1     M         1.939   1.940   1.972   2.264   2.266   2.316   2.091   2.092   2.134
2     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
3     V         0.250   0.254   0.222   0.134   0.137   0.090   0.110   0.117   0.063
4     N         0.250   0.254   0.222   0.286   0.292   0.245   0.110   0.117   0.063
5     F         1.939   1.940   1.972   2.054   2.055   2.105   2.091   2.092   2.134
6     Y         1.939   1.940   1.972   2.073   2.073   2.124   2.091   2.092   2.134
7     D         0.250   0.262   0.225   0.379   0.395   0.340   0.110   0.128   0.067
8     D         0.250   0.254   0.222   0.303   0.308   0.249   0.110   0.117   0.063
9     V        -0.976  -0.976  -0.959  -1.075  -1.078  -1.045  -0.881  -0.880  -0.847
10    -         0.100   0.100   0.123  -0.051  -0.053  -0.014  -0.138  -0.137  -0.102
11    D         0.250   0.236   0.214   0.388   0.363   0.330   0.110   0.087   0.050
12    E         1.939   1.940   1.972   1.847   1.847   1.897   2.091   2.092   2.134
13    S        -0.976  -0.976  -0.959  -1.149  -1.149  -1.119  -0.881  -0.880  -0.847
14    K        -0.976  -0.976  -0.959  -1.137  -1.136  -1.107  -0.881  -0.880  -0.847
15    S        -0.976  -0.976  -0.959  -1.131  -1.129  -1.101  -0.881  -0.880  -0.847
16    H        -0.976  -0.976  -0.959  -0.767  -0.764  -0.734  -0.881  -0.880  -0.847
17    G         1.939   1.940   1.972   2.036   2.036   2.086   2.091   2.092   2.134
18    E         0.250   0.236   0.214   0.208   0.184   0.157   0.110   0.087   0.050
19    F         0.100   0.100   0.123  -0.085  -0.085  -0.048  -0.138  -0.137  -0.102
20    P         0.250   0.236   0.214   0.324   0.297   0.252   0.110   0.087   0.050
21    L         0.250   0.236   0.214   0.062   0.037   0.007   0.110   0.087   0.050
22    I        -0.976  -0.976  -0.959  -1.015  -1.018  -0.984  -0.881  -0.880  -0.847
23    P         0.250   0.236   0.214   0.337   0.310   0.267   0.110   0.087   0.050
24    V        -0.976  -0.976  -0.959  -1.045  -1.048  -1.014  -0.881  -0.880  -0.847
25    V        -0.976  -0.976  -0.959  -1.045  -1.052  -1.014  -0.881  -0.880  -0.847
26    L        -0.976  -0.976  -0.959  -1.003  -1.003  -0.972  -0.881  -0.880  -0.847
27    Q        -0.976  -0.976  -0.959  -0.915  -0.907  -0.883  -0.881  -0.880  -0.847
28    N         0.250   0.236   0.214   0.191   0.165   0.124   0.110   0.087   0.050
29    S         0.250   0.254   0.222   0.169   0.175   0.123   0.110   0.117   0.063
30    S         0.250   0.236   0.214   0.094   0.071   0.024   0.110   0.087   0.050
31    E         0.250   0.254   0.222   0.208   0.211   0.170   0.110   0.117   0.063
32    L         0.250   0.262   0.225   0.098   0.116   0.045   0.110   0.128   0.067
33    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
34    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
35    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
36    S         0.250   0.262   0.225   0.049   0.073   0.005   0.110   0.128   0.067
37    V         0.250   0.254   0.222   0.138   0.141   0.095   0.110   0.117   0.063
38    R        -0.976  -0.976  -0.959  -0.944  -0.948  -0.912  -0.881  -0.880  -0.847
39    T         0.250   0.236   0.214   0.312   0.287   0.258   0.110   0.087   0.050
40    I         0.250   0.262   0.225   0.031   0.046  -0.012   0.110   0.128   0.067
41    P         1.939   1.940   1.972   2.091   2.093   2.142   2.091   2.092   2.134
42    T        -0.976  -0.976  -0.959  -0.956  -0.959  -0.924  -0.881  -0.880  -0.847
