1     M         2.193   2.193   2.222   2.708   2.709   2.758   2.421   2.422   2.461
2     V         0.165   0.165   0.183  -0.160  -0.161  -0.134  -0.064  -0.064  -0.037
3     A         0.165   0.165   0.183   0.358   0.358   0.388  -0.064  -0.064  -0.037
4     D         0.165   0.165   0.183  -0.020  -0.021   0.007  -0.064  -0.064  -0.037
5     L         0.165   0.165   0.183   0.125   0.125   0.154  -0.064  -0.064  -0.037
6     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
7     -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
8     T         0.331   0.342   0.307   0.460   0.484   0.423   0.212   0.230   0.171
9     K        -1.021  -1.021  -1.010  -1.452  -1.456  -1.436  -0.893  -0.892  -0.870
10    G         0.331   0.342   0.307   0.327   0.340   0.304   0.212   0.230   0.171
11    I        -1.021  -1.021  -1.010  -0.607  -0.603  -0.584  -0.893  -0.892  -0.870
12    L         2.193   2.193   2.222   2.085   2.086   2.130   2.421   2.422   2.461
13    K         0.165   0.165   0.183   0.125   0.125   0.154  -0.064  -0.064  -0.037
14    W         0.165   0.165   0.183   0.303   0.303   0.333  -0.064  -0.064  -0.037
15    K         0.165   0.165   0.183   0.125   0.125   0.154  -0.064  -0.064  -0.037
16    S         0.165   0.165   0.183  -0.357  -0.359  -0.332  -0.064  -0.064  -0.037
17    R         0.165   0.165   0.183  -0.150  -0.151  -0.123  -0.064  -0.064  -0.037
18    I         0.165   0.165   0.183   0.293   0.294   0.324  -0.064  -0.064  -0.037
19    E         0.165   0.165   0.183   0.321   0.321   0.351  -0.064  -0.064  -0.037
20    F         2.193   2.193   2.222   2.550   2.551   2.599   2.421   2.422   2.461
21    D        -1.021  -1.021  -1.010  -0.867  -0.868  -0.847  -0.893  -0.892  -0.870
22    A         0.331   0.342   0.307   0.527   0.560   0.490   0.212   0.230   0.171
23    V         0.331   0.327   0.300   0.566   0.558   0.507   0.212   0.205   0.160
24    G        -1.021  -1.021  -1.010  -0.647  -0.649  -0.625  -0.893  -0.892  -0.870
25    S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.427  -1.425  -1.411  -0.893  -0.892  -0.870
26    S         0.331   0.325   0.299  -0.047  -0.059  -0.089   0.212   0.202   0.158
27    S         0.331   0.327   0.300  -0.087  -0.097  -0.131   0.212   0.205   0.160
28    Y         0.331   0.325   0.299   0.648   0.637   0.587   0.212   0.202   0.158
29    Y         0.331   0.327   0.300   0.432   0.421   0.350   0.212   0.205   0.160
30    E         0.331   0.342   0.307   0.148   0.164   0.108   0.212   0.230   0.171
31    E         0.331   0.327   0.300   0.440   0.433   0.395   0.212   0.205   0.160
32    L         2.193   2.193   2.222   2.085   2.086   2.130   2.421   2.422   2.461
33    K        -1.021  -1.021  -1.010  -1.090  -1.088  -1.071  -0.893  -0.892  -0.870
34    G        -1.021  -1.021  -1.010  -0.938  -0.944  -0.918  -0.893  -0.892  -0.870
35    L         2.193   2.193   2.222   2.085   2.086   2.130   2.421   2.422   2.461
36    P         0.331   0.325   0.299   0.593   0.583   0.534   0.212   0.202   0.158
37    P        -1.021  -1.021  -1.010  -1.038  -1.043  -1.019  -0.893  -0.892  -0.870
38    L         2.193   2.193   2.222   2.085   2.086   2.130   2.421   2.422   2.461
39    A         0.331   0.342   0.307   0.651   0.670   0.613   0.212   0.230   0.171
