1     M         2.071   2.075   2.104   2.428   2.434   2.480   2.261   2.266   2.306
2     -         0.129   0.131   0.152   0.129   0.132   0.165  -0.105  -0.102  -0.070
3     R        -1.006  -1.004  -0.991  -0.696  -0.694  -0.665  -0.894  -0.890  -0.863
4     E        -1.006  -1.004  -0.991  -0.855  -0.854  -0.826  -0.894  -0.890  -0.863
5     N         0.288   0.285   0.257   0.354   0.351   0.301   0.158   0.153   0.106
6     A         0.288   0.266   0.251   0.256   0.212   0.173   0.158   0.122   0.095
7     M        -1.006  -1.004  -0.991  -1.062  -1.081  -1.034  -0.894  -0.890  -0.863
8     S         0.288   0.266   0.251   0.207   0.177   0.165   0.158   0.122   0.095
9     T        -1.006  -1.004  -0.991  -0.840  -0.834  -0.811  -0.894  -0.890  -0.863
10    K         0.129   0.131   0.152   0.134   0.137   0.170  -0.105  -0.102  -0.070
11    K        -1.006  -1.004  -0.991  -0.994  -0.994  -0.966  -0.894  -0.890  -0.863
12    L         0.288   0.285   0.257  -0.266  -0.270  -0.313   0.158   0.153   0.106
13    P         0.288   0.285   0.257   0.731   0.727   0.691   0.158   0.153   0.106
14    Y         0.288   0.266   0.251   0.488   0.452   0.421   0.158   0.122   0.095
15    K        -1.006  -1.004  -0.991  -0.971  -0.964  -0.942  -0.894  -0.890  -0.863
16    L        -1.006  -1.004  -0.991  -1.209  -1.189  -1.183  -0.894  -0.890  -0.863
17    S         0.288   0.285   0.257   0.168   0.164   0.131   0.158   0.153   0.106
18    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
19    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
20    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
21    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
22    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
23    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
24    T        -1.006  -1.004  -0.991  -0.740  -0.734  -0.709  -0.894  -0.890  -0.863
25    S         0.288   0.266   0.251   0.142   0.111   0.092   0.158   0.122   0.095
26    I        -1.006  -1.004  -0.991  -1.312  -1.320  -1.286  -0.894  -0.890  -0.863
27    P         2.071   2.075   2.104   2.410   2.415   2.462   2.261   2.266   2.306
28    N         0.288   0.266   0.251   0.215   0.174   0.133   0.158   0.122   0.095
29    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
30    D         0.288   0.321   0.271   0.483   0.539   0.454   0.158   0.211   0.129
31    L         2.071   2.075   2.104   1.549   1.553   1.595   2.261   2.266   2.306
32    I        -1.006  -1.004  -0.991  -0.866  -0.853  -0.837  -0.894  -0.890  -0.863
33    I         0.288   0.285   0.257   0.314   0.310   0.269   0.158   0.153   0.106
34    L        -1.006  -1.004  -0.991  -1.426  -1.413  -1.401  -0.894  -0.890  -0.863
35    R         2.071   2.075   2.104   2.392   2.400   2.444   2.261   2.266   2.306
36    N        -1.006  -1.004  -0.991  -1.026  -1.030  -0.998  -0.894  -0.890  -0.863
37    N        -1.006  -1.004  -0.991  -0.817  -0.813  -0.788  -0.894  -0.890  -0.863
38    C         0.288   0.285   0.257   0.710   0.705   0.656   0.158   0.153   0.106
39    I         2.071   2.075   2.104   2.028   2.034   2.077   2.261   2.266   2.306
40    N         0.129   0.131   0.152   0.096   0.100   0.132  -0.105  -0.102  -0.070
41    S         0.129   0.131   0.152  -0.558  -0.556  -0.526  -0.105  -0.102  -0.070
42    L        -1.006  -1.004  -0.991  -1.325  -1.301  -1.299  -0.894  -0.890  -0.863
43    N        -1.006  -1.004  -0.991  -0.848  -0.841  -0.818  -0.894  -0.890  -0.863
44    S         2.071   2.075   2.104   1.869   1.873   1.917   2.261   2.266   2.306
45    S        -1.006  -1.004  -0.991  -0.870  -0.854  -0.841  -0.894  -0.890  -0.863
46    S         2.071   2.075   2.104   1.869   1.873   1.917   2.261   2.266   2.306
47    S         0.288   0.285   0.257   0.103   0.097   0.057   0.158   0.153   0.106
48    K        -1.006  -1.004  -0.991  -0.721  -0.714  -0.691  -0.894  -0.890  -0.863
49    A        -1.006  -1.004  -0.991  -0.998  -1.003  -0.970  -0.894  -0.890  -0.863
50    D        -1.006  -1.004  -0.991  -0.817  -0.815  -0.788  -0.894  -0.890  -0.863
51    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
52    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
53    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
54    C        -1.006  -1.004  -0.991  -0.951  -0.971  -0.922  -0.894  -0.890  -0.863
55    I         0.288   0.285   0.257  -0.019  -0.025  -0.105   0.158   0.153   0.106
56    D         0.288   0.285   0.257   0.416   0.410   0.364   0.158   0.153   0.106
57    T        -1.006  -1.004  -0.991  -0.874  -0.869  -0.845  -0.894  -0.890  -0.863
