1     M        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
2     H        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
3     M         1.956   1.957   1.976   2.318   2.318   2.349   2.120   2.121   2.146
4     Q         0.227   0.225   0.192   0.358   0.351   0.298   0.111   0.107   0.053
5     L         1.956   1.957   1.976   1.726   1.725   1.756   2.120   2.121   2.146
6     R         1.956   1.957   1.976   2.080   2.079   2.111   2.120   2.121   2.146
7     K         0.227   0.218   0.189   0.039   0.022  -0.017   0.111   0.096   0.048
8     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
9     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
10    R         1.956   1.957   1.976   2.080   2.079   2.111   2.120   2.121   2.146
11    K         0.227   0.218   0.189  -0.132  -0.152  -0.208   0.111   0.096   0.048
12    R         0.227   0.225   0.192   0.200   0.193   0.124   0.111   0.107   0.053
13    V         0.227   0.218   0.189   0.380   0.370   0.312   0.111   0.096   0.048
14    D        -1.028  -1.027  -1.017  -0.898  -0.884  -0.879  -0.894  -0.893  -0.874
15    Y         0.227   0.218   0.189   0.570   0.555   0.511   0.111   0.096   0.048
16    S         0.227   0.218   0.189   0.080   0.064   0.020   0.111   0.096   0.048
17    G        -1.028  -1.027  -1.017  -0.646  -0.646  -0.626  -0.894  -0.893  -0.874
18    R        -1.028  -1.027  -1.017  -1.190  -1.197  -1.172  -0.894  -0.893  -0.874
19    N         0.227   0.225   0.192   0.065   0.058  -0.008   0.111   0.107   0.053
20    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
21    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
22    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
23    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
24    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
25    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
26    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
27    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
28    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
29    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
30    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
31    Q         0.227   0.218   0.189   0.312   0.294   0.240   0.111   0.096   0.048
32    T         0.227   0.225   0.192   0.283   0.278   0.224   0.111   0.107   0.053
33    S         0.227   0.225   0.192   0.077   0.078   0.021   0.111   0.107   0.053
34    D        -1.028  -1.027  -1.017  -1.092  -1.086  -1.073  -0.894  -0.893  -0.874
35    P         0.227   0.218   0.189   0.247   0.230   0.177   0.111   0.096   0.048
36    P         0.227   0.218   0.189   0.294   0.277   0.230   0.111   0.096   0.048
37    S        -1.028  -1.027  -1.017  -0.912  -0.901  -0.893  -0.894  -0.893  -0.874
38    T        -1.028  -1.027  -1.017  -0.831  -0.829  -0.811  -0.894  -0.893  -0.874
39    T        -1.028  -1.027  -1.017  -0.893  -0.890  -0.874  -0.894  -0.893  -0.874
40    T        -1.028  -1.027  -1.017  -1.148  -1.153  -1.130  -0.894  -0.893  -0.874
41    A        -1.028  -1.027  -1.017  -1.016  -1.021  -0.997  -0.894  -0.893  -0.874
42    A        -1.028  -1.027  -1.017  -0.932  -0.927  -0.913  -0.894  -0.893  -0.874
43    V         1.956   1.957   1.976   2.134   2.142   2.165   2.120   2.121   2.146
44    P        -1.028  -1.027  -1.017  -1.222  -1.227  -1.204  -0.894  -0.893  -0.874
45    S        -1.028  -1.027  -1.017  -1.041  -1.030  -1.022  -0.894  -0.893  -0.874
46    I        -1.028  -1.027  -1.017  -1.081  -1.083  -1.063  -0.894  -0.893  -0.874
47    I        -1.028  -1.027  -1.017  -0.696  -0.689  -0.676  -0.894  -0.893  -0.874
48    V        -1.028  -1.027  -1.017  -1.159  -1.160  -1.141  -0.894  -0.893  -0.874
