1     M         2.008   2.011   2.032   2.360   2.367   2.400   2.182   2.186   2.215
2     D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
3     T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
4     K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
5     L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
6     S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
7     V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
8     T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
9     G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
10    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
11    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
12    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
13    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
14    Q         0.109   0.110   0.125   0.045   0.057   0.072  -0.117  -0.115  -0.091
15    G         0.109   0.110   0.125   0.199   0.200   0.227  -0.117  -0.115  -0.091
16    K         2.008   2.011   2.032   1.471   1.472   1.506   2.182   2.186   2.215
17    A         2.008   2.011   2.032   2.125   2.130   2.164   2.182   2.186   2.215
18    S         0.109   0.110   0.125   0.000   0.011   0.027  -0.117  -0.115  -0.091
19    G         2.008   2.011   2.032   2.200   2.206   2.239   2.182   2.186   2.215
20    L         0.109   0.110   0.125  -0.440  -0.443  -0.415  -0.117  -0.115  -0.091
21    G         0.109   0.110   0.125   0.220   0.222   0.248  -0.117  -0.115  -0.091
22    N         0.109   0.110   0.125  -0.103  -0.103  -0.076  -0.117  -0.115  -0.091
23    E         0.264   0.254   0.231   0.221   0.216   0.155   0.139   0.123   0.083
24    G         0.264   0.248   0.228   0.480   0.458   0.422   0.139   0.112   0.080
25    T        -1.002  -1.001  -0.990  -0.729  -0.725  -0.707  -0.883  -0.880  -0.859
26    P         0.264   0.254   0.231   0.532   0.515   0.476   0.139   0.123   0.083
27    I        -1.002  -1.001  -0.990  -1.105  -1.114  -1.085  -0.883  -0.880  -0.859
28    G        -1.002  -1.001  -0.990  -0.531  -0.528  -0.507  -0.883  -0.880  -0.859
29    N        -1.002  -1.001  -0.990  -1.281  -1.286  -1.261  -0.883  -0.880  -0.859
30    E        -1.002  -1.001  -0.990  -1.155  -1.147  -1.135  -0.883  -0.880  -0.859
31    E         0.264   0.248   0.228   0.340   0.328   0.284   0.139   0.112   0.080
32    S         0.264   0.248   0.228  -0.076  -0.109  -0.163   0.139   0.112   0.080
33    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
34    T         0.109   0.110   0.125   0.145   0.145   0.172  -0.117  -0.115  -0.091
35    N         0.109   0.110   0.125   0.034   0.045   0.061  -0.117  -0.115  -0.091
36    K         2.008   2.011   2.032   1.471   1.472   1.506   2.182   2.186   2.215
37    A        -1.002  -1.001  -0.990  -1.134  -1.152  -1.113  -0.883  -0.880  -0.859
38    K         0.264   0.248   0.228  -0.280  -0.312  -0.340   0.139   0.112   0.080
39    N         2.008   2.011   2.032   1.859   1.863   1.896   2.182   2.186   2.215
40    G         0.264   0.254   0.231   0.499   0.484   0.447   0.139   0.123   0.083
41    N        -1.002  -1.001  -0.990  -0.774  -0.762  -0.752  -0.883  -0.880  -0.859
42    K        -1.002  -1.001  -0.990  -1.000  -0.985  -0.979  -0.883  -0.880  -0.859
43    K        -1.002  -1.001  -0.990  -1.318  -1.304  -1.299  -0.883  -0.880  -0.859
44    R         0.264   0.254   0.231   0.403   0.387   0.359   0.139   0.123   0.083
45    N        -1.002  -1.001  -0.990  -0.872  -0.865  -0.850  -0.883  -0.880  -0.859
46    K         0.264   0.254   0.231  -0.185  -0.205  -0.231   0.139   0.123   0.083