58    W        -1.006  -1.004  -0.991  -1.010  -1.019  -0.982  -0.894  -0.890  -0.863
59    L         0.288   0.321   0.271   0.244   0.316   0.189   0.158   0.211   0.129
60    K        -1.006  -1.004  -0.991  -1.054  -1.050  -1.026  -0.894  -0.890  -0.863
61    Y         2.071   2.075   2.104   2.302   2.309   2.353   2.261   2.266   2.306
62    T        -1.006  -1.004  -0.991  -0.762  -0.752  -0.732  -0.894  -0.890  -0.863
63    E        -1.006  -1.004  -0.991  -0.776  -0.774  -0.747  -0.894  -0.890  -0.863
64    G        -1.006  -1.004  -0.991  -1.168  -1.171  -1.141  -0.894  -0.890  -0.863
65    L         2.071   2.075   2.104   1.549   1.553   1.595   2.261   2.266   2.306
66    L         2.071   2.075   2.104   1.549   1.553   1.595   2.261   2.266   2.306
67    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
68    H        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
69    R         0.288   0.266   0.251   0.581   0.545   0.514   0.158   0.122   0.095
70    Y         0.288   0.285   0.257   0.560   0.557   0.513   0.158   0.153   0.106
71    E        -1.006  -1.004  -0.991  -0.627  -0.616  -0.597  -0.894  -0.890  -0.863
72    A         0.288   0.266   0.251   0.410   0.373   0.348   0.158   0.122   0.095
73    N        -1.006  -1.004  -0.991  -0.784  -0.774  -0.754  -0.894  -0.890  -0.863
74    N         0.288   0.285   0.257   0.325   0.323   0.269   0.158   0.153   0.106
75    D        -1.006  -1.004  -0.991  -0.912  -0.916  -0.883  -0.894  -0.890  -0.863
76    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
77    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
78    A         0.129   0.131   0.152   0.074   0.077   0.109  -0.105  -0.102  -0.070
79    A         0.129   0.131   0.152  -0.166  -0.164  -0.132  -0.105  -0.102  -0.070
80    L         0.129   0.131   0.152  -0.180  -0.177  -0.146  -0.105  -0.102  -0.070
81    I         0.288   0.266   0.251   0.342   0.312   0.291   0.158   0.122   0.095
82    E        -1.006  -1.004  -0.991  -0.947  -0.953  -0.919  -0.894  -0.890  -0.863
83    E        -1.006  -1.004  -0.991  -0.585  -0.581  -0.554  -0.894  -0.890  -0.863
84    E         0.288   0.266   0.251   0.483   0.447   0.418   0.158   0.122   0.095
85    I         0.288   0.285   0.257  -0.019  -0.025  -0.105   0.158   0.153   0.106
86    A         0.288   0.285   0.257   0.393   0.389   0.340   0.158   0.153   0.106
87    I         2.071   2.075   2.104   2.060   2.067   2.110   2.261   2.266   2.306
88    A         0.288   0.285   0.257   0.393   0.389   0.340   0.158   0.153   0.106
89    L        -1.006  -1.004  -0.991  -1.218  -1.195  -1.191  -0.894  -0.890  -0.863
90    I         0.288   0.321   0.271  -0.266  -0.216  -0.292   0.158   0.211   0.129
91    N         2.071   2.075   2.104   2.154   2.163   2.204   2.261   2.266   2.306
92    V         0.288   0.285   0.257   0.410   0.405   0.349   0.158   0.153   0.106
93    A         0.288   0.266   0.251   0.256   0.212   0.173   0.158   0.122   0.095
94    V        -1.006  -1.004  -0.991  -0.667  -0.659  -0.636  -0.894  -0.890  -0.863
95    F        -1.006  -1.004  -0.991  -0.645  -0.640  -0.615  -0.894  -0.890  -0.863
96    Y         0.288   0.266   0.251   0.560   0.527   0.502   0.158   0.122   0.095
97    Q         0.288   0.321   0.271   0.483   0.538   0.454   0.158   0.211   0.129
98    D        -1.006  -1.004  -0.991  -0.844  -0.842  -0.814  -0.894  -0.890  -0.863
99    I        -1.006  -1.004  -0.991  -1.135  -1.141  -1.107  -0.894  -0.890  -0.863
100   G        -1.006  -1.004  -0.991  -0.681  -0.680  -0.651  -0.894  -0.890  -0.863
101   I        -1.006  -1.004  -0.991  -1.286  -1.283  -1.260  -0.894  -0.890  -0.863
102   E         0.288   0.266   0.251   0.483   0.447   0.418   0.158   0.122   0.095
103   T        -1.006  -1.004  -0.991  -1.110  -1.110  -1.083  -0.894  -0.890  -0.863
104   L        -1.006  -1.004  -0.991  -0.920  -0.892  -0.891  -0.894  -0.890  -0.863
105   Y        -1.006  -1.004  -0.991  -0.710  -0.705  -0.680  -0.894  -0.890  -0.863
106   R        -1.006  -1.004  -0.991  -0.670  -0.671  -0.640  -0.894  -0.890  -0.863
107   A         2.071   2.075   2.104   2.198   2.203   2.248   2.261   2.266   2.306
108   Y         2.071   2.075   2.104   2.302   2.309   2.353   2.261   2.266   2.306
109   E        -1.006  -1.004  -0.991  -0.692  -0.685  -0.662  -0.894  -0.890  -0.863
110   S         0.288   0.285   0.257   0.103   0.097   0.057   0.158   0.153   0.106
111   S        -1.006  -1.004  -0.991  -0.920  -0.906  -0.891  -0.894  -0.890  -0.863
112   Q        -1.006  -1.004  -0.991  -0.874  -0.879  -0.845  -0.894  -0.890  -0.863