49    P         0.227   0.218   0.189   0.294   0.277   0.230   0.111   0.096   0.048
50    K         0.227   0.225   0.192   0.050   0.044   0.001   0.111   0.107   0.053
51    K         0.227   0.218   0.189   0.016  -0.001  -0.042   0.111   0.096   0.048
52    -         0.074   0.074   0.088  -0.091  -0.092  -0.069  -0.141  -0.140  -0.119
53    -         0.074   0.074   0.088   0.022   0.029   0.044  -0.141  -0.140  -0.119
54    -         1.956   1.957   1.976   2.091   2.091   2.121   2.120   2.121   2.146
55    -         0.074   0.074   0.088   0.299   0.307   0.323  -0.141  -0.140  -0.119
56    -         0.074   0.074   0.088  -0.035  -0.027  -0.012  -0.141  -0.140  -0.119
57    -         0.074   0.074   0.088  -0.166  -0.167  -0.143  -0.141  -0.140  -0.119
58    -         0.074   0.074   0.088   0.299   0.300   0.323  -0.141  -0.140  -0.119
59    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
60    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
61    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
62    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
63    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
64    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
65    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
66    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
67    -         0.074   0.074   0.088  -0.067  -0.068  -0.044  -0.141  -0.140  -0.119
68    -         0.074   0.074   0.088   0.186   0.186   0.209  -0.141  -0.140  -0.119
69    R        -1.028  -1.027  -1.017  -1.041  -1.046  -1.022  -0.894  -0.893  -0.874
70    K         0.227   0.241   0.201   0.200   0.223   0.142   0.111   0.132   0.067
71    V         0.227   0.225   0.192   0.251   0.251   0.174   0.111   0.107   0.053
72    V         0.227   0.241   0.201   0.491   0.517   0.449   0.111   0.132   0.067
73    A        -1.028  -1.027  -1.017  -0.859  -0.857  -0.840  -0.894  -0.893  -0.874
74    Q         0.227   0.225   0.192   0.222   0.214   0.145   0.111   0.107   0.053
75    N        -1.028  -1.027  -1.017  -0.932  -0.923  -0.913  -0.894  -0.893  -0.874
76    M         0.227   0.241   0.201   0.351   0.368   0.320   0.111   0.132   0.067
77    V        -1.028  -1.027  -1.017  -1.026  -1.026  -1.007  -0.894  -0.893  -0.874
78    S        -1.028  -1.027  -1.017  -1.071  -1.064  -1.053  -0.894  -0.893  -0.874
79    P         0.227   0.218   0.189   0.283   0.274   0.217   0.111   0.096   0.048
80    A        -1.028  -1.027  -1.017  -0.788  -0.792  -0.769  -0.894  -0.893  -0.874
81    I        -1.028  -1.027  -1.017  -1.092  -1.084  -1.073  -0.894  -0.893  -0.874
82    R        -1.028  -1.027  -1.017  -1.041  -1.046  -1.022  -0.894  -0.893  -0.874
83    A        -1.028  -1.027  -1.017  -0.937  -0.940  -0.918  -0.894  -0.893  -0.874
84    T        -1.028  -1.027  -1.017  -0.664  -0.657  -0.644  -0.894  -0.893  -0.874
85    T        -1.028  -1.027  -1.017  -0.855  -0.854  -0.835  -0.894  -0.893  -0.874
86    T        -1.028  -1.027  -1.017  -0.907  -0.910  -0.888  -0.894  -0.893  -0.874
87    T        -1.028  -1.027  -1.017  -0.807  -0.803  -0.788  -0.894  -0.893  -0.874
88    L        -1.028  -1.027  -1.017  -0.903  -0.899  -0.883  -0.894  -0.893  -0.874
89    G         1.956   1.957   1.976   2.333   2.334   2.364   2.120   2.121   2.146
90    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
91    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
92    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
93    T        -1.028  -1.027  -1.017  -0.912  -0.913  -0.893  -0.894  -0.893  -0.874
94    S         0.227   0.218   0.189   0.080   0.064   0.020   0.111   0.096   0.048
95    N        -1.028  -1.027  -1.017  -0.845  -0.845  -0.826  -0.894  -0.893  -0.874