47    N         0.264   0.296   0.247  -0.280  -0.234  -0.311   0.139   0.191   0.110
48    R         0.264   0.248   0.228   0.231   0.200   0.163   0.139   0.112   0.080
49    N         0.264   0.296   0.247   0.359   0.419   0.323   0.139   0.191   0.110
50    R         0.264   0.248   0.228   0.300   0.277   0.241   0.139   0.112   0.080
51    N        -1.002  -1.001  -0.990  -0.932  -0.927  -0.911  -0.883  -0.880  -0.859
52    K         0.264   0.254   0.231  -0.258  -0.275  -0.312   0.139   0.123   0.083
53    K         2.008   2.011   2.032   1.528   1.528   1.563   2.182   2.186   2.215
54    T         0.264   0.296   0.247   0.456   0.506   0.429   0.139   0.191   0.110
55    E         0.264   0.248   0.228   0.221   0.203   0.150   0.139   0.112   0.080
56    T         0.109   0.110   0.125   0.084   0.076   0.111  -0.117  -0.115  -0.091
57    K         0.109   0.110   0.125  -0.522  -0.562  -0.498  -0.117  -0.115  -0.091
58    E         0.109   0.110   0.125   0.073   0.099   0.100  -0.117  -0.115  -0.091
59    Q         2.008   2.011   2.032   2.148   2.174   2.187   2.182   2.186   2.215
60    N         0.109   0.110   0.125  -0.202  -0.224  -0.177  -0.117  -0.115  -0.091
61    E         0.109   0.110   0.125   0.073   0.099   0.100  -0.117  -0.115  -0.091
62    P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
63    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
64    P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
65    V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
66    T         0.109   0.110   0.125   0.019   0.009   0.046  -0.117  -0.115  -0.091
67    G         2.008   2.011   2.032   2.177   2.174   2.216   2.182   2.186   2.215
68    G         0.109   0.110   0.125  -0.248  -0.272  -0.223  -0.117  -0.115  -0.091
69    E         0.264   0.296   0.247  -0.180  -0.131  -0.202   0.139   0.191   0.110
70    E        -1.002  -1.001  -0.990  -1.311  -1.311  -1.291  -0.883  -0.880  -0.859
71    V         0.264   0.248   0.228   0.485   0.456   0.435   0.139   0.112   0.080
72    R        -1.002  -1.001  -0.990  -0.666  -0.661  -0.643  -0.883  -0.880  -0.859
73    V         0.264   0.254   0.231   0.442   0.423   0.391   0.139   0.123   0.083
74    E         0.264   0.248   0.228   0.072   0.048  -0.017   0.139   0.112   0.080
75    K         0.264   0.248   0.228  -0.141  -0.165  -0.185   0.139   0.112   0.080
76    S        -1.002  -1.001  -0.990  -1.021  -1.016  -1.000  -0.883  -0.880  -0.859
77    Q        -1.002  -1.001  -0.990  -0.899  -0.898  -0.877  -0.883  -0.880  -0.859
78    A        -1.002  -1.001  -0.990  -0.905  -0.909  -0.884  -0.883  -0.880  -0.859
79    K        -1.002  -1.001  -0.990  -1.221  -1.210  -1.201  -0.883  -0.880  -0.859
80    N        -1.002  -1.001  -0.990  -1.098  -1.081  -1.078  -0.883  -0.880  -0.859
81    R         0.264   0.254   0.231   0.330   0.313   0.278   0.139   0.123   0.083
82    R        -1.002  -1.001  -0.990  -0.953  -0.956  -0.931  -0.883  -0.880  -0.859
83    R        -1.002  -1.001  -0.990  -1.134  -1.147  -1.113  -0.883  -0.880  -0.859
84    K         2.008   2.011   2.032   1.528   1.528   1.563   2.182   2.186   2.215
85    N         0.264   0.254   0.231   0.057   0.042  -0.003   0.139   0.123   0.083
86    N        -1.002  -1.001  -0.990  -1.049  -1.035  -1.028  -0.883  -0.880  -0.859
87    N        -1.002  -1.001  -0.990  -1.119  -1.121  -1.099  -0.883  -0.880  -0.859
88    G         0.264   0.254   0.231   0.359   0.342   0.291   0.139   0.123   0.083
89    A        -1.002  -1.001  -0.990  -1.127  -1.133  -1.106  -0.883  -0.880  -0.859