113   A        -1.006  -1.004  -0.991  -0.692  -0.684  -0.662  -0.894  -0.890  -0.863
114   S         0.288   0.321   0.271   0.268   0.328   0.226   0.158   0.211   0.129
115   N         0.129   0.131   0.152   0.144   0.148   0.181  -0.105  -0.102  -0.070
116   N         0.129   0.131   0.152   0.021   0.024   0.057  -0.105  -0.102  -0.070
117   L         0.288   0.266   0.251  -0.188  -0.220  -0.234   0.158   0.122   0.095
118   W         2.071   2.075   2.104   2.523   2.529   2.575   2.261   2.266   2.306
119   T         0.288   0.266   0.251   0.388   0.351   0.326   0.158   0.122   0.095
120   T         0.288   0.266   0.251   0.233   0.190   0.150   0.158   0.122   0.095
121   S         0.288   0.285   0.257   0.103   0.097   0.057   0.158   0.153   0.106
122   G        -1.006  -1.004  -0.991  -0.936  -0.937  -0.907  -0.894  -0.890  -0.863
123   T        -1.006  -1.004  -0.991  -0.840  -0.835  -0.811  -0.894  -0.890  -0.863
124   Y         2.071   2.075   2.104   2.302   2.309   2.353   2.261   2.266   2.306
125   L         0.288   0.266   0.251  -0.217  -0.247  -0.267   0.158   0.122   0.095
126   K         2.071   2.075   2.104   2.111   2.118   2.160   2.261   2.266   2.306
127   R         0.288   0.266   0.251   0.543   0.506   0.470   0.158   0.122   0.095
128   G         0.288   0.321   0.271   0.466   0.517   0.443   0.158   0.211   0.129
129   L         0.288   0.321   0.271  -0.019   0.051  -0.072   0.158   0.211   0.129
130   G         2.071   2.075   2.104   2.332   2.340   2.383   2.261   2.266   2.306
131   L         0.288   0.321   0.271  -0.019   0.051  -0.072   0.158   0.211   0.129
132   I         0.288   0.321   0.271  -0.266  -0.216  -0.292   0.158   0.211   0.129
133   C        -1.006  -1.004  -0.991  -0.990  -1.000  -0.962  -0.894  -0.890  -0.863
134   F         2.071   2.075   2.104   2.332   2.339   2.383   2.261   2.266   2.306
135   L         0.288   0.266   0.251  -0.156  -0.185  -0.198   0.158   0.122   0.095
136   G        -1.006  -1.004  -0.991  -0.974  -0.981  -0.946  -0.894  -0.890  -0.863
137   K        -1.006  -1.004  -0.991  -1.078  -1.073  -1.050  -0.894  -0.890  -0.863
138   N        -1.006  -1.004  -0.991  -0.802  -0.795  -0.773  -0.894  -0.890  -0.863
139   F        -1.006  -1.004  -0.991  -0.592  -0.588  -0.561  -0.894  -0.890  -0.863
140   Q        -1.006  -1.004  -0.991  -0.525  -0.518  -0.494  -0.894  -0.890  -0.863
141   I        -1.006  -1.004  -0.991  -1.243  -1.237  -1.217  -0.894  -0.890  -0.863
142   N        -1.006  -1.004  -0.991  -0.532  -0.521  -0.501  -0.894  -0.890  -0.863
143   T         0.288   0.285   0.257   0.444   0.441   0.400   0.158   0.153   0.106
144   A         0.129   0.131   0.152   0.166   0.169   0.202  -0.105  -0.102  -0.070
145   N         0.129   0.131   0.152   0.096   0.100   0.132  -0.105  -0.102  -0.070
146   D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
147   C        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
148   Q        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
149   K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
150   M        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
151   Q        -1.006  -1.004  -0.991  -0.947  -0.952  -0.919  -0.894  -0.890  -0.863
152   V        -1.006  -1.004  -0.991  -1.243  -1.249  -1.217  -0.894  -0.890  -0.863
153   L         0.288   0.285   0.257  -0.140  -0.144  -0.173   0.158   0.153   0.106
154   N        -1.006  -1.004  -0.991  -1.026  -1.030  -0.998  -0.894  -0.890  -0.863
155   V        -1.006  -1.004  -0.991  -0.692  -0.691  -0.662  -0.894  -0.890  -0.863
156   L         0.288   0.266   0.251  -0.037  -0.060  -0.064   0.158   0.122   0.095
157   N         0.288   0.285   0.257   0.073   0.067  -0.015   0.158   0.153   0.106
158   Q         0.288   0.285   0.257   0.505   0.499   0.463   0.158   0.153   0.106
159   L        -1.006  -1.004  -0.991  -1.042  -1.015  -1.014  -0.894  -0.890  -0.863
160   S        -1.006  -1.004  -0.991  -0.829  -0.809  -0.799  -0.894  -0.890  -0.863
161   L        -1.006  -1.004  -0.991  -1.458  -1.442  -1.433  -0.894  -0.890  -0.863
162   E         0.288   0.266   0.251   0.192   0.143   0.087   0.158   0.122   0.095
163   F        -1.006  -1.004  -0.991  -0.529  -0.524  -0.497  -0.894  -0.890  -0.863
164   Q         0.288   0.285   0.257   0.477   0.471   0.432   0.158   0.153   0.106
165   L         0.288   0.285   0.257  -0.156  -0.161  -0.190   0.158   0.153   0.106
166   L         0.288   0.266   0.251  -0.217  -0.247  -0.267   0.158   0.122   0.095
167   Q         2.071   2.075   2.104   2.210   2.213   2.260   2.261   2.266   2.306