96    I        -1.028  -1.027  -1.017  -0.807  -0.805  -0.788  -0.894  -0.893  -0.874
97    I         0.227   0.218   0.189   0.214   0.197   0.151   0.111   0.096   0.048
98    I        -1.028  -1.027  -1.017  -1.133  -1.135  -1.114  -0.894  -0.893  -0.874
99    P        -1.028  -1.027  -1.017  -1.276  -1.282  -1.258  -0.894  -0.893  -0.874
100   K         0.227   0.241   0.201  -0.136  -0.115  -0.188   0.111   0.132   0.067
101   P        -1.028  -1.027  -1.017  -1.081  -1.086  -1.063  -0.894  -0.893  -0.874
102   L        -1.028  -1.027  -1.017  -0.986  -0.979  -0.967  -0.894  -0.893  -0.874
103   Q        -1.028  -1.027  -1.017  -0.981  -0.987  -0.962  -0.894  -0.893  -0.874
104   R         1.956   1.957   1.976   2.080   2.079   2.111   2.120   2.121   2.146
105   P         1.956   1.957   1.976   2.033   2.033   2.063   2.120   2.121   2.146
106   K        -1.028  -1.027  -1.017  -1.217  -1.217  -1.199  -0.894  -0.893  -0.874
107   F         0.227   0.218   0.189   0.587   0.579   0.528   0.111   0.096   0.048
108   H         0.227   0.241   0.201   0.298   0.316   0.263   0.111   0.132   0.067
109   N         0.074   0.074   0.088  -0.049  -0.049  -0.026  -0.141  -0.140  -0.119
110   S         0.074   0.074   0.088   0.009   0.009   0.031  -0.141  -0.140  -0.119
111   A         0.074   0.074   0.088  -0.032  -0.032  -0.010  -0.141  -0.140  -0.119
112   S         0.074   0.074   0.088  -0.226  -0.227  -0.204  -0.141  -0.140  -0.119
113   L         0.074   0.074   0.088  -0.057  -0.057  -0.035  -0.141  -0.140  -0.119
114   S         0.074   0.074   0.088  -0.393  -0.394  -0.372  -0.141  -0.140  -0.119
115   S         0.074   0.074   0.088  -0.024  -0.024  -0.001  -0.141  -0.140  -0.119
116   P         1.956   1.957   1.976   2.033   2.033   2.063   2.120   2.121   2.146
117   D        -1.028  -1.027  -1.017  -0.855  -0.848  -0.835  -0.894  -0.893  -0.874
118   D         0.227   0.225   0.192   0.276   0.284   0.217   0.111   0.107   0.053
119   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
120   -         1.956   1.957   1.976   1.768   1.767   1.798   2.120   2.121   2.146
121   -         0.074   0.074   0.088  -0.191  -0.192  -0.169  -0.141  -0.140  -0.119
122   -         0.074   0.074   0.088   0.163   0.162   0.186  -0.141  -0.140  -0.119
123   -         0.074   0.074   0.088  -0.149  -0.150  -0.127  -0.141  -0.140  -0.119
124   -         1.956   1.957   1.976   1.970   1.970   2.001   2.120   2.121   2.146
125   -         1.956   1.957   1.976   2.240   2.241   2.272   2.120   2.121   2.146
126   D        -1.028  -1.027  -1.017  -0.976  -0.963  -0.957  -0.894  -0.893  -0.874
127   P         0.227   0.241   0.201   0.276   0.310   0.232   0.111   0.132   0.067
128   E        -1.028  -1.027  -1.017  -0.788  -0.789  -0.769  -0.894  -0.893  -0.874
129   K        -1.028  -1.027  -1.017  -0.917  -0.913  -0.898  -0.894  -0.893  -0.874
130   I         0.227   0.218   0.189   0.323   0.312   0.272   0.111   0.096   0.048
131   S         0.074   0.074   0.088  -0.090  -0.091  -0.068  -0.141  -0.140  -0.119
132   V         0.074   0.074   0.088   0.384   0.385   0.408  -0.141  -0.140  -0.119
133   L         0.074   0.074   0.088  -0.243  -0.244  -0.221  -0.141  -0.140  -0.119
134   E         0.074   0.074   0.088  -0.008  -0.008   0.015  -0.141  -0.140  -0.119
135   V         0.074   0.074   0.088   0.208   0.209   0.232  -0.141  -0.140  -0.119
136   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
137   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
138   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
139   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
140   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
141   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