43    G         1.939   1.940   1.972   2.036   2.036   2.086   2.091   2.092   2.134
44    N         0.250   0.236   0.214   0.295   0.272   0.243   0.110   0.087   0.050
45    E        -0.976  -0.976  -0.959  -1.131  -1.131  -1.101  -0.881  -0.880  -0.847
46    I         0.250   0.262   0.225   0.103   0.118   0.059   0.110   0.128   0.067
47    I        -0.976  -0.976  -0.959  -0.869  -0.875  -0.837  -0.881  -0.880  -0.847
48    E         0.250   0.236   0.214   0.226   0.207   0.177   0.110   0.087   0.050
49    S        -0.976  -0.976  -0.959  -0.903  -0.906  -0.871  -0.881  -0.880  -0.847
50    V         0.250   0.236   0.214   0.200   0.177   0.152   0.110   0.087   0.050
51    H        -0.976  -0.976  -0.959  -0.784  -0.784  -0.751  -0.881  -0.880  -0.847
52    L        -0.976  -0.976  -0.959  -1.156  -1.160  -1.126  -0.881  -0.880  -0.847
53    T         1.939   1.940   1.972   1.961   1.961   2.011   2.091   2.092   2.134
54    K         0.250   0.262   0.225   0.076   0.096   0.025   0.110   0.128   0.067
55    W         0.250   0.236   0.214   0.483   0.467   0.417   0.110   0.087   0.050
56    L        -0.976  -0.976  -0.959  -1.156  -1.158  -1.126  -0.881  -0.880  -0.847
57    R        -0.976  -0.976  -0.959  -0.857  -0.859  -0.825  -0.881  -0.880  -0.847
58    K         0.250   0.236   0.214   0.040   0.020  -0.023   0.110   0.087   0.050
59    Y         0.250   0.254   0.222   0.307   0.312   0.251   0.110   0.117   0.063
60    R         1.939   1.940   1.972   1.952   1.952   2.002   2.091   2.092   2.134
61    N         0.250   0.254   0.222   0.239   0.244   0.192   0.110   0.117   0.063
62    A         0.250   0.262   0.225   0.089   0.117   0.050   0.110   0.128   0.067
63    L        -0.976  -0.976  -0.959  -1.045  -1.045  -1.014  -0.881  -0.880  -0.847
64    A        -0.976  -0.976  -0.959  -1.069  -1.069  -1.039  -0.881  -0.880  -0.847
65    S        -0.976  -0.976  -0.959  -0.880  -0.879  -0.848  -0.881  -0.880  -0.847
66    Q        -0.976  -0.976  -0.959  -0.750  -0.746  -0.718  -0.881  -0.880  -0.847
67    L        -0.976  -0.976  -0.959  -1.063  -1.057  -1.033  -0.881  -0.880  -0.847
68    D         0.250   0.262   0.225   0.208   0.222   0.173   0.110   0.128   0.067
69    R         0.250   0.254   0.222   0.312   0.316   0.272   0.110   0.117   0.063
70    Y        -0.976  -0.976  -0.959  -0.897  -0.902  -0.866  -0.881  -0.880  -0.847
71    E         0.250   0.236   0.214   0.217   0.193   0.167   0.110   0.087   0.050
72    K        -0.976  -0.976  -0.959  -1.094  -1.086  -1.063  -0.881  -0.880  -0.847
73    G        -0.976  -0.976  -0.959  -1.021  -1.024  -0.990  -0.881  -0.880  -0.847
74    W         0.250   0.262   0.225   0.312   0.331   0.283   0.110   0.128   0.067
75    Q        -0.976  -0.976  -0.959  -0.926  -0.925  -0.895  -0.881  -0.880  -0.847
76    S        -0.976  -0.976  -0.959  -1.009  -1.014  -0.978  -0.881  -0.880  -0.847
77    K        -0.976  -0.976  -0.959  -0.846  -0.834  -0.814  -0.881  -0.880  -0.847
78    I         0.250   0.262   0.225   0.058   0.081   0.015   0.110   0.128   0.067
79    A         0.250   0.254   0.222   0.217   0.233   0.166   0.110   0.117   0.063
80    N        -0.976  -0.976  -0.959  -0.909  -0.905  -0.877  -0.881  -0.880  -0.847
81    F        -0.976  -0.976  -0.959  -0.944  -0.939  -0.912  -0.881  -0.880  -0.847
82    R         0.250   0.236   0.214   0.173   0.149   0.101   0.110   0.087   0.050
83    L         0.250   0.262   0.225   0.143   0.162   0.089   0.110   0.128   0.067