90    N         0.264   0.248   0.228   0.165   0.142   0.114   0.139   0.112   0.080
91    K         0.109   0.110   0.125  -0.328  -0.331  -0.303  -0.117  -0.115  -0.091
92    K         0.109   0.110   0.125  -0.415  -0.418  -0.390  -0.117  -0.115  -0.091
93    N         0.109   0.110   0.125  -0.516  -0.520  -0.492  -0.117  -0.115  -0.091
94    T         0.109   0.110   0.125  -0.328  -0.331  -0.303  -0.117  -0.115  -0.091
95    L         0.109   0.110   0.125   0.210   0.211   0.238  -0.117  -0.115  -0.091
96    H         0.109   0.110   0.125  -0.126  -0.127  -0.100  -0.117  -0.115  -0.091
97    Y         0.109   0.110   0.125   0.145   0.145   0.172  -0.117  -0.115  -0.091
98    S        -1.002  -1.001  -0.990  -0.846  -0.836  -0.824  -0.883  -0.880  -0.859
99    K         0.264   0.254   0.231  -0.280  -0.301  -0.337   0.139   0.123   0.083
100   E        -1.002  -1.001  -0.990  -0.755  -0.746  -0.732  -0.883  -0.880  -0.859
101   I         0.264   0.254   0.231   0.364   0.349   0.307   0.139   0.123   0.083
102   N        -1.002  -1.001  -0.990  -1.288  -1.283  -1.269  -0.883  -0.880  -0.859
103   V        -1.002  -1.001  -0.990  -0.787  -0.786  -0.765  -0.883  -0.880  -0.859
104   E        -1.002  -1.001  -0.990  -0.787  -0.767  -0.765  -0.883  -0.880  -0.859
105   E         0.109   0.110   0.125   0.073   0.076   0.100  -0.117  -0.115  -0.091
106   R         0.109   0.110   0.125   0.084   0.076   0.111  -0.117  -0.115  -0.091
107   K         2.008   2.011   2.032   1.524   1.504   1.559   2.182   2.186   2.215
108   Q         2.008   2.011   2.032   2.148   2.174   2.187   2.182   2.186   2.215
109   I         0.109   0.110   0.125  -0.057  -0.083  -0.030  -0.117  -0.115  -0.091
110   A         0.109   0.110   0.125   0.009   0.020   0.035  -0.117  -0.115  -0.091
111   K         2.008   2.011   2.032   1.524   1.504   1.559   2.182   2.186   2.215
112   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
113   R         2.008   2.011   2.032   2.044   2.047   2.083   2.182   2.186   2.215
114   Q        -1.002  -1.001  -0.990  -1.105  -1.105  -1.085  -0.883  -0.880  -0.859
115   E         0.264   0.254   0.231   0.364   0.362   0.315   0.139   0.123   0.083
116   E         0.264   0.248   0.228   0.345   0.336   0.289   0.139   0.112   0.080
117   I         0.264   0.248   0.228   0.408   0.382   0.352   0.139   0.112   0.080
118   E        -1.002  -1.001  -0.990  -0.926  -0.910  -0.904  -0.883  -0.880  -0.859
119   Q         0.264   0.248   0.228   0.379   0.365   0.318   0.139   0.112   0.080
120   C         0.264   0.254   0.231   0.630   0.612   0.567   0.139   0.123   0.083
121   I        -1.002  -1.001  -0.990  -0.623  -0.609  -0.599  -0.883  -0.880  -0.859
122   H         2.008   2.011   2.032   2.370   2.376   2.410   2.182   2.186   2.215
123   T         0.264   0.296   0.247   0.340   0.388   0.315   0.139   0.191   0.110
124   L         0.264   0.254   0.231   0.355   0.337   0.305   0.139   0.123   0.083
125   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
126   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
127   -         0.109   0.110   0.125   0.053   0.043   0.080  -0.117  -0.115  -0.091
128   S         0.264   0.248   0.228   0.320   0.304   0.281   0.139   0.112   0.080
129   D         0.264   0.248   0.228   0.447   0.427   0.394   0.139   0.112   0.080
130   F         0.264   0.254   0.231   0.532   0.515   0.476   0.139   0.123   0.083
131   K         0.264   0.254   0.231  -0.136  -0.155  -0.176   0.139   0.123   0.083
132   L         0.264   0.254   0.231   0.442   0.428   0.402   0.139   0.123   0.083