142   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
143   Q        -1.028  -1.027  -1.017  -0.760  -0.757  -0.741  -0.894  -0.893  -0.874
144   K        -1.028  -1.027  -1.017  -1.133  -1.133  -1.114  -0.894  -0.893  -0.874
145   N        -1.028  -1.027  -1.017  -1.092  -1.093  -1.073  -0.894  -0.893  -0.874
146   L         0.227   0.218   0.189   0.118   0.108   0.073   0.111   0.096   0.048
147   S        -1.028  -1.027  -1.017  -1.061  -1.060  -1.042  -0.894  -0.893  -0.874
148   N        -1.028  -1.027  -1.017  -1.148  -1.141  -1.130  -0.894  -0.893  -0.874
149   L         1.956   1.957   1.976   1.726   1.725   1.756   2.120   2.121   2.146
150   I         0.227   0.225   0.192   0.298   0.293   0.249   0.111   0.107   0.053
151   K         0.227   0.218   0.189   0.020   0.002  -0.038   0.111   0.096   0.048
152   R        -1.028  -1.027  -1.017  -0.903  -0.902  -0.883  -0.894  -0.893  -0.874
153   Q         1.956   1.957   1.976   2.103   2.102   2.134   2.120   2.121   2.146
154   Q        -1.028  -1.027  -1.017  -0.855  -0.858  -0.835  -0.894  -0.893  -0.874
155   R        -1.028  -1.027  -1.017  -0.864  -0.867  -0.845  -0.894  -0.893  -0.874
156   L         1.956   1.957   1.976   1.726   1.725   1.756   2.120   2.121   2.146
157   F         0.227   0.225   0.192   0.587   0.589   0.533   0.111   0.107   0.053
158   Y         0.227   0.218   0.189   0.580   0.569   0.522   0.111   0.096   0.048
159   K         0.227   0.218   0.189  -0.030  -0.048  -0.094   0.111   0.096   0.048
160   D         0.227   0.218   0.189   0.174   0.168   0.097   0.111   0.096   0.048
161   I         0.227   0.218   0.189   0.077   0.056  -0.004   0.111   0.096   0.048
162   H         0.227   0.241   0.201   0.376   0.395   0.340   0.111   0.132   0.067
163   K         0.227   0.218   0.189  -0.093  -0.112  -0.164   0.111   0.096   0.048
164   P         1.956   1.957   1.976   2.033   2.033   2.063   2.120   2.121   2.146
165   T         0.227   0.241   0.201   0.294   0.313   0.250   0.111   0.132   0.067
166   L         0.227   0.241   0.201   0.348   0.372   0.288   0.111   0.132   0.067
167   A        -1.028  -1.027  -1.017  -0.903  -0.900  -0.883  -0.894  -0.893  -0.874
168   G         0.227   0.218   0.189   0.529   0.512   0.454   0.111   0.096   0.048
169   L        -1.028  -1.027  -1.017  -0.946  -0.942  -0.927  -0.894  -0.893  -0.874
170   K        -1.028  -1.027  -1.017  -1.092  -1.091  -1.073  -0.894  -0.893  -0.874
171   N         0.227   0.225   0.192   0.283   0.279   0.235   0.111   0.107   0.053
172   F         0.227   0.218   0.189   0.362   0.349   0.276   0.111   0.096   0.048
173   E         0.227   0.225   0.192   0.376   0.370   0.325   0.111   0.107   0.053
174   M        -1.028  -1.027  -1.017  -0.898  -0.904  -0.879  -0.894  -0.893  -0.874
175   L         0.227   0.218   0.189   0.118   0.108   0.073   0.111   0.096   0.048
176   R         0.227   0.241   0.201   0.039   0.056   0.001   0.111   0.132   0.067
177   L         0.227   0.218   0.189   0.111   0.096   0.065   0.111   0.096   0.048
178   P         1.956   1.957   1.976   2.033   2.033   2.063   2.120   2.121   2.146
179   N        -1.028  -1.027  -1.017  -1.102  -1.095  -1.083  -0.894  -0.893  -0.874
180   D         1.956   1.957   1.976   2.017   2.031   2.047   2.120   2.121   2.146
181   L        -1.028  -1.027  -1.017  -1.081  -1.081  -1.063  -0.894  -0.893  -0.874
182   K         0.227   0.241   0.201   0.251   0.282   0.193   0.111   0.132   0.067
183   L         0.227   0.241   0.201  -0.061  -0.040  -0.115   0.111   0.132   0.067
184   L         0.227   0.225   0.192   0.111   0.105   0.069   0.111   0.107   0.053
185   Q         0.227   0.225   0.192   0.254   0.247   0.182   0.111   0.107   0.053