84    Q         0.250   0.262   0.225   0.226   0.244   0.192   0.110   0.128   0.067
85    V         0.250   0.236   0.214   0.035   0.006  -0.036   0.110   0.087   0.050
86    Q        -0.976  -0.976  -0.959  -0.812  -0.808  -0.780  -0.881  -0.880  -0.847
87    H        -0.976  -0.976  -0.959  -0.657  -0.660  -0.624  -0.881  -0.880  -0.847
88    V        -0.976  -0.976  -0.959  -1.021  -1.023  -0.990  -0.881  -0.880  -0.847
89    I        -0.976  -0.976  -0.959  -1.137  -1.137  -1.107  -0.881  -0.880  -0.847
90    N         0.250   0.262   0.225   0.375   0.403   0.329   0.110   0.128   0.067
91    Y         1.939   1.940   1.972   2.073   2.073   2.124   2.091   2.092   2.134
92    S        -0.976  -0.976  -0.959  -0.920  -0.919  -0.889  -0.881  -0.880  -0.847
93    R         0.250   0.236   0.214   0.173   0.149   0.101   0.110   0.087   0.050
94    K         0.250   0.254   0.222   0.138   0.150   0.101   0.110   0.117   0.063
95    N         1.939   1.940   1.972   1.933   1.935   1.983   2.091   2.092   2.134
96    I         0.250   0.254   0.222   0.134   0.138   0.081   0.110   0.117   0.063
97    F         1.939   1.940   1.972   2.054   2.055   2.105   2.091   2.092   2.134
98    N        -0.976  -0.976  -0.959  -0.985  -0.990  -0.954  -0.881  -0.880  -0.847
99    V         0.250   0.262   0.225   0.290   0.309   0.239   0.110   0.128   0.067
100   D        -0.976  -0.976  -0.959  -0.944  -0.946  -0.912  -0.881  -0.880  -0.847
101   S        -0.976  -0.976  -0.959  -0.985  -0.980  -0.954  -0.881  -0.880  -0.847
102   E         1.939   1.940   1.972   1.847   1.847   1.897   2.091   2.092   2.134
103   N         0.250   0.254   0.222   0.178   0.184   0.124   0.110   0.117   0.063
104   K        -0.976  -0.976  -0.959  -1.009  -1.008  -0.978  -0.881  -0.880  -0.847
105   H         0.250   0.262   0.225   0.295   0.308   0.269   0.110   0.128   0.067
106   T        -0.976  -0.976  -0.959  -0.840  -0.846  -0.808  -0.881  -0.880  -0.847
107   V        -0.976  -0.976  -0.959  -1.156  -1.162  -1.126  -0.881  -0.880  -0.847
108   V         0.250   0.236   0.214   0.134   0.113   0.077   0.110   0.087   0.050
109   P         0.250   0.254   0.222   0.388   0.393   0.339   0.110   0.117   0.063
110   G        -0.976  -0.976  -0.959  -0.886  -0.884  -0.854  -0.881  -0.880  -0.847
111   S         1.939   1.940   1.972   1.867   1.868   1.916   2.091   2.092   2.134
112   L         0.250   0.254   0.222  -0.001   0.002  -0.051   0.110   0.117   0.063
113   I        -0.976  -0.976  -0.959  -1.003  -1.010  -0.972  -0.881  -0.880  -0.847
114   A         0.250   0.236   0.214   0.295   0.280   0.240   0.110   0.087   0.050
115   L         1.939   1.940   1.972   1.741   1.741   1.790   2.091   2.092   2.134
116   G         1.939   1.940   1.972   2.036   2.036   2.086   2.091   2.092   2.134
117   A         1.939   1.940   1.972   1.952   1.963   2.002   2.091   2.092   2.134
118   F         0.250   0.254   0.222   0.462   0.472   0.427   0.110   0.117   0.063
119   F         1.939   1.940   1.972   2.054   2.055   2.105   2.091   2.092   2.134
120   A        -0.976  -0.976  -0.959  -0.829  -0.826  -0.797  -0.881  -0.880  -0.847
121   G         1.939   1.940   1.972   2.036   2.036   2.086   2.091   2.092   2.134
122   S         0.250   0.236   0.214   0.178   0.153   0.120   0.110   0.087   0.050
123   I         0.250   0.254   0.222   0.134   0.138   0.081   0.110   0.117   0.063