168   Q         2.071   2.075   2.104   2.210   2.213   2.260   2.261   2.266   2.306
169   L         2.071   2.075   2.104   1.549   1.553   1.595   2.261   2.266   2.306
170   G         0.288   0.321   0.271   0.168   0.214   0.150   0.158   0.211   0.129
171   I        -1.006  -1.004  -0.991  -0.703  -0.690  -0.673  -0.894  -0.890  -0.863
172   V         2.071   2.075   2.104   2.271   2.276   2.322   2.261   2.266   2.306
173   V         0.288   0.321   0.271  -0.156  -0.114  -0.173   0.158   0.211   0.129
174   L         0.288   0.285   0.257  -0.156  -0.161  -0.190   0.158   0.153   0.106
175   A         0.288   0.266   0.251   0.393   0.357   0.329   0.158   0.122   0.095
176   L         0.288   0.321   0.271  -0.019   0.051  -0.072   0.158   0.211   0.129
177   S         0.288   0.285   0.257   0.091   0.086   0.044   0.158   0.153   0.106
178   K         2.071   2.075   2.104   2.111   2.118   2.160   2.261   2.266   2.306
179   L         0.288   0.266   0.251  -0.074  -0.099  -0.106   0.158   0.122   0.095
180   R         2.071   2.075   2.104   2.392   2.400   2.444   2.261   2.266   2.306
181   S         0.288   0.266   0.251   0.091   0.056   0.034   0.158   0.122   0.095
182   K        -1.006  -1.004  -0.991  -0.765  -0.751  -0.735  -0.894  -0.890  -0.863
183   I         0.288   0.321   0.271  -0.266  -0.216  -0.292   0.158   0.211   0.129
184   S         0.288   0.321   0.271   0.354   0.417   0.311   0.158   0.211   0.129
185   K         0.288   0.266   0.251   0.424   0.395   0.376   0.158   0.122   0.095
186   D         2.071   2.075   2.104   2.210   2.215   2.260   2.261   2.266   2.306
187   A         0.288   0.285   0.257   0.256   0.249   0.186   0.158   0.153   0.106
188   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
189   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
190   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
191   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
192   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
193   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
194   V        -1.006  -1.004  -0.991  -1.243  -1.259  -1.217  -0.894  -0.890  -0.863
195   A         0.288   0.321   0.271  -0.194  -0.150  -0.215   0.158   0.211   0.129
196   D         0.288   0.266   0.251   0.268   0.223   0.184   0.158   0.122   0.095
197   L         0.288   0.266   0.251  -0.125  -0.151  -0.162   0.158   0.122   0.095
198   E        -1.006  -1.004  -0.991  -0.743  -0.742  -0.713  -0.894  -0.890  -0.863
199   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
200   P        -1.006  -1.004  -0.991  -0.863  -0.868  -0.833  -0.894  -0.890  -0.863
201   Q        -1.006  -1.004  -0.991  -1.026  -1.031  -0.998  -0.894  -0.890  -0.863
202   E         0.288   0.321   0.271   0.452   0.504   0.427   0.158   0.211   0.129
203   L         0.288   0.266   0.251  -0.266  -0.299  -0.322   0.158   0.122   0.095
204   E        -1.006  -1.004  -0.991  -0.765  -0.764  -0.735  -0.894  -0.890  -0.863
205   E         0.288   0.285   0.257   0.483   0.479   0.430   0.158   0.153   0.106
206   L         0.288   0.285   0.257  -0.217  -0.221  -0.258   0.158   0.153   0.106
207   G        -1.006  -1.004  -0.991  -1.006  -1.014  -0.978  -0.894  -0.890  -0.863
208   K         0.288   0.285   0.257   0.030   0.024  -0.057   0.158   0.153   0.106
209   S         0.288   0.266   0.251   0.139   0.106   0.088   0.158   0.122   0.095
210   S         0.288   0.266   0.251   0.103   0.069   0.048   0.158   0.122   0.095
211   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
212   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
213   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
214   V        -1.006  -1.004  -0.991  -0.802  -0.801  -0.773  -0.894  -0.890  -0.863
215   F        -1.006  -1.004  -0.991  -1.110  -1.114  -1.083  -0.894  -0.890  -0.863
216   Y         2.071   2.075   2.104   2.302   2.309   2.353   2.261   2.266   2.306
217   A         0.288   0.285   0.257   0.256   0.249   0.186   0.158   0.153   0.106
218   K         0.288   0.285   0.257   0.416   0.415   0.376   0.158   0.153   0.106
219   L         0.288   0.285   0.257  -0.074  -0.078  -0.099   0.158   0.153   0.106
220   C         0.288   0.266   0.251   0.538   0.492   0.448   0.158   0.122   0.095
221   I         2.071   2.075   2.104   2.060   2.067   2.110   2.261   2.266   2.306
222   G         0.288   0.285   0.257   0.382   0.377   0.310   0.158   0.153   0.106
223   S        -1.006  -1.004  -0.991  -0.814  -0.794  -0.784  -0.894  -0.890  -0.863
224   Y        -1.006  -1.004  -0.991  -1.351  -1.363  -1.325  -0.894  -0.890  -0.863