40    S         0.331   0.325   0.299  -0.021  -0.032  -0.059   0.212   0.202   0.158
41    H         0.331   0.342   0.307   0.066   0.077   0.046   0.212   0.230   0.171
42    K         0.331   0.342   0.307  -0.228  -0.213  -0.275   0.212   0.230   0.171
43    K        -1.021  -1.021  -1.010  -1.296  -1.298  -1.279  -0.893  -0.892  -0.870
44    L         2.193   2.193   2.222   2.085   2.086   2.130   2.421   2.422   2.461
45    T        -1.021  -1.021  -1.010  -0.999  -0.993  -0.979  -0.893  -0.892  -0.870
46    Q         0.331   0.325   0.299   0.667   0.657   0.624   0.212   0.202   0.158
47    A        -1.021  -1.021  -1.010  -0.977  -0.980  -0.957  -0.893  -0.892  -0.870
48    A         0.331   0.327   0.300   0.636   0.631   0.597   0.212   0.205   0.160
49    I         2.193   2.193   2.222   2.220   2.219   2.266   2.421   2.422   2.461
50    F         2.193   2.193   2.222   2.583   2.584   2.632   2.421   2.422   2.461
51    N        -1.021  -1.021  -1.010  -1.452  -1.459  -1.436  -0.893  -0.892  -0.870
52    S         0.331   0.327   0.300  -0.132  -0.142  -0.181   0.212   0.205   0.160
53    T         0.331   0.342   0.307   0.640   0.666   0.601   0.212   0.230   0.171
54    K        -1.021  -1.021  -1.010  -1.333  -1.336  -1.316  -0.893  -0.892  -0.870
55    Y        -1.021  -1.021  -1.010  -1.200  -1.210  -1.182  -0.893  -0.892  -0.870
56    E         2.193   2.193   2.222   2.264   2.264   2.310   2.421   2.422   2.461
57    L        -1.021  -1.021  -1.010  -0.602  -0.595  -0.579  -0.893  -0.892  -0.870
58    L        -1.021  -1.021  -1.010  -1.090  -1.088  -1.071  -0.893  -0.892  -0.870
59    Q         2.193   2.193   2.222   2.447   2.447   2.495   2.421   2.422   2.461
60    V         0.331   0.327   0.300   0.566   0.558   0.507   0.212   0.205   0.160
61    K         0.331   0.327   0.300  -0.092  -0.104  -0.169   0.212   0.205   0.160
62    K        -1.021  -1.021  -1.010  -0.982  -0.970  -0.963  -0.893  -0.892  -0.870
63    D         2.193   2.193   2.222   2.316   2.316   2.363   2.421   2.422   2.461
64    I         0.331   0.327   0.300   0.432   0.425   0.391   0.212   0.205   0.160
65    L        -1.021  -1.021  -1.010  -0.905  -0.891  -0.885  -0.893  -0.892  -0.870
66    S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.061  -1.056  -1.042  -0.893  -0.892  -0.870
67    I         0.331   0.325   0.299   0.432   0.422   0.389   0.212   0.202   0.158
68    Y         0.331   0.325   0.299   0.632   0.621   0.570   0.212   0.202   0.158
69    E         0.331   0.327   0.300   0.126   0.115   0.048   0.212   0.205   0.160
70    V        -1.021  -1.021  -1.010  -0.647  -0.649  -0.625  -0.893  -0.892  -0.870
71    V        -1.021  -1.021  -1.010  -0.933  -0.936  -0.912  -0.893  -0.892  -0.870
72    S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.266  -1.263  -1.249  -0.893  -0.892  -0.870
73    R        -1.021  -1.021  -1.010  -0.911  -0.916  -0.890  -0.893  -0.892  -0.870
74    D         0.331   0.327   0.300   0.404   0.395   0.350   0.212   0.205   0.160
75    I         2.193   2.193   2.222   2.220   2.219   2.266   2.421   2.422   2.461
76    D         0.331   0.325   0.299   0.388   0.376   0.329   0.212   0.202   0.158
77    E         0.331   0.327   0.300   0.412   0.413   0.364   0.212   0.205   0.160