186   N         0.227   0.218   0.189   0.200   0.183   0.136   0.111   0.096   0.048
187   I         1.956   1.957   1.976   1.954   1.953   1.984   2.120   2.121   2.146
188   V        -1.028  -1.027  -1.017  -1.016  -1.016  -0.997  -0.894  -0.893  -0.874
189   -         0.074   0.074   0.088  -0.166  -0.167  -0.143  -0.141  -0.140  -0.119
190   -         0.074   0.074   0.088  -0.067  -0.068  -0.044  -0.141  -0.140  -0.119
191   -         0.074   0.074   0.088  -0.216  -0.217  -0.194  -0.141  -0.140  -0.119
192   -         0.074   0.074   0.088   0.247   0.247   0.270  -0.141  -0.140  -0.119
193   N        -1.028  -1.027  -1.017  -1.086  -1.089  -1.068  -0.894  -0.893  -0.874
194   L         1.956   1.957   1.976   1.726   1.725   1.756   2.120   2.121   2.146
195   L         1.956   1.957   1.976   1.726   1.725   1.756   2.120   2.121   2.146
196   Y         0.074   0.074   0.088   0.285   0.294   0.309  -0.141  -0.140  -0.119
197   S         0.074   0.074   0.088  -0.049  -0.049  -0.026  -0.141  -0.140  -0.119
198   F         0.074   0.074   0.088   0.285   0.286   0.309  -0.141  -0.140  -0.119
199   E         0.227   0.218   0.189   0.298   0.279   0.233   0.111   0.096   0.048
200   Q        -1.028  -1.027  -1.017  -0.917  -0.911  -0.898  -0.894  -0.893  -0.874
201   L         1.956   1.957   1.976   1.726   1.725   1.756   2.120   2.121   2.146
202   N         0.227   0.225   0.192   0.207   0.200   0.150   0.111   0.107   0.053
203   S        -1.028  -1.027  -1.017  -1.227  -1.230  -1.209  -0.894  -0.893  -0.874
204   D         0.227   0.241   0.201   0.196   0.222   0.153   0.111   0.132   0.067
205   S        -1.028  -1.027  -1.017  -1.081  -1.079  -1.063  -0.894  -0.893  -0.874
206   K        -1.028  -1.027  -1.017  -1.148  -1.137  -1.130  -0.894  -0.893  -0.874
207   T         0.227   0.225   0.192   0.181   0.175   0.110   0.111   0.107   0.053
208   R        -1.028  -1.027  -1.017  -0.831  -0.824  -0.811  -0.894  -0.893  -0.874
209   P        -1.028  -1.027  -1.017  -1.276  -1.282  -1.258  -0.894  -0.893  -0.874
210   V        -1.028  -1.027  -1.017  -1.206  -1.209  -1.188  -0.894  -0.893  -0.874
211   T        -1.028  -1.027  -1.017  -0.765  -0.766  -0.745  -0.894  -0.893  -0.874
212   T        -1.028  -1.027  -1.017  -1.281  -1.288  -1.263  -0.894  -0.893  -0.874
213   S        -1.028  -1.027  -1.017  -1.227  -1.229  -1.209  -0.894  -0.893  -0.874
214   K         0.227   0.225   0.192   0.012   0.006  -0.042   0.111   0.107   0.053
215   L        -1.028  -1.027  -1.017  -1.086  -1.084  -1.068  -0.894  -0.893  -0.874
216   K        -1.028  -1.027  -1.017  -1.270  -1.274  -1.253  -0.894  -0.893  -0.874
217   A        -1.028  -1.027  -1.017  -0.714  -0.714  -0.694  -0.894  -0.893  -0.874
218   S         0.227   0.218   0.189   0.088   0.070   0.029   0.111   0.096   0.048
219   S        -1.028  -1.027  -1.017  -0.932  -0.920  -0.913  -0.894  -0.893  -0.874
220   Q         0.227   0.225   0.192   0.358   0.351   0.298   0.111   0.107   0.053
221   A         0.227   0.218   0.189   0.450   0.433   0.381   0.111   0.096   0.048
222   H         0.074   0.074   0.088   0.203   0.210   0.226  -0.141  -0.140  -0.119
223   S         0.074   0.074   0.088  -0.143  -0.146  -0.121  -0.141  -0.140  -0.119
224   D         0.074   0.074   0.088   0.000   0.007   0.023  -0.141  -0.140  -0.119
225   K         0.074   0.074   0.088  -0.238  -0.242  -0.216  -0.141  -0.140  -0.119
226   L         1.956   1.957   1.976   1.726   1.725   1.756   2.120   2.121   2.146
227   K         1.956   1.957   1.976   1.735   1.733   1.764   2.120   2.121   2.146
228   K        -1.028  -1.027  -1.017  -1.133  -1.132  -1.114  -0.894  -0.893  -0.874
229   M        -1.028  -1.027  -1.017  -0.946  -0.955  -0.927  -0.894  -0.893  -0.874