225   S        -1.006  -1.004  -0.991  -0.982  -0.967  -0.954  -0.894  -0.890  -0.863
226   T         0.288   0.266   0.251   0.416   0.381   0.358   0.158   0.122   0.095
227   A        -1.006  -1.004  -0.991  -0.491  -0.479  -0.459  -0.894  -0.890  -0.863
228   S        -1.006  -1.004  -0.991  -0.974  -0.963  -0.946  -0.894  -0.890  -0.863
229   Q        -1.006  -1.004  -0.991  -0.998  -1.005  -0.970  -0.894  -0.890  -0.863
230   C        -1.006  -1.004  -0.991  -1.086  -1.107  -1.058  -0.894  -0.890  -0.863
231   Q         0.288   0.285   0.257   0.127   0.116   0.039   0.158   0.153   0.106
232   G         2.071   2.075   2.104   2.324   2.330   2.375   2.261   2.266   2.306
233   G         0.129   0.131   0.152   0.134   0.137   0.170  -0.105  -0.102  -0.070
234   R         0.129   0.131   0.152   0.468   0.471   0.506  -0.105  -0.102  -0.070
235   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
236   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
237   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
238   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
239   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
240   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
241   -         0.129   0.131   0.152  -0.437  -0.435  -0.405  -0.105  -0.102  -0.070
242   -         0.129   0.131   0.152  -0.148  -0.145  -0.114  -0.105  -0.102  -0.070
243   I         0.288   0.266   0.251   0.314   0.281   0.259   0.158   0.122   0.095
244   V        -1.006  -1.004  -0.991  -0.836  -0.837  -0.807  -0.894  -0.890  -0.863
245   D         0.288   0.285   0.257   0.396   0.392   0.342   0.158   0.153   0.106
246   A         0.288   0.321   0.271   0.103   0.151   0.079   0.158   0.211   0.129
247   L         0.288   0.285   0.257  -0.140  -0.144  -0.173   0.158   0.153   0.106
248   F        -1.006  -1.004  -0.991  -0.743  -0.743  -0.713  -0.894  -0.890  -0.863
249   M        -1.006  -1.004  -0.991  -0.998  -1.017  -0.970  -0.894  -0.890  -0.863
250   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
251   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
252   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
253   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
254   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
255   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
256   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
257   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
258   N        -1.006  -1.004  -0.991  -0.649  -0.637  -0.618  -0.894  -0.890  -0.863
259   Y         0.288   0.321   0.271   0.573   0.627   0.547   0.158   0.211   0.129
260   L         0.288   0.285   0.257  -0.266  -0.270  -0.313   0.158   0.153   0.106
261   Q        -1.006  -1.004  -0.991  -0.769  -0.762  -0.739  -0.894  -0.890  -0.863
262   S         0.288   0.285   0.257   0.139   0.133   0.098   0.158   0.153   0.106
263   L         2.071   2.075   2.104   1.549   1.553   1.595   2.261   2.266   2.306
264   T        -1.006  -1.004  -0.991  -0.905  -0.900  -0.876  -0.894  -0.890  -0.863
265   Y         0.288   0.266   0.251   0.215   0.165   0.110   0.158   0.122   0.095
266   L         0.288   0.266   0.251  -0.207  -0.238  -0.256   0.158   0.122   0.095
267   F         0.288   0.321   0.271  -0.125  -0.083  -0.139   0.158   0.211   0.129
268   L         0.288   0.285   0.257  -0.156  -0.161  -0.190   0.158   0.153   0.106
269   S         2.071   2.075   2.104   1.869   1.873   1.917   2.261   2.266   2.306
270   I         0.288   0.285   0.257  -0.019  -0.025  -0.105   0.158   0.153   0.106
271   N        -1.006  -1.004  -0.991  -0.776  -0.768  -0.747  -0.894  -0.890  -0.863
272   Q         0.288   0.266   0.251   0.376   0.336   0.308   0.158   0.122   0.095
273   Y         2.071   2.075   2.104   2.302   2.309   2.353   2.261   2.266   2.306
274   N        -1.006  -1.004  -0.991  -0.776  -0.768  -0.747  -0.894  -0.890  -0.863
275   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
276   N        -1.006  -1.004  -0.991  -0.848  -0.841  -0.818  -0.894  -0.890  -0.863
277   D         0.288   0.285   0.257   0.396   0.392   0.342   0.158   0.153   0.106
278   E        -1.006  -1.004  -0.991  -0.776  -0.772  -0.747  -0.894  -0.890  -0.863
279   C        -1.006  -1.004  -0.991  -0.460  -0.460  -0.428  -0.894  -0.890  -0.863
280   G         0.288   0.266   0.251   0.516   0.480   0.448   0.158   0.122   0.095
281   I        -1.006  -1.004  -0.991  -0.725  -0.716  -0.695  -0.894  -0.890  -0.863
282   A         2.071   2.075   2.104   2.198   2.203   2.248   2.261   2.266   2.306
283   I        -1.006  -1.004  -0.991  -1.135  -1.141  -1.107  -0.894  -0.890  -0.863