78    E         2.193   2.193   2.222   2.264   2.264   2.310   2.421   2.422   2.461
79    R        -1.021  -1.021  -1.010  -0.693  -0.697  -0.671  -0.893  -0.892  -0.870
80    N        -1.021  -1.021  -1.010  -1.296  -1.301  -1.279  -0.893  -0.892  -0.870
81    Q         2.193   2.193   2.222   2.447   2.447   2.495   2.421   2.422   2.461
82    M         0.331   0.342   0.307   0.671   0.701   0.646   0.212   0.230   0.171
83    Q        -1.021  -1.021  -1.010  -0.944  -0.948  -0.924  -0.893  -0.892  -0.870
84    Q         0.331   0.327   0.300   0.523   0.515   0.467   0.212   0.205   0.160
85    I         0.331   0.327   0.300   0.432   0.425   0.391   0.212   0.205   0.160
86    E         0.331   0.327   0.300   0.339   0.331   0.284   0.212   0.205   0.160
87    L        -1.021  -1.021  -1.010  -1.236  -1.236  -1.218  -0.893  -0.892  -0.870
88    Q         0.331   0.342   0.307   0.236   0.250   0.205   0.212   0.230   0.171
89    L         0.331   0.327   0.300   0.169   0.162   0.115   0.212   0.205   0.160
90    K         0.331   0.327   0.300   0.131   0.122   0.078   0.212   0.205   0.160
91    K        -1.021  -1.021  -1.010  -1.177  -1.178  -1.159  -0.893  -0.892  -0.870
92    S         2.193   2.193   2.222   1.760   1.758   1.803   2.421   2.422   2.461
93    L        -1.021  -1.021  -1.010  -0.709  -0.704  -0.687  -0.893  -0.892  -0.870
94    K         2.193   2.193   2.222   2.040   2.039   2.084   2.421   2.422   2.461
95    K         0.331   0.325   0.299  -0.092  -0.108  -0.171   0.212   0.202   0.158
96    V        -1.021  -1.021  -1.010  -0.933  -0.936  -0.912  -0.893  -0.892  -0.870
97    E         0.331   0.325   0.299   0.339   0.328   0.281   0.212   0.202   0.158
98    H        -1.021  -1.021  -1.010  -0.916  -0.922  -0.896  -0.893  -0.892  -0.870
99    S         0.331   0.325   0.299   0.066   0.056   0.037   0.212   0.202   0.158
100   Y         0.331   0.327   0.300   0.788   0.782   0.745   0.212   0.205   0.160
101   K        -1.021  -1.021  -1.010  -1.177  -1.177  -1.159  -0.893  -0.892  -0.870
102   N         0.331   0.342   0.307   0.131   0.147   0.090   0.212   0.230   0.171
103   V         0.331   0.342   0.307   0.310   0.327   0.282   0.212   0.230   0.171
104   L         0.331   0.327   0.300   0.310   0.305   0.272   0.212   0.205   0.160
105   K         2.193   2.193   2.222   2.040   2.039   2.084   2.421   2.422   2.461
106   Q        -1.021  -1.021  -1.010  -0.730  -0.730  -0.708  -0.893  -0.892  -0.870
107   R         2.193   2.193   2.222   2.549   2.549   2.598   2.421   2.422   2.461
108   A        -1.021  -1.021  -1.010  -0.993  -0.997  -0.974  -0.893  -0.892  -0.870
109   S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.452  -1.451  -1.436  -0.893  -0.892  -0.870
110   T        -1.021  -1.021  -1.010  -0.517  -0.506  -0.494  -0.893  -0.892  -0.870
111   N        -1.021  -1.021  -1.010  -0.787  -0.776  -0.766  -0.893  -0.892  -0.870
112   C         0.165   0.165   0.183   0.343   0.343   0.373  -0.064  -0.064  -0.037
113   I         0.165   0.165   0.183  -0.001  -0.000   0.027  -0.064  -0.064  -0.037
114   N        -1.021  -1.021  -1.010  -1.118  -1.120  -1.100  -0.893  -0.892  -0.870
115   G         0.331   0.327   0.300   0.716   0.709   0.660   0.212   0.205   0.160
116   N        -1.021  -1.021  -1.010  -1.212  -1.204  -1.194  -0.893  -0.892  -0.870