230   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
231   L        -1.028  -1.027  -1.017  -1.006  -1.003  -0.987  -0.894  -0.893  -0.874
232   A        -1.028  -1.027  -1.017  -0.606  -0.605  -0.585  -0.894  -0.893  -0.874
233   E        -1.028  -1.027  -1.017  -0.845  -0.847  -0.826  -0.894  -0.893  -0.874
234   R        -1.028  -1.027  -1.017  -0.864  -0.867  -0.845  -0.894  -0.893  -0.874
235   K        -1.028  -1.027  -1.017  -1.107  -1.103  -1.089  -0.894  -0.893  -0.874
236   P         0.074   0.074   0.088   0.074   0.073   0.097  -0.141  -0.140  -0.119
237   P         0.074   0.074   0.088   0.090   0.097   0.113  -0.141  -0.140  -0.119
238   F         1.956   1.957   1.976   2.283   2.284   2.314   2.120   2.121   2.146
239   S         0.074   0.074   0.088  -0.318  -0.322  -0.296  -0.141  -0.140  -0.119
240   H         0.074   0.074   0.088   0.107   0.122   0.130  -0.141  -0.140  -0.119
241   P         1.956   1.957   1.976   2.073   2.072   2.103   2.120   2.121   2.146
242   S         0.074   0.074   0.088  -0.417  -0.422  -0.396  -0.141  -0.140  -0.119
243   H         0.074   0.074   0.088   0.187   0.194   0.210  -0.141  -0.140  -0.119
244   S         1.956   1.957   1.976   1.773   1.771   1.803   2.120   2.121   2.146
245   G         0.074   0.074   0.088   0.025   0.023   0.048  -0.141  -0.140  -0.119
246   T         0.074   0.074   0.088  -0.247  -0.250  -0.225  -0.141  -0.140  -0.119
247   A         0.074   0.074   0.088   0.041   0.040   0.064  -0.141  -0.140  -0.119
248   Y         1.956   1.957   1.976   2.304   2.306   2.336   2.120   2.121   2.146
249   H        -1.028  -1.027  -1.017  -0.784  -0.787  -0.764  -0.894  -0.893  -0.874
250   N         0.227   0.218   0.189   0.203   0.187   0.140   0.111   0.096   0.048
251   D         1.956   1.957   1.976   2.017   2.031   2.047   2.120   2.121   2.146
252   I        -1.028  -1.027  -1.017  -0.850  -0.844  -0.830  -0.894  -0.893  -0.874
253   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
254   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
255   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
256   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
257   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
258   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
259   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
260   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
261   I         1.956   1.957   1.976   1.954   1.953   1.984   2.120   2.121   2.146
262   H         0.227   0.241   0.201   0.390   0.407   0.354   0.111   0.132   0.067
263   E        -1.028  -1.027  -1.017  -0.817  -0.819  -0.797  -0.894  -0.893  -0.874
264   I        -1.028  -1.027  -1.017  -0.883  -0.878  -0.864  -0.894  -0.893  -0.874
265   A         1.956   1.957   1.976   2.204   2.205   2.235   2.120   2.121   2.146
266   N        -1.028  -1.027  -1.017  -1.133  -1.138  -1.114  -0.894  -0.893  -0.874
267   L         0.227   0.218   0.189  -0.030  -0.048  -0.093   0.111   0.096   0.048
268   H         1.956   1.957   1.976   2.234   2.235   2.266   2.120   2.121   2.146
269   S        -1.028  -1.027  -1.017  -1.036  -1.027  -1.017  -0.894  -0.893  -0.874
270   I         1.956   1.957   1.976   1.954   1.953   1.984   2.120   2.121   2.146
271   N         0.227   0.225   0.192   0.196   0.197   0.138   0.111   0.107   0.053
272   L         0.227   0.241   0.201   0.077   0.099   0.021   0.111   0.132   0.067
273   V        -1.028  -1.027  -1.017  -0.961  -0.963  -0.942  -0.894  -0.893  -0.874
274   D         1.956   1.957   1.976   2.017   2.031   2.047   2.120   2.121   2.146
275   L         0.227   0.241   0.201   0.077   0.099   0.021   0.111   0.132   0.067