284   G         0.288   0.266   0.251   0.562   0.530   0.501   0.158   0.122   0.095
285   M         0.288   0.285   0.257   0.673   0.669   0.623   0.158   0.153   0.106
286   L         0.288   0.266   0.251  -0.266  -0.299  -0.322   0.158   0.122   0.095
287   Q        -1.006  -1.004  -0.991  -0.844  -0.842  -0.814  -0.894  -0.890  -0.863
288   E        -1.006  -1.004  -0.991  -1.164  -1.165  -1.136  -0.894  -0.890  -0.863
289   S         0.288   0.266   0.251   0.103   0.069   0.048   0.158   0.122   0.095
290   I         0.288   0.285   0.257   0.371   0.369   0.332   0.158   0.153   0.106
291   K         0.288   0.266   0.251   0.359   0.327   0.303   0.158   0.122   0.095
292   K        -1.006  -1.004  -0.991  -0.620  -0.606  -0.589  -0.894  -0.890  -0.863
293   L         0.288   0.266   0.251  -0.266  -0.299  -0.322   0.158   0.122   0.095
294   L         0.129   0.131   0.152  -0.327  -0.324  -0.294  -0.105  -0.102  -0.070
295   N         0.129   0.131   0.152   0.214   0.217   0.251  -0.105  -0.102  -0.070
296   I         0.129   0.131   0.152  -0.363  -0.360  -0.330  -0.105  -0.102  -0.070
297   V         0.129   0.131   0.152  -0.194  -0.191  -0.160  -0.105  -0.102  -0.070
298   P        -1.006  -1.004  -0.991  -0.886  -0.897  -0.856  -0.894  -0.890  -0.863
299   N        -1.006  -1.004  -0.991  -0.765  -0.758  -0.735  -0.894  -0.890  -0.863
300   S         0.288   0.266   0.251   0.142   0.111   0.092   0.158   0.122   0.095
301   Q         0.288   0.285   0.257   0.354   0.346   0.294   0.158   0.153   0.106
302   L         0.288   0.285   0.257  -0.074  -0.078  -0.099   0.158   0.153   0.106
303   K         0.288   0.266   0.251   0.305   0.272   0.241   0.158   0.122   0.095
304   E        -1.006  -1.004  -0.991  -1.164  -1.177  -1.136  -0.894  -0.890  -0.863
305   L         0.288   0.285   0.257  -0.207  -0.212  -0.247   0.158   0.153   0.106
306   D         0.288   0.266   0.251   0.421   0.383   0.359   0.158   0.122   0.095
307   I        -1.006  -1.004  -0.991  -1.325  -1.319  -1.299  -0.894  -0.890  -0.863
308   L        -1.006  -1.004  -0.991  -1.222  -1.201  -1.195  -0.894  -0.890  -0.863
309   S         0.288   0.266   0.251   0.061   0.025  -0.000   0.158   0.122   0.095
310   S         2.071   2.075   2.104   1.869   1.873   1.917   2.261   2.266   2.306
311   T         0.288   0.321   0.271  -0.207  -0.162  -0.229   0.158   0.211   0.129
312   D         2.071   2.075   2.104   2.210   2.215   2.260   2.261   2.266   2.306
313   I        -1.006  -1.004  -0.991  -1.151  -1.146  -1.124  -0.894  -0.890  -0.863
314   T        -1.006  -1.004  -0.991  -1.312  -1.324  -1.286  -0.894  -0.890  -0.863
315   K        -1.006  -1.004  -0.991  -1.102  -1.110  -1.074  -0.894  -0.890  -0.863
316   K         0.288   0.321   0.271   0.433   0.489   0.400   0.158   0.211   0.129
317   R         0.129   0.131   0.152   0.361   0.364   0.399  -0.105  -0.102  -0.070
318   D         2.071   2.075   2.104   2.212   2.219   2.263   2.261   2.266   2.306
319   L         0.129   0.131   0.152  -0.225  -0.222  -0.191  -0.105  -0.102  -0.070
320   I        -1.006  -1.004  -0.991  -0.703  -0.696  -0.673  -0.894  -0.890  -0.863
321   K         0.288   0.266   0.251   0.314   0.280   0.251   0.158   0.122   0.095
322   M        -1.006  -1.004  -0.991  -0.603  -0.599  -0.572  -0.894  -0.890  -0.863
323   S        -1.006  -1.004  -0.991  -0.947  -0.930  -0.919  -0.894  -0.890  -0.863
324   F        -1.006  -1.004  -0.991  -0.897  -0.892  -0.868  -0.894  -0.890  -0.863
325   K         2.071   2.075   2.104   2.111   2.118   2.160   2.261   2.266   2.306
326   R        -1.006  -1.004  -0.991  -0.681  -0.682  -0.651  -0.894  -0.890  -0.863
327   K        -1.006  -1.004  -0.991  -1.062  -1.063  -1.034  -0.894  -0.890  -0.863
328   I         0.288   0.285   0.257   0.127   0.121   0.059   0.158   0.153   0.106
329   H        -1.006  -1.004  -0.991  -1.062  -1.072  -1.034  -0.894  -0.890  -0.863
330   G         2.071   2.075   2.104   2.332   2.340   2.383   2.261   2.266   2.306
331   S         0.288   0.321   0.271   0.174   0.236   0.134   0.158   0.211   0.129
332   T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
333   L         2.071   2.075   2.104   1.549   1.553   1.595   2.261   2.266   2.306
334   K         0.288   0.266   0.251   0.416   0.387   0.367   0.158   0.122   0.095
335   N         2.071   2.075   2.104   2.154   2.163   2.204   2.261   2.266   2.306
336   Q        -1.006  -1.004  -0.991  -0.806  -0.806  -0.777  -0.894  -0.890  -0.863
337   R        -1.006  -1.004  -0.991  -0.689  -0.690  -0.658  -0.894  -0.890  -0.863