117   D         0.331   0.325   0.299   0.177   0.162   0.095   0.212   0.202   0.158
118   R        -1.021  -1.021  -1.010  -0.878  -0.883  -0.858  -0.893  -0.892  -0.870
119   L         0.331   0.327   0.300   0.277   0.271   0.236   0.212   0.205   0.160
120   L         0.331   0.325   0.299   0.343   0.336   0.306   0.212   0.202   0.158
121   A        -1.021  -1.021  -1.010  -1.124  -1.127  -1.106  -0.893  -0.892  -0.870
122   N        -1.021  -1.021  -1.010  -0.999  -1.001  -0.979  -0.893  -0.892  -0.870
123   A        -1.021  -1.021  -1.010  -0.492  -0.490  -0.469  -0.893  -0.892  -0.870
124   E         0.331   0.325   0.299   0.252   0.240   0.185   0.212   0.202   0.158
125   K        -1.021  -1.021  -1.010  -1.452  -1.456  -1.436  -0.893  -0.892  -0.870
126   K         0.331   0.325   0.299   0.173   0.162   0.123   0.212   0.202   0.158
127   I        -1.021  -1.021  -1.010  -0.632  -0.629  -0.609  -0.893  -0.892  -0.870
128   G        -1.021  -1.021  -1.010  -1.044  -1.052  -1.025  -0.893  -0.892  -0.870
129   S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.236  -1.233  -1.218  -0.893  -0.892  -0.870
130   L         0.331   0.327   0.300   0.169   0.162   0.115   0.212   0.205   0.160
131   N        -1.021  -1.021  -1.010  -0.862  -0.861  -0.841  -0.893  -0.892  -0.870
132   E        -1.021  -1.021  -1.010  -1.427  -1.434  -1.411  -0.893  -0.892  -0.870
133   E        -1.021  -1.021  -1.010  -1.118  -1.121  -1.100  -0.893  -0.892  -0.870
134   L        -1.021  -1.021  -1.010  -0.933  -0.930  -0.912  -0.893  -0.892  -0.870
135   A        -1.021  -1.021  -1.010  -0.699  -0.699  -0.677  -0.893  -0.892  -0.870
136   C        -1.021  -1.021  -1.010  -0.622  -0.616  -0.599  -0.893  -0.892  -0.870
137   V         0.331   0.342   0.307   0.432   0.447   0.401   0.212   0.230   0.171
138   N        -1.021  -1.021  -1.010  -0.798  -0.797  -0.777  -0.893  -0.892  -0.870
139   D         0.331   0.325   0.299   0.388   0.376   0.329   0.212   0.202   0.158
140   I        -1.021  -1.021  -1.010  -0.602  -0.598  -0.579  -0.893  -0.892  -0.870
141   V        -1.021  -1.021  -1.010  -0.927  -0.930  -0.907  -0.893  -0.892  -0.870
142   S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.236  -1.233  -1.218  -0.893  -0.892  -0.870
143   D        -1.021  -1.021  -1.010  -0.647  -0.646  -0.625  -0.893  -0.892  -0.870
144   I        -1.021  -1.021  -1.010  -0.933  -0.931  -0.912  -0.893  -0.892  -0.870
145   V        -1.021  -1.021  -1.010  -0.933  -0.936  -0.912  -0.893  -0.892  -0.870
146   N        -1.021  -1.021  -1.010  -0.830  -0.829  -0.809  -0.893  -0.892  -0.870
147   N         0.331   0.327   0.300   0.472   0.465   0.434   0.212   0.205   0.160
148   L        -1.021  -1.021  -1.010  -0.632  -0.626  -0.609  -0.893  -0.892  -0.870
149   T         0.331   0.325   0.299   0.448   0.452   0.388   0.212   0.202   0.158
150   A         0.165   0.165   0.183  -0.128  -0.127  -0.101  -0.064  -0.064  -0.037
151   L         0.165   0.165   0.183   0.141   0.142   0.170  -0.064  -0.064  -0.037
152   N         0.165   0.165   0.183   0.028   0.028   0.056  -0.064  -0.064  -0.037
153   A         0.165   0.165   0.183  -0.128  -0.127  -0.101  -0.064  -0.064  -0.037
154   N         0.165   0.165   0.183   0.123   0.123   0.151  -0.064  -0.064  -0.037
