E        -1.327  -1.227  -1.274  -0.792  -0.702  -0.707  -1.067  -0.950  -0.950
329   H        -1.327  -1.215  -1.282  -1.601  -1.492  -1.425  -1.067  -0.942  -0.958
330   I        -1.122  -1.005  -0.972  -0.911  -0.877  -0.725  -1.067  -0.943  -0.855
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/Q03525
Output conservation file - output/Q03525
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