124   A        -0.976  -0.976  -0.959  -1.112  -1.112  -1.082  -0.881  -0.880  -0.847
125   V        -0.976  -0.976  -0.959  -1.027  -1.029  -0.996  -0.881  -0.880  -0.847
126   N         0.250   0.254   0.222   0.200   0.206   0.149   0.110   0.117   0.063
127   R        -0.976  -0.976  -0.959  -0.920  -0.916  -0.889  -0.881  -0.880  -0.847
128   S        -0.976  -0.976  -0.959  -0.944  -0.946  -0.912  -0.881  -0.880  -0.847
129   N         1.939   1.940   1.972   1.933   1.935   1.983   2.091   2.092   2.134
130   W         1.939   1.940   1.972   2.201   2.213   2.252   2.091   2.092   2.134
131   G         1.939   1.940   1.972   2.036   2.036   2.086   2.091   2.092   2.134
132   A        -0.976  -0.976  -0.959  -0.761  -0.757  -0.729  -0.881  -0.880  -0.847
133   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
134   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
135   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
136   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
137   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
138   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
139   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
140   K         0.250   0.236   0.214   0.129   0.113   0.079   0.110   0.087   0.050
141   R        -0.976  -0.976  -0.959  -0.950  -0.945  -0.918  -0.881  -0.880  -0.847
142   L         0.250   0.254   0.222   0.103   0.106   0.065   0.110   0.117   0.063
143   I         0.250   0.236   0.214   0.098   0.070   0.026   0.110   0.087   0.050
144   F        -0.976  -0.976  -0.959  -1.003  -1.008  -0.972  -0.881  -0.880  -0.847
145   G         0.250   0.262   0.225   0.129   0.151   0.094   0.110   0.128   0.067
146   H        -0.976  -0.976  -0.959  -0.674  -0.677  -0.640  -0.881  -0.880  -0.847
147   K        -0.976  -0.976  -0.959  -0.915  -0.902  -0.883  -0.881  -0.880  -0.847
148   S         0.250   0.262   0.225   0.346   0.365   0.296   0.110   0.128   0.067
149   S         0.250   0.236   0.214   0.182   0.158   0.125   0.110   0.087   0.050
150   I        -0.976  -0.976  -0.959  -0.789  -0.784  -0.757  -0.881  -0.880  -0.847
151   L         0.250   0.262   0.225   0.256   0.274   0.200   0.110   0.128   0.067
152   E        -0.976  -0.976  -0.959  -0.961  -0.962  -0.930  -0.881  -0.880  -0.847
153   K         0.250   0.236   0.214   0.239   0.226   0.204   0.110   0.087   0.050
154   L         0.250   0.236   0.214   0.112   0.088   0.063   0.110   0.087   0.050
155   C        -0.976  -0.976  -0.959  -0.630  -0.630  -0.597  -0.881  -0.880  -0.847
156   T         0.250   0.236   0.214   0.226   0.199   0.160   0.110   0.087   0.050
157   S         0.250   0.254   0.222   0.169   0.175   0.123   0.110   0.117   0.063
158   L         0.250   0.236   0.214  -0.001  -0.029  -0.065   0.110   0.087   0.050
159   P         1.939   1.940   1.972   2.091   2.093   2.142   2.091   2.092   2.134
160   S        -0.976  -0.976  -0.959  -1.033  -1.028  -1.002  -0.881  -0.880  -0.847
161   R         1.939   1.940   1.972   1.952   1.952   2.002   2.091   2.092   2.134
162   I         0.250   0.254   0.222   0.098   0.103   0.041   0.110   0.117   0.063
163   L        -0.976  -0.976  -0.959  -1.063  -1.066  -1.033  -0.881  -0.880  -0.847
164   L         1.939   1.940   1.972   1.741   1.741   1.790   2.091   2.092   2.134
165   P         1.939   1.940   1.972   2.091   2.093   2.142   2.091   2.092   2.134
166   W         0.250   0.236   0.214   0.454   0.437   0.384   0.110   0.087   0.050