338   I         0.288   0.321   0.271   0.262   0.320   0.229   0.158   0.211   0.129
339   F        -1.006  -1.004  -0.991  -1.168  -1.183  -1.141  -0.894  -0.890  -0.863
340   E         0.288   0.266   0.251   0.538   0.507   0.481   0.158   0.122   0.095
341   K         2.071   2.075   2.104   2.111   2.118   2.160   2.261   2.266   2.306
342   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
343   K         0.288   0.285   0.257   0.314   0.311   0.262   0.158   0.153   0.106
344   V         0.288   0.266   0.251   0.603   0.571   0.556   0.158   0.122   0.095
345   P         0.288   0.321   0.271   0.513   0.560   0.493   0.158   0.211   0.129
346   F         0.288   0.266   0.251   0.244   0.194   0.139   0.158   0.122   0.095
347   S        -1.006  -1.004  -0.991  -1.026  -1.014  -0.998  -0.894  -0.890  -0.863
348   S         0.288   0.266   0.251   0.207   0.177   0.165   0.158   0.122   0.095
349   K         0.288   0.321   0.271   0.342   0.399   0.311   0.158   0.211   0.129
350   A        -1.006  -1.004  -0.991  -1.426  -1.436  -1.401  -0.894  -0.890  -0.863
351   Y        -1.006  -1.004  -0.991  -0.656  -0.648  -0.625  -0.894  -0.890  -0.863
352   -         0.129   0.131   0.152  -0.148  -0.145  -0.114  -0.105  -0.102  -0.070
353   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
354   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
355   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
356   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
357   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
358   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
359   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
360   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
361   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
362   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
363   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
364   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
365   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
366   M         0.288   0.321   0.271  -0.074  -0.036  -0.084   0.158   0.211   0.129
367   M        -1.006  -1.004  -0.991  -0.389  -0.383  -0.356  -0.894  -0.890  -0.863
368   P         2.071   2.075   2.104   2.410   2.415   2.462   2.261   2.266   2.306
369   L         0.288   0.266   0.251  -0.125  -0.151  -0.162   0.158   0.122   0.095
370   L         0.288   0.266   0.251  -0.266  -0.299  -0.322   0.158   0.122   0.095
371   K         0.288   0.321   0.271  -0.240  -0.192  -0.264   0.158   0.211   0.129
372   S        -1.006  -1.004  -0.991  -0.982  -0.965  -0.954  -0.894  -0.890  -0.863
373   S        -1.006  -1.004  -0.991  -1.046  -1.036  -1.018  -0.894  -0.890  -0.863
374   L         0.288   0.266   0.251  -0.266  -0.299  -0.322   0.158   0.122   0.095
375   D        -1.006  -1.004  -0.991  -0.825  -0.821  -0.795  -0.894  -0.890  -0.863
376   D         2.071   2.075   2.104   2.210   2.215   2.260   2.261   2.266   2.306
377   F         0.288   0.285   0.257   0.244   0.237   0.155   0.158   0.153   0.106
378   V        -1.006  -1.004  -0.991  -1.243  -1.259  -1.217  -0.894  -0.890  -0.863
379   I         0.288   0.321   0.271  -0.266  -0.216  -0.292   0.158   0.211   0.129
380   P         2.071   2.075   2.104   2.410   2.415   2.462   2.261   2.266   2.306
381   L         2.071   2.075   2.104   1.549   1.553   1.595   2.261   2.266   2.306
382   T        -1.006  -1.004  -0.991  -0.821  -0.818  -0.792  -0.894  -0.890  -0.863
383   I        -1.006  -1.004  -0.991  -1.135  -1.124  -1.107  -0.894  -0.890  -0.863
384   L         0.288   0.266   0.251  -0.156  -0.185  -0.198   0.158   0.122   0.095
385   L         2.071   2.075   2.104   1.549   1.553   1.595   2.261   2.266   2.306
386   R        -1.006  -1.004  -0.991  -0.936  -0.939  -0.907  -0.894  -0.890  -0.863
387   Y         0.288   0.266   0.251   0.532   0.498   0.471   0.158   0.122   0.095
388   R         2.071   2.075   2.104   2.392   2.400   2.444   2.261   2.266   2.306
389   Y         2.071   2.075   2.104   2.302   2.309   2.353   2.261   2.266   2.306
390   Q        -1.006  -1.004  -0.991  -0.743  -0.740  -0.713  -0.894  -0.890  -0.863
391   T        -1.006  -1.004  -0.991  -0.901  -0.895  -0.872  -0.894  -0.890  -0.863
392   T         0.288   0.266   0.251   0.382   0.346   0.319   0.158   0.122   0.095
393   N         2.071   2.075   2.104   2.154   2.163   2.204   2.261   2.266   2.306
394   E         0.288   0.285   0.257   0.483   0.479   0.430   0.158   0.153   0.106
395   N         0.129   0.131   0.152  -0.406  -0.403  -0.373  -0.105  -0.102  -0.070
396   Y         0.288   0.266   0.251   0.560   0.527   0.502   0.158   0.122   0.095