276   I        -1.028  -1.027  -1.017  -1.276  -1.281  -1.258  -0.894  -0.893  -0.874
277   N        -1.028  -1.027  -1.017  -0.917  -0.908  -0.898  -0.894  -0.893  -0.874
278   L         0.227   0.241   0.201   0.077   0.099   0.021   0.111   0.132   0.067
279   E         0.227   0.241   0.201   0.012   0.029  -0.027   0.111   0.132   0.067
280   V        -1.028  -1.027  -1.017  -0.850  -0.848  -0.830  -0.894  -0.893  -0.874
281   Y        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
282   N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
283   N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
284   N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
285   C        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
286   H        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
287   T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
288   N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
289   N         0.227   0.225   0.192   0.065   0.058  -0.008   0.111   0.107   0.053
290   T        -1.028  -1.027  -1.017  -0.956  -0.957  -0.937  -0.894  -0.893  -0.874
291   A        -1.028  -1.027  -1.017  -0.784  -0.787  -0.764  -0.894  -0.893  -0.874
292   L        -1.028  -1.027  -1.017  -1.066  -1.058  -1.048  -0.894  -0.893  -0.874
293   Q        -1.028  -1.027  -1.017  -0.879  -0.880  -0.859  -0.894  -0.893  -0.874
294   T         1.956   1.957   1.976   2.025   2.025   2.055   2.120   2.121   2.146
295   T         0.074   0.074   0.088  -0.247  -0.250  -0.225  -0.141  -0.140  -0.119
296   A         0.074   0.074   0.088   0.009   0.007   0.031  -0.141  -0.140  -0.119
297   N         0.074   0.074   0.088  -0.033  -0.035  -0.010  -0.141  -0.140  -0.119
298   S        -1.028  -1.027  -1.017  -0.927  -0.923  -0.908  -0.894  -0.893  -0.874
299   L         1.956   1.957   1.976   1.726   1.725   1.756   2.120   2.121   2.146
300   T        -1.028  -1.027  -1.017  -0.831  -0.831  -0.811  -0.894  -0.893  -0.874
301   L        -1.028  -1.027  -1.017  -0.971  -0.963  -0.952  -0.894  -0.893  -0.874
302   N         0.227   0.225   0.192   0.337   0.333   0.294   0.111   0.107   0.053
303   S         0.227   0.241   0.201   0.099   0.121   0.047   0.111   0.132   0.067
304   I        -1.028  -1.027  -1.017  -0.723  -0.722  -0.704  -0.894  -0.893  -0.874
305   I        -1.028  -1.027  -1.017  -1.138  -1.140  -1.120  -0.894  -0.893  -0.874
306   K         1.956   1.957   1.976   1.735   1.733   1.764   2.120   2.121   2.146
307   K         0.227   0.225   0.192  -0.093  -0.100  -0.158   0.111   0.107   0.053
308   L        -1.028  -1.027  -1.017  -1.092  -1.088  -1.073  -0.894  -0.893  -0.874
309   D         1.956   1.957   1.976   2.017   2.031   2.047   2.120   2.121   2.146
310   -         0.074   0.074   0.088   0.132   0.139   0.155  -0.141  -0.140  -0.119
311   -         0.074   0.074   0.088  -0.067  -0.068  -0.044  -0.141  -0.140  -0.119
312   -         0.074   0.074   0.088   0.132   0.131   0.155  -0.141  -0.140  -0.119
313   -         0.074   0.074   0.088   0.186   0.186   0.209  -0.141  -0.140  -0.119
314   -         0.074   0.074   0.088   0.037   0.037   0.060  -0.141  -0.140  -0.119
315   -         0.074   0.074   0.088  -0.002  -0.003   0.020  -0.141  -0.140  -0.119
316   -         0.074   0.074   0.088  -0.414  -0.416  -0.393  -0.141  -0.140  -0.119
317   -         0.074   0.074   0.088   0.490   0.491   0.515  -0.141  -0.140  -0.119
318   -         0.074   0.074   0.088  -0.191  -0.192  -0.169  -0.141  -0.140  -0.119
319   K         0.227   0.218   0.189   0.039   0.022  -0.017   0.111   0.096   0.048
320   P        -1.028  -1.027  -1.017  -1.051  -1.055  -1.032  -0.894  -0.893  -0.874
321   I        -1.028  -1.027  -1.017  -0.996  -0.999  -0.977  -0.894  -0.893  -0.874