167   V        -0.976  -0.976  -0.959  -0.956  -0.956  -0.924  -0.881  -0.880  -0.847
168   L         1.939   1.940   1.972   1.741   1.741   1.790   2.091   2.092   2.134
169   A         1.939   1.940   1.972   1.952   1.963   2.002   2.091   2.092   2.134
170   A         0.250   0.262   0.225   0.333   0.354   0.288   0.110   0.128   0.067
171   A        -0.976  -0.976  -0.959  -0.817  -0.813  -0.785  -0.881  -0.880  -0.847
172   T         0.250   0.254   0.222   0.204   0.208   0.150   0.110   0.117   0.063
173   F         0.250   0.254   0.222   0.404   0.409   0.362   0.110   0.117   0.063
174   K        -0.976  -0.976  -0.959  -1.075  -1.070  -1.045  -0.881  -0.880  -0.847
175   Y        -0.976  -0.976  -0.959  -0.846  -0.842  -0.814  -0.881  -0.880  -0.847
176   W        -0.976  -0.976  -0.959  -0.806  -0.803  -0.774  -0.881  -0.880  -0.847
177   A        -0.976  -0.976  -0.959  -1.021  -1.022  -0.990  -0.881  -0.880  -0.847
178   P         1.939   1.940   1.972   2.091   2.093   2.142   2.091   2.092   2.134
179   Q        -0.976  -0.976  -0.959  -0.903  -0.903  -0.871  -0.881  -0.880  -0.847
180   T         1.939   1.940   1.972   1.961   1.961   2.011   2.091   2.092   2.134
181   S         0.250   0.254   0.222   0.295   0.305   0.263   0.110   0.117   0.063
182   Q        -0.976  -0.976  -0.959  -0.874  -0.872  -0.842  -0.881  -0.880  -0.847
183   N         0.250   0.236   0.214   0.156   0.133   0.084   0.110   0.087   0.050
184   L        -0.976  -0.976  -0.959  -0.961  -0.955  -0.930  -0.881  -0.880  -0.847
185   V         0.250   0.254   0.222   0.035   0.039  -0.021   0.110   0.117   0.063
186   N        -0.976  -0.976  -0.959  -1.027  -1.031  -0.996  -0.881  -0.880  -0.847
187   A         0.250   0.236   0.214   0.260   0.245   0.201   0.110   0.087   0.050
188   T        -0.976  -0.976  -0.959  -0.728  -0.725  -0.695  -0.881  -0.880  -0.847
189   E         0.250   0.254   0.222   0.076   0.083   0.021   0.110   0.117   0.063
190   N         0.250   0.262   0.225   0.247   0.264   0.203   0.110   0.128   0.067
191   D         1.939   1.940   1.972   2.054   2.055   2.105   2.091   2.092   2.134
192   L         0.250   0.262   0.225   0.035   0.052  -0.017   0.110   0.128   0.067
193   L         1.939   1.940   1.972   1.741   1.741   1.790   2.091   2.092   2.134
194   P         1.939   1.940   1.972   2.091   2.093   2.142   2.091   2.092   2.134
195   A         0.250   0.262   0.225   0.089   0.117   0.050   0.110   0.128   0.067
196   D         0.250   0.236   0.214   0.341   0.316   0.277   0.110   0.087   0.050
197   F         0.250   0.262   0.225   0.182   0.196   0.147   0.110   0.128   0.067
198   V         0.250   0.236   0.214   0.138   0.112   0.082   0.110   0.087   0.050
199   K         0.250   0.254   0.222   0.040   0.051  -0.009   0.110   0.117   0.063
200   S        -0.976  -0.976  -0.959  -0.863  -0.851  -0.831  -0.881  -0.880  -0.847
201   Y        -0.976  -0.976  -0.959  -0.915  -0.919  -0.883  -0.881  -0.880  -0.847
202   H        -0.976  -0.976  -0.959  -0.880  -0.881  -0.848  -0.881  -0.880  -0.847
203   N        -0.976  -0.976  -0.959  -0.846  -0.840  -0.814  -0.881  -0.880  -0.847
204   T        -0.976  -0.976  -0.959  -1.075  -1.080  -1.045  -0.881  -0.880  -0.847
205   W        -0.976  -0.976  -0.959  -0.778  -0.775  -0.746  -0.881  -0.880  -0.847
206   K        -0.976  -0.976  -0.959  -0.944  -0.941  -0.912  -0.881  -0.880  -0.847
207   R        -0.976  -0.976  -0.959  -0.750  -0.745  -0.718  -0.881  -0.880  -0.847