133   F         0.264   0.254   0.231   0.499   0.480   0.439   0.139   0.123   0.083
134   K         0.264   0.296   0.247   0.062   0.122   0.015   0.139   0.191   0.110
135   K         2.008   2.011   2.032   1.528   1.528   1.563   2.182   2.186   2.215
136   G         2.008   2.011   2.032   2.204   2.211   2.243   2.182   2.186   2.215
137   K        -1.002  -1.001  -0.990  -1.105  -1.080  -1.085  -0.883  -0.880  -0.859
138   H        -1.002  -1.001  -0.990  -0.436  -0.437  -0.411  -0.883  -0.880  -0.859
139   V         0.264   0.248   0.228   0.418   0.389   0.360   0.139   0.112   0.080
140   T         0.264   0.248   0.228   0.300   0.269   0.229   0.139   0.112   0.080
141   S         0.264   0.296   0.247   0.320   0.379   0.286   0.139   0.191   0.110
142   Y         2.008   2.011   2.032   2.277   2.284   2.317   2.182   2.186   2.215
143   G         0.264   0.296   0.247   0.241   0.293   0.219   0.139   0.191   0.110
144   Y        -1.002  -1.001  -0.990  -0.623  -0.625  -0.599  -0.883  -0.880  -0.859
145   R         0.264   0.296   0.247   0.384   0.435   0.354   0.139   0.191   0.110
146   -         2.008   2.011   2.032   2.246   2.244   2.286   2.182   2.186   2.215
147   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
148   I         0.264   0.248   0.228   0.403   0.381   0.346   0.139   0.112   0.080
149   S        -1.002  -1.001  -0.990  -0.787  -0.775  -0.765  -0.883  -0.880  -0.859
150   P        -1.002  -1.001  -0.990  -0.787  -0.791  -0.765  -0.883  -0.880  -0.859
151   M        -1.002  -1.001  -0.990  -0.654  -0.658  -0.631  -0.883  -0.880  -0.859
152   T         0.264   0.254   0.231   0.423   0.410   0.369   0.139   0.123   0.083
153   D         0.264   0.248   0.228   0.374   0.349   0.313   0.139   0.112   0.080
154   S         0.264   0.254   0.231   0.206   0.199   0.157   0.139   0.123   0.083
155   G        -1.002  -1.001  -0.990  -1.236  -1.254  -1.216  -0.883  -0.880  -0.859
156   K        -1.002  -1.001  -0.990  -1.105  -1.080  -1.085  -0.883  -0.880  -0.859
157   I        -1.002  -1.001  -0.990  -1.266  -1.273  -1.246  -0.883  -0.880  -0.859
158   S        -1.002  -1.001  -0.990  -1.451  -1.455  -1.432  -0.883  -0.880  -0.859
159   L        -1.002  -1.001  -0.990  -0.793  -0.791  -0.771  -0.883  -0.880  -0.859
160   K         0.264   0.248   0.228  -0.185  -0.215  -0.234   0.139   0.112   0.080
161   I        -1.002  -1.001  -0.990  -0.574  -0.569  -0.550  -0.883  -0.880  -0.859
162   L        -1.002  -1.001  -0.990  -0.839  -0.842  -0.817  -0.883  -0.880  -0.859
163   F         0.264   0.248   0.228   0.542   0.511   0.482   0.139   0.112   0.080
164   N         0.264   0.248   0.228   0.165   0.143   0.114   0.139   0.112   0.080
165   I         0.264   0.248   0.228   0.408   0.382   0.352   0.139   0.112   0.080
166   P         2.008   2.011   2.032   2.267   2.271   2.306   2.182   2.186   2.215
167   L        -1.002  -1.001  -0.990  -0.641  -0.636  -0.618  -0.883  -0.880  -0.859
168   D         2.008   2.011   2.032   2.130   2.141   2.169   2.182   2.186   2.215
169   Y         2.008   2.011   2.032   2.277   2.284   2.317   2.182   2.186   2.215
170   P         2.008   2.011   2.032   2.267   2.271   2.306   2.182   2.186   2.215
171   K        -1.002  -1.001  -0.990  -1.163  -1.144  -1.142  -0.883  -0.880  -0.859
172   A        -1.002  -1.001  -0.990  -1.021  -1.027  -1.000  -0.883  -0.880  -0.859
173   P        -1.002  -1.001  -0.990  -0.592  -0.593  -0.568  -0.883  -0.880  -0.859
174   I         0.264   0.248   0.228   0.364   0.337   0.303   0.139   0.112   0.080