155   L         0.165   0.165   0.183  -0.404  -0.404  -0.380  -0.064  -0.064  -0.037
156   P         0.165   0.165   0.183  -0.040  -0.039  -0.012  -0.064  -0.064  -0.037
157   K         0.165   0.165   0.183  -0.300  -0.299  -0.274  -0.064  -0.064  -0.037
158   K         0.165   0.165   0.183  -0.088  -0.088  -0.061  -0.064  -0.064  -0.037
159   A         0.165   0.165   0.183   0.396   0.397   0.427  -0.064  -0.064  -0.037
160   Q         0.165   0.165   0.183   0.234   0.235   0.264  -0.064  -0.064  -0.037
161   L         0.165   0.165   0.183  -0.404  -0.404  -0.380  -0.064  -0.064  -0.037
162   L         2.193   2.193   2.222   2.009   2.010   2.054   2.421   2.422   2.461
163   K        -1.021  -1.021  -1.010  -0.714  -0.710  -0.692  -0.893  -0.892  -0.870
164   D         0.331   0.342   0.307   0.347   0.364   0.308   0.212   0.230   0.171
165   D        -1.021  -1.021  -1.010  -0.988  -0.991  -0.968  -0.893  -0.892  -0.870
166   S         2.193   2.193   2.222   1.760   1.758   1.803   2.421   2.422   2.461
167   I         2.193   2.193   2.222   2.220   2.219   2.266   2.421   2.422   2.461
168   N        -1.021  -1.021  -1.010  -1.147  -1.150  -1.129  -0.893  -0.892  -0.870
169   V         0.331   0.325   0.299   0.640   0.637   0.586   0.212   0.202   0.158
170   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
171   -         0.165   0.165   0.183   0.051   0.050   0.079  -0.064  -0.064  -0.037
172   A        -1.021  -1.021  -1.010  -0.627  -0.616  -0.604  -0.893  -0.892  -0.870
173   H         0.331   0.327   0.300   0.758   0.751   0.708   0.212   0.205   0.160
174   Y         0.331   0.327   0.300   0.788   0.782   0.745   0.212   0.205   0.160
175   P         0.331   0.327   0.300   0.375   0.365   0.294   0.212   0.205   0.160
176   L         0.331   0.327   0.300   0.083   0.076   0.021   0.212   0.205   0.160
177   L         0.331   0.327   0.300   0.169   0.162   0.115   0.212   0.205   0.160
178   F        -1.021  -1.021  -1.010  -0.851  -0.856  -0.830  -0.893  -0.892  -0.870
179   D         0.331   0.327   0.300   0.302   0.292   0.237   0.212   0.205   0.160
180   F         0.331   0.342   0.307   0.343   0.359   0.317   0.212   0.230   0.171
181   L         0.331   0.325   0.299   0.169   0.159   0.113   0.212   0.202   0.158
182   H         0.331   0.327   0.300   0.758   0.751   0.708   0.212   0.205   0.160
183   K         0.331   0.327   0.300   0.148   0.139   0.097   0.212   0.205   0.160
184   S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.101  -1.097  -1.082  -0.893  -0.892  -0.870
185   C        -1.021  -1.021  -1.010  -0.305  -0.306  -0.280  -0.893  -0.892  -0.870
186   P         0.331   0.325   0.299   0.578   0.567   0.517   0.212   0.202   0.158
187   K         0.331   0.327   0.300   0.148   0.139   0.097   0.212   0.205   0.160
188   S         0.331   0.325   0.299   0.075   0.065   0.047   0.212   0.202   0.158
189   I        -1.021  -1.021  -1.010  -1.177  -1.180  -1.159  -0.893  -0.892  -0.870
190   I         0.331   0.342   0.307   0.302   0.320   0.259   0.212   0.230   0.171
191   A        -1.021  -1.021  -1.010  -1.101  -1.095  -1.082  -0.893  -0.892  -0.870
192   T         0.331   0.325   0.299   0.492   0.496   0.437   0.212   0.202   0.158
193   S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.427  -1.426  -1.411  -0.893  -0.892  -0.870