322   L        -1.028  -1.027  -1.017  -0.942  -0.933  -0.923  -0.894  -0.893  -0.874
323   K         0.227   0.225   0.192   0.016   0.010  -0.037   0.111   0.107   0.053
324   E         0.227   0.225   0.192   0.394   0.387   0.345   0.111   0.107   0.053
325   R         0.227   0.225   0.192   0.326   0.327   0.265   0.111   0.107   0.053
326   N         0.227   0.225   0.192   0.196   0.197   0.138   0.111   0.107   0.053
327   N        -1.028  -1.027  -1.017  -0.961  -0.960  -0.942  -0.894  -0.893  -0.874
328   S         1.956   1.957   1.976   1.808   1.807   1.838   2.120   2.121   2.146
329   L         1.956   1.957   1.976   1.726   1.725   1.756   2.120   2.121   2.146
330   V        -1.028  -1.027  -1.017  -1.016  -1.014  -0.997  -0.894  -0.893  -0.874
331   W         1.956   1.957   1.976   2.400   2.401   2.432   2.120   2.121   2.146
332   P         1.956   1.957   1.976   2.033   2.033   2.063   2.120   2.121   2.146
333   H        -1.028  -1.027  -1.017  -0.714  -0.712  -0.694  -0.894  -0.893  -0.874
334   K         1.956   1.957   1.976   1.735   1.733   1.764   2.120   2.121   2.146
335   S        -1.028  -1.027  -1.017  -1.081  -1.083  -1.063  -0.894  -0.893  -0.874
336   R         0.227   0.241   0.201   0.039   0.056   0.001   0.111   0.132   0.067
337   F         0.227   0.241   0.201   0.125   0.144   0.096   0.111   0.132   0.067
338   K         0.227   0.225   0.192   0.020   0.012  -0.033   0.111   0.107   0.053
339   A        -1.028  -1.027  -1.017  -0.927  -0.930  -0.908  -0.894  -0.893  -0.874
340   K         0.227   0.218   0.189   0.012  -0.005  -0.046   0.111   0.096   0.048
341   R         1.956   1.957   1.976   2.083   2.084   2.114   2.120   2.121   2.146
342   N         0.074   0.074   0.088   0.049   0.050   0.072  -0.141  -0.140  -0.119
343   Q         0.074   0.074   0.088  -0.024  -0.024  -0.001  -0.141  -0.140  -0.119
344   P         0.074   0.074   0.088  -0.141  -0.141  -0.118  -0.141  -0.140  -0.119
345   S         1.956   1.957   1.976   1.835   1.834   1.865   2.120   2.121   2.146
346   P         0.074   0.074   0.088   0.073   0.074   0.096  -0.141  -0.140  -0.119
347   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
348   G         0.074   0.074   0.088   0.239   0.240   0.263  -0.141  -0.140  -0.119
349   Q         0.227   0.218   0.189   0.348   0.337   0.280   0.111   0.096   0.048
350   S         0.227   0.225   0.192   0.039   0.032  -0.021   0.111   0.107   0.053
351   L        -1.028  -1.027  -1.017  -1.238  -1.229  -1.220  -0.894  -0.893  -0.874
352   I        -1.028  -1.027  -1.017  -0.836  -0.833  -0.816  -0.894  -0.893  -0.874
353   N        -1.028  -1.027  -1.017  -1.195  -1.198  -1.177  -0.894  -0.893  -0.874
354   N        -1.028  -1.027  -1.017  -0.784  -0.781  -0.764  -0.894  -0.893  -0.874
355   T        -1.028  -1.027  -1.017  -1.081  -1.085  -1.063  -0.894  -0.893  -0.874
356   D         0.227   0.225   0.192   0.174   0.181   0.103   0.111   0.107   0.053
357   I         0.227   0.218   0.189   0.265   0.253   0.208   0.111   0.096   0.048
358   T        -1.028  -1.027  -1.017  -1.036  -1.039  -1.017  -0.894  -0.893  -0.874
359   L         1.956   1.957   1.976   1.726   1.725   1.756   2.120   2.121   2.146
360   Y        -1.028  -1.027  -1.017  -0.470  -0.465  -0.449  -0.894  -0.893  -0.874
361   N        -1.028  -1.027  -1.017  -1.097  -1.099  -1.078  -0.894  -0.893  -0.874
362   D         1.956   1.957   1.976   2.072   2.073   2.103   2.120   2.121   2.146
363   V         0.074   0.074   0.088   0.285   0.286   0.309  -0.141  -0.140  -0.119
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/Q02749
Output conservation file - output/Q02749
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