175   K         0.264   0.248   0.228  -0.136  -0.162  -0.179   0.139   0.112   0.080
176   L         2.008   2.011   2.032   2.044   2.048   2.083   2.182   2.186   2.215
177   T        -1.002  -1.001  -0.990  -1.042  -1.046  -1.021  -0.883  -0.880  -0.859
178   M        -1.002  -1.001  -0.990  -0.959  -0.972  -0.938  -0.883  -0.880  -0.859
179   K        -1.002  -1.001  -0.990  -1.063  -1.038  -1.042  -0.883  -0.880  -0.859
180   S         0.264   0.254   0.231  -0.076  -0.094  -0.157   0.139   0.123   0.083
181   N        -1.002  -1.001  -0.990  -1.288  -1.289  -1.269  -0.883  -0.880  -0.859
182   E        -1.002  -1.001  -0.990  -0.748  -0.734  -0.726  -0.883  -0.880  -0.859
183   E        -1.002  -1.001  -0.990  -0.980  -0.970  -0.959  -0.883  -0.880  -0.859
184   V        -1.002  -1.001  -0.990  -0.872  -0.869  -0.850  -0.883  -0.880  -0.859
185   S        -1.002  -1.001  -0.990  -0.872  -0.858  -0.850  -0.883  -0.880  -0.859
186   S        -1.002  -1.001  -0.990  -0.926  -0.903  -0.904  -0.883  -0.880  -0.859
187   Y        -1.002  -1.001  -0.990  -0.567  -0.571  -0.544  -0.883  -0.880  -0.859
188   M         0.264   0.296   0.247   0.442   0.485   0.424   0.139   0.191   0.110
189   D        -1.002  -1.001  -0.990  -0.879  -0.868  -0.857  -0.883  -0.880  -0.859
190   T         0.264   0.254   0.231   0.384   0.365   0.326   0.139   0.123   0.083
191   V         0.264   0.296   0.247   0.408   0.459   0.382   0.139   0.191   0.110
192   I        -1.002  -1.001  -0.990  -0.574  -0.568  -0.550  -0.883  -0.880  -0.859
193   A        -1.002  -1.001  -0.990  -1.258  -1.278  -1.238  -0.883  -0.880  -0.859
194   N         2.008   2.011   2.032   1.859   1.863   1.896   2.182   2.186   2.215
195   F         2.008   2.011   2.032   2.267   2.270   2.306   2.182   2.186   2.215
196   N         0.264   0.248   0.228  -0.119  -0.158  -0.205   0.139   0.112   0.080
197   W        -1.002  -1.001  -0.990  -0.483  -0.486  -0.459  -0.883  -0.880  -0.859
198   K         0.264   0.248   0.228  -0.258  -0.286  -0.315   0.139   0.112   0.080
199   A         0.264   0.296   0.247   0.226   0.277   0.203   0.139   0.191   0.110
200   R         0.264   0.254   0.231   0.062   0.035  -0.022   0.139   0.123   0.083
201   Q        -1.002  -1.001  -0.990  -0.879  -0.878  -0.857  -0.883  -0.880  -0.859
202   L         2.008   2.011   2.032   2.044   2.048   2.083   2.182   2.186   2.215
203   V        -1.002  -1.001  -0.990  -0.781  -0.783  -0.758  -0.883  -0.880  -0.859
204   K         0.264   0.248   0.228  -0.185  -0.215  -0.234   0.139   0.112   0.080
205   E        -1.002  -1.001  -0.990  -0.787  -0.767  -0.765  -0.883  -0.880  -0.859
206   D        -1.002  -1.001  -0.990  -1.077  -1.082  -1.056  -0.883  -0.880  -0.859
207   W        -1.002  -1.001  -0.990  -0.555  -0.558  -0.532  -0.883  -0.880  -0.859
208   R         0.264   0.296   0.247   0.499   0.551   0.468   0.139   0.191   0.110
209   I         0.264   0.254   0.231   0.364   0.349   0.307   0.139   0.123   0.083
210   L         0.264   0.296   0.247   0.384   0.433   0.354   0.139   0.191   0.110
211   S         0.264   0.254   0.231   0.200   0.191   0.151   0.139   0.123   0.083
212   Q         2.008   2.011   2.032   2.130   2.143   2.169   2.182   2.186   2.215
213   I         0.264   0.296   0.247   0.330   0.380   0.304   0.139   0.191   0.110
214   N         2.008   2.011   2.032   1.859   1.863   1.896   2.182   2.186   2.215
215   Y         0.264   0.248   0.228   0.649   0.626   0.600   0.139   0.112   0.080
216   L         2.008   2.011   2.032   2.044   2.048   2.083   2.182   2.186   2.215