194   E         0.331   0.342   0.307   0.468   0.502   0.425   0.212   0.230   0.171
195   A        -1.021  -1.021  -1.010  -1.182  -1.189  -1.164  -0.893  -0.892  -0.870
196   S         0.165   0.165   0.183  -0.263  -0.264  -0.237  -0.064  -0.064  -0.037
197   I         0.165   0.165   0.183   0.087   0.086   0.115  -0.064  -0.064  -0.037
198   H         0.331   0.342   0.307   0.318   0.332   0.295   0.212   0.230   0.171
199   E         0.331   0.342   0.307   0.404   0.422   0.362   0.212   0.230   0.171
200   N         2.193   2.193   2.222   2.228   2.229   2.275   2.421   2.422   2.461
201   A         0.331   0.342   0.307  -0.047  -0.035  -0.077   0.212   0.230   0.171
202   S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.165  -1.162  -1.147  -0.893  -0.892  -0.870
203   P        -1.021  -1.021  -1.010  -0.709  -0.712  -0.687  -0.893  -0.892  -0.870
204   S         0.331   0.325   0.299  -0.052  -0.055  -0.093   0.212   0.202   0.158
205   P         0.165   0.165   0.183   0.325   0.325   0.355  -0.064  -0.064  -0.037
206   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
207   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
208   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
209   L         2.193   2.193   2.222   2.009   2.010   2.054   2.421   2.422   2.461
210   L         0.165   0.165   0.183   0.037   0.038   0.066  -0.064  -0.064  -0.037
211   E         0.165   0.165   0.183   0.132   0.133   0.161  -0.064  -0.064  -0.037
212   H        -1.021  -1.021  -1.010  -0.916  -0.924  -0.896  -0.893  -0.892  -0.870
213   D         0.331   0.327   0.300   0.388   0.379   0.332   0.212   0.205   0.160
214   E         2.193   2.193   2.222   2.264   2.264   2.310   2.421   2.422   2.461
215   L        -1.021  -1.021  -1.010  -0.949  -0.946  -0.929  -0.893  -0.892  -0.870
216   P         0.331   0.342   0.307   0.444   0.460   0.414   0.212   0.230   0.171
217   A         0.331   0.342   0.307  -0.047  -0.035  -0.077   0.212   0.230   0.171
218   E         0.331   0.325   0.299   0.476   0.467   0.433   0.212   0.202   0.158
219   S         0.331   0.325   0.299  -0.087  -0.100  -0.133   0.212   0.202   0.158
220   I         0.331   0.327   0.300   0.232   0.223   0.170   0.212   0.205   0.160
221   N         0.331   0.325   0.299   0.323   0.312   0.267   0.212   0.202   0.158
222   S         0.331   0.325   0.299  -0.114  -0.127  -0.163   0.212   0.202   0.158
223   F        -1.021  -1.021  -1.010  -0.938  -0.944  -0.918  -0.893  -0.892  -0.870
224   Y         0.331   0.325   0.299   0.728   0.717   0.676   0.212   0.202   0.158
225   -         2.193   2.193   2.222   1.660   1.659   1.701   2.421   2.422   2.461
226   -         0.165   0.165   0.183   0.089   0.089   0.118  -0.064  -0.064  -0.037
227   -         0.165   0.165   0.183   0.127   0.126   0.156  -0.064  -0.064  -0.037
228   -         2.193   2.193   2.222   1.660   1.659   1.701   2.421   2.422   2.461
229   -         0.165   0.165   0.183  -0.306  -0.297  -0.281  -0.064  -0.064  -0.037
230   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
231   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
232   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
233   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
234   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