397   S         0.288   0.266   0.251   0.091   0.056   0.034   0.158   0.122   0.095
398   F         2.071   2.075   2.104   2.332   2.339   2.383   2.261   2.266   2.306
399   K        -1.006  -1.004  -0.991  -0.844  -0.839  -0.814  -0.894  -0.890  -0.863
400   T        -1.006  -1.004  -0.991  -0.692  -0.681  -0.662  -0.894  -0.890  -0.863
401   V        -1.006  -1.004  -0.991  -0.501  -0.495  -0.470  -0.894  -0.890  -0.863
402   E        -1.006  -1.004  -0.991  -0.758  -0.750  -0.728  -0.894  -0.890  -0.863
403   T        -1.006  -1.004  -0.991  -0.825  -0.819  -0.795  -0.894  -0.890  -0.863
404   D         0.288   0.266   0.251   0.268   0.223   0.184   0.158   0.122   0.095
405   V        -1.006  -1.004  -0.991  -0.543  -0.533  -0.511  -0.894  -0.890  -0.863
406   S        -1.006  -1.004  -0.991  -1.054  -1.043  -1.026  -0.894  -0.890  -0.863
407   K        -1.006  -1.004  -0.991  -0.525  -0.510  -0.494  -0.894  -0.890  -0.863
408   L         0.288   0.266   0.251  -0.156  -0.185  -0.198   0.158   0.122   0.095
409   K         0.129   0.131   0.152  -0.084  -0.081  -0.050  -0.105  -0.102  -0.070
410   E         0.129   0.131   0.152   0.295   0.298   0.332  -0.105  -0.102  -0.070
411   L         0.129   0.131   0.152  -0.314  -0.312  -0.281  -0.105  -0.102  -0.070
412   F         0.288   0.321   0.271  -0.125  -0.083  -0.139   0.158   0.211   0.129
413   P         2.071   2.075   2.104   2.410   2.415   2.462   2.261   2.266   2.306
414   R        -1.006  -1.004  -0.991  -0.732  -0.734  -0.702  -0.894  -0.890  -0.863
415   G         0.288   0.285   0.257   0.527   0.524   0.472   0.158   0.153   0.106
416   K         0.288   0.285   0.257   0.262   0.259   0.204   0.158   0.153   0.106
417   S        -1.006  -1.004  -0.991  -1.094  -1.081  -1.066  -0.894  -0.890  -0.863
418   S        -1.006  -1.004  -0.991  -0.729  -0.712  -0.698  -0.894  -0.890  -0.863
419   D        -1.006  -1.004  -0.991  -0.840  -0.836  -0.811  -0.894  -0.890  -0.863
420   I        -1.006  -1.004  -0.991  -1.243  -1.237  -1.217  -0.894  -0.890  -0.863
421   E         0.288   0.321   0.271   0.362   0.415   0.338   0.158   0.211   0.129
422   G         0.288   0.285   0.257   0.382   0.377   0.310   0.158   0.153   0.106
423   T        -1.006  -1.004  -0.991  -0.859  -0.853  -0.830  -0.894  -0.890  -0.863
424   V        -1.006  -1.004  -0.991  -0.986  -0.987  -0.958  -0.894  -0.890  -0.863
425   W         0.288   0.266   0.251   0.744   0.708   0.680   0.158   0.122   0.095
426   S        -1.006  -1.004  -0.991  -1.151  -1.140  -1.124  -0.894  -0.890  -0.863
427   F         0.288   0.285   0.257   0.466   0.462   0.404   0.158   0.153   0.106
428   Q        -1.006  -1.004  -0.991  -0.990  -0.991  -0.962  -0.894  -0.890  -0.863
429   D         0.288   0.266   0.251   0.477   0.444   0.422   0.158   0.122   0.095
430   G        -1.006  -1.004  -0.991  -0.674  -0.673  -0.644  -0.894  -0.890  -0.863
431   H        -1.006  -1.004  -0.991  -0.848  -0.859  -0.818  -0.894  -0.890  -0.863
432   L         0.288   0.285   0.257  -0.153  -0.156  -0.187   0.158   0.153   0.106
433   T        -1.006  -1.004  -0.991  -1.168  -1.165  -1.141  -0.894  -0.890  -0.863
434   F         0.288   0.321   0.271   0.342   0.392   0.321   0.158   0.211   0.129
435   A        -1.006  -1.004  -0.991  -0.751  -0.745  -0.721  -0.894  -0.890  -0.863
436   D         0.288   0.266   0.251   0.421   0.383   0.359   0.158   0.122   0.095
437   S        -1.006  -1.004  -0.991  -1.014  -1.003  -0.986  -0.894  -0.890  -0.863
438   N        -1.006  -1.004  -0.991  -1.034  -1.036  -1.006  -0.894  -0.890  -0.863
439   N        -1.006  -1.004  -0.991  -1.458  -1.465  -1.433  -0.894  -0.890  -0.863
440   A         0.288   0.321   0.271   0.103   0.151   0.079   0.158   0.211   0.129
441   T         0.288   0.285   0.257   0.319   0.315   0.260   0.158   0.153   0.106
442   H         0.129   0.131   0.152   0.432   0.436   0.470  -0.105  -0.102  -0.070
443   N         0.129   0.131   0.152   0.276   0.280   0.314  -0.105  -0.102  -0.070
444   C        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
445   G         0.129   0.131   0.152   0.234   0.237   0.270  -0.105  -0.102  -0.070
446   N        -1.006  -1.004  -0.991  -0.982  -0.982  -0.954  -0.894  -0.890  -0.863
447   Y         0.288   0.266   0.251   0.215   0.165   0.110   0.158   0.122   0.095
448   F         0.288   0.266   0.251   0.657   0.626   0.608   0.158   0.122   0.095
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/P53272
Output conservation file - output/P53272
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