217   V         2.008   2.011   2.032   2.141   2.143   2.180   2.182   2.186   2.215
218   S        -1.002  -1.001  -0.990  -1.042  -1.036  -1.021  -0.883  -0.880  -0.859
219   E        -1.002  -1.001  -0.990  -1.098  -1.090  -1.078  -0.883  -0.880  -0.859
220   L        -1.002  -1.001  -0.990  -0.531  -0.523  -0.507  -0.883  -0.880  -0.859
221   E        -1.002  -1.001  -0.990  -0.953  -0.940  -0.931  -0.883  -0.880  -0.859
222   I        -1.002  -1.001  -0.990  -0.932  -0.920  -0.911  -0.883  -0.880  -0.859
223   L         0.264   0.248   0.228   0.403   0.379   0.356   0.139   0.112   0.080
224   K        -1.002  -1.001  -0.990  -1.098  -1.076  -1.078  -0.883  -0.880  -0.859
225   M        -1.002  -1.001  -0.990  -0.729  -0.734  -0.707  -0.883  -0.880  -0.859
226   E        -1.002  -1.001  -0.990  -0.839  -0.827  -0.817  -0.883  -0.880  -0.859
227   N         0.264   0.254   0.231   0.129   0.120   0.077   0.139   0.123   0.083
228   Y         2.008   2.011   2.032   2.277   2.284   2.317   2.182   2.186   2.215
229   K        -1.002  -1.001  -0.990  -1.084  -1.067  -1.063  -0.883  -0.880  -0.859
230   Q        -1.002  -1.001  -0.990  -0.879  -0.876  -0.857  -0.883  -0.880  -0.859
231   I        -1.002  -1.001  -0.990  -0.717  -0.715  -0.694  -0.883  -0.880  -0.859
232   D         0.264   0.248   0.228   0.379   0.363   0.318   0.139   0.112   0.080
233   K        -1.002  -1.001  -0.990  -1.098  -1.078  -1.078  -0.883  -0.880  -0.859
234   L        -1.002  -1.001  -0.990  -0.647  -0.641  -0.624  -0.883  -0.880  -0.859
235   R        -1.002  -1.001  -0.990  -1.163  -1.169  -1.142  -0.883  -0.880  -0.859
236   N        -1.002  -1.001  -0.990  -1.451  -1.452  -1.432  -0.883  -0.880  -0.859
237   S        -1.002  -1.001  -0.990  -1.049  -1.036  -1.028  -0.883  -0.880  -0.859
238   F        -1.002  -1.001  -0.990  -0.531  -0.530  -0.507  -0.883  -0.880  -0.859
239   Y        -1.002  -1.001  -0.990  -0.442  -0.439  -0.417  -0.883  -0.880  -0.859
240   K         0.264   0.254   0.231  -0.258  -0.275  -0.312   0.139   0.123   0.083
241   T        -1.002  -1.001  -0.990  -1.251  -1.261  -1.231  -0.883  -0.880  -0.859
242   I        -1.002  -1.001  -0.990  -0.717  -0.714  -0.694  -0.883  -0.880  -0.859
243   -         0.109   0.110   0.125  -0.027  -0.029  -0.001  -0.117  -0.115  -0.091
244   -         0.109   0.110   0.125   0.053   0.067   0.080  -0.117  -0.115  -0.091
245   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
246   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
247   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
248   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
249   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
250   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
251   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
252   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
253   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
254   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
255   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
256   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
257   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
258   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
259   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
260   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
261   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
262   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/P40449
Output conservation file - output/P40449
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