235   -         0.165   0.165   0.183   0.080   0.079   0.108  -0.064  -0.064  -0.037
236   -         0.165   0.165   0.183   0.201   0.201   0.231  -0.064  -0.064  -0.037
237   G        -1.021  -1.021  -1.010  -0.938  -0.944  -0.918  -0.893  -0.892  -0.870
238   E         0.331   0.342   0.307   0.523   0.542   0.480   0.212   0.230   0.171
239   N         2.193   2.193   2.222   2.228   2.229   2.275   2.421   2.422   2.461
240   E        -1.021  -1.021  -1.010  -0.814  -0.813  -0.793  -0.893  -0.892  -0.870
241   L        -1.021  -1.021  -1.010  -1.010  -1.008  -0.991  -0.893  -0.892  -0.870
242   Q        -1.021  -1.021  -1.010  -0.814  -0.816  -0.793  -0.893  -0.892  -0.870
243   S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.248  -1.245  -1.230  -0.893  -0.892  -0.870
244   D         2.193   2.193   2.222   2.316   2.316   2.363   2.421   2.422   2.461
245   S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.200  -1.198  -1.182  -0.893  -0.892  -0.870
246   L        -1.021  -1.021  -1.010  -0.761  -0.756  -0.739  -0.893  -0.892  -0.870
247   A        -1.021  -1.021  -1.010  -1.333  -1.341  -1.316  -0.893  -0.892  -0.870
248   P        -1.021  -1.021  -1.010  -0.740  -0.732  -0.718  -0.893  -0.892  -0.870
249   L        -1.021  -1.021  -1.010  -1.130  -1.117  -1.111  -0.893  -0.892  -0.870
250   Q        -1.021  -1.021  -1.010  -0.587  -0.587  -0.564  -0.893  -0.892  -0.870
251   T         0.331   0.342   0.307   0.380   0.404   0.344   0.212   0.230   0.171
252   H         0.331   0.342   0.307   0.066   0.077   0.046   0.212   0.230   0.171
253   D        -1.021  -1.021  -1.010  -1.147  -1.152  -1.129  -0.893  -0.892  -0.870
254   D         0.331   0.325   0.299   0.535   0.525   0.492   0.212   0.202   0.158
255   N         0.331   0.342   0.307  -0.132  -0.119  -0.170   0.212   0.230   0.171
256   -         0.165   0.165   0.183   0.022   0.022   0.050  -0.064  -0.064  -0.037
257   -         0.165   0.165   0.183   0.099   0.108   0.127  -0.064  -0.064  -0.037
258   -         0.165   0.165   0.183   0.127   0.136   0.156  -0.064  -0.064  -0.037
259   -         0.165   0.165   0.183  -0.562  -0.564  -0.539  -0.064  -0.064  -0.037
260   -         0.165   0.165   0.183  -0.390  -0.391  -0.365  -0.064  -0.064  -0.037
261   -         0.165   0.165   0.183   0.480   0.480   0.512  -0.064  -0.064  -0.037
262   -         0.165   0.165   0.183   0.089   0.089   0.118  -0.064  -0.064  -0.037
263   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
264   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
265   I         2.193   2.193   2.222   2.220   2.219   2.266   2.421   2.422   2.461
266   S         0.331   0.325   0.299  -0.228  -0.242  -0.289   0.212   0.202   0.158
267   S         0.331   0.325   0.299  -0.132  -0.145  -0.183   0.212   0.202   0.158
268   C        -1.021  -1.021  -1.010  -0.444  -0.445  -0.420  -0.893  -0.892  -0.870
269   K        -1.021  -1.021  -1.010  -0.851  -0.837  -0.830  -0.893  -0.892  -0.870
270   K         0.331   0.342   0.307   0.083   0.103   0.034   0.212   0.230   0.171
271   I         0.331   0.327   0.300   0.375   0.368   0.329   0.212   0.205   0.160
272   L         2.193   2.193   2.222   2.085   2.086   2.130   2.421   2.422   2.461
273   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