208   I         0.250   0.236   0.214   0.098   0.070   0.026   0.110   0.087   0.050
209   Y         0.250   0.254   0.222   0.337   0.342   0.285   0.110   0.117   0.063
210   E         0.250   0.236   0.214   0.165   0.138   0.108   0.110   0.087   0.050
211   E         0.250   0.254   0.222   0.076   0.083   0.021   0.110   0.117   0.063
212   G         1.939   1.940   1.972   2.036   2.036   2.086   2.091   2.092   2.134
213   Y         0.250   0.262   0.225   0.120   0.134   0.088   0.110   0.128   0.067
214   V         0.250   0.254   0.222   0.049   0.057  -0.005   0.110   0.117   0.063
215   A        -0.976  -0.976  -0.959  -0.950  -0.946  -0.918  -0.881  -0.880  -0.847
216   K        -0.976  -0.976  -0.959  -0.915  -0.905  -0.883  -0.881  -0.880  -0.847
217   K        -0.976  -0.976  -0.959  -1.143  -1.139  -1.113  -0.881  -0.880  -0.847
218   C        -0.976  -0.976  -0.959  -0.800  -0.804  -0.768  -0.881  -0.880  -0.847
219   D        -0.976  -0.976  -0.959  -0.880  -0.883  -0.848  -0.881  -0.880  -0.847
220   L         0.250   0.236   0.214   0.031   0.005  -0.029   0.110   0.087   0.050
221   K        -0.976  -0.976  -0.959  -1.075  -1.072  -1.045  -0.881  -0.880  -0.847
222   R         0.250   0.262   0.225   0.383   0.411   0.338   0.110   0.128   0.067
223   Q        -0.976  -0.976  -0.959  -0.863  -0.853  -0.831  -0.881  -0.880  -0.847
224   I        -0.976  -0.976  -0.959  -1.021  -1.019  -0.990  -0.881  -0.880  -0.847
225   D        -0.976  -0.976  -0.959  -0.593  -0.595  -0.560  -0.881  -0.880  -0.847
226   Q        -0.976  -0.976  -0.959  -0.874  -0.873  -0.842  -0.881  -0.880  -0.847
227   T         0.250   0.262   0.225   0.243   0.260   0.201   0.110   0.128   0.067
228   L         0.250   0.236   0.214   0.221   0.202   0.188   0.110   0.087   0.050
229   Q         0.250   0.236   0.214   0.337   0.319   0.267   0.110   0.087   0.050
230   K        -0.976  -0.976  -0.959  -0.944  -0.932  -0.912  -0.881  -0.880  -0.847
231   N        -0.976  -0.976  -0.959  -0.961  -0.956  -0.930  -0.881  -0.880  -0.847
232   I         0.250   0.236   0.214   0.134   0.106   0.066   0.110   0.087   0.050
233   R        -0.976  -0.976  -0.959  -0.530  -0.527  -0.496  -0.881  -0.880  -0.847
234   Y        -0.976  -0.976  -0.959  -0.874  -0.878  -0.842  -0.881  -0.880  -0.847
235   A        -0.976  -0.976  -0.959  -1.021  -1.020  -0.990  -0.881  -0.880  -0.847
236   R         1.939   1.940   1.972   1.952   1.952   2.002   2.091   2.092   2.134
237   E         0.250   0.236   0.214   0.307   0.286   0.270   0.110   0.087   0.050
238   Q        -0.976  -0.976  -0.959  -0.857  -0.856  -0.825  -0.881  -0.880  -0.847
239   L         0.250   0.262   0.225   0.098   0.116   0.045   0.110   0.128   0.067
240   Y         0.250   0.262   0.225   0.312   0.337   0.275   0.110   0.128   0.067
241   E         1.939   1.940   1.972   1.847   1.847   1.897   2.091   2.092   2.134
242   K        -0.976  -0.976  -0.959  -0.932  -0.919  -0.901  -0.881  -0.880  -0.847
243   L         0.250   0.254   0.222  -0.001   0.002  -0.051   0.110   0.117   0.063
244   E        -0.976  -0.976  -0.959  -1.009  -1.004  -0.978  -0.881  -0.880  -0.847
245   Q         0.100   0.100   0.123  -0.044  -0.043  -0.007  -0.138  -0.137  -0.102
246   A         0.100   0.100   0.123   0.196   0.197   0.234  -0.138  -0.137  -0.102
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/P50945
Output conservation file - output/P50945
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