274   P         0.331   0.327   0.300   0.375   0.365   0.294   0.212   0.205   0.160
275   K        -1.021  -1.021  -1.010  -1.113  -1.112  -1.094  -0.893  -0.892  -0.870
276   F         0.331   0.342   0.307   0.464   0.479   0.436   0.212   0.230   0.171
277   N        -1.021  -1.021  -1.010  -0.933  -0.934  -0.912  -0.893  -0.892  -0.870
278   T        -1.021  -1.021  -1.010  -1.067  -1.060  -1.048  -0.893  -0.892  -0.870
279   T         0.331   0.325   0.299   0.597   0.603   0.554   0.212   0.202   0.158
280   S         0.331   0.325   0.299  -0.047  -0.059  -0.089   0.212   0.202   0.158
281   G        -1.021  -1.021  -1.010  -0.453  -0.455  -0.429  -0.893  -0.892  -0.870
282   P         2.193   2.193   2.222   2.523   2.524   2.572   2.421   2.422   2.461
283   S         2.193   2.193   2.222   1.760   1.758   1.803   2.421   2.422   2.461
284   I         0.331   0.325   0.299   0.432   0.422   0.389   0.212   0.202   0.158
285   E         0.331   0.342   0.307   0.476   0.495   0.433   0.212   0.230   0.171
286   T         0.331   0.325   0.299   0.388   0.392   0.321   0.212   0.202   0.158
287   N        -1.021  -1.021  -1.010  -0.867  -0.857  -0.847  -0.893  -0.892  -0.870
288   F        -1.021  -1.021  -1.010  -0.782  -0.784  -0.761  -0.893  -0.892  -0.870
289   E         0.331   0.325   0.299   0.252   0.240   0.185   0.212   0.202   0.158
290   N        -1.021  -1.021  -1.010  -0.602  -0.598  -0.579  -0.893  -0.892  -0.870
291   I         0.331   0.325   0.299   0.432   0.422   0.389   0.212   0.202   0.158
292   S        -1.021  -1.021  -1.010  -0.988  -0.983  -0.968  -0.893  -0.892  -0.870
293   A         0.331   0.327   0.300   0.456   0.448   0.398   0.212   0.205   0.160
294   D        -1.021  -1.021  -1.010  -0.673  -0.662  -0.651  -0.893  -0.892  -0.870
295   G        -1.021  -1.021  -1.010  -0.693  -0.697  -0.671  -0.893  -0.892  -0.870
296   L        -1.021  -1.021  -1.010  -1.212  -1.213  -1.194  -0.893  -0.892  -0.870
297   T        -1.021  -1.021  -1.010  -0.497  -0.486  -0.474  -0.893  -0.892  -0.870
298   Y        -1.021  -1.021  -1.010  -0.814  -0.808  -0.793  -0.893  -0.892  -0.870
299   T        -1.021  -1.021  -1.010  -0.627  -0.617  -0.604  -0.893  -0.892  -0.870
300   K        -1.021  -1.021  -1.010  -0.894  -0.892  -0.874  -0.893  -0.892  -0.870
301   C        -1.021  -1.021  -1.010  -0.434  -0.427  -0.410  -0.893  -0.892  -0.870
302   S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.165  -1.162  -1.147  -0.893  -0.892  -0.870
303   L        -1.021  -1.021  -1.010  -1.084  -1.084  -1.065  -0.893  -0.892  -0.870
304   K        -1.021  -1.021  -1.010  -1.458  -1.462  -1.443  -0.893  -0.892  -0.870
305   N        -1.021  -1.021  -1.010  -1.147  -1.150  -1.129  -0.893  -0.892  -0.870
306   S         0.331   0.325   0.299  -0.047  -0.059  -0.089   0.212   0.202   0.158
307   I        -1.021  -1.021  -1.010  -0.740  -0.738  -0.718  -0.893  -0.892  -0.870
308   S        -1.021  -1.021  -1.010  -1.236  -1.233  -1.218  -0.893  -0.892  -0.870
309   L         0.331   0.325   0.299   0.169   0.159   0.113   0.212   0.202   0.158
310   T         2.193   2.193   2.222   2.414   2.414   2.461   2.421   2.422   2.461
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/P40003
Output conservation file - output/P40003
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
