1     M         1.925   1.927   1.944   2.275   2.278   2.308   2.086   2.089   2.111
2     T         1.925   1.927   1.944   2.056   2.061   2.087   2.086   2.089   2.111
3     R         1.925   1.927   1.944   2.080   2.086   2.112   2.086   2.089   2.111
4     P         1.925   1.927   1.944   2.068   2.074   2.100   2.086   2.089   2.111
5     P         1.925   1.927   1.944   2.068   2.074   2.100   2.086   2.089   2.111
6     L         0.020   0.021   0.034  -0.270  -0.269  -0.246  -0.186  -0.185  -0.163
7     V         0.020   0.021   0.034  -0.270  -0.269  -0.246  -0.186  -0.185  -0.163
8     R         0.020   0.021   0.034   0.068   0.070   0.093  -0.186  -0.185  -0.163
9     G         0.020   0.021   0.034   0.283   0.285   0.309  -0.186  -0.185  -0.163
10    I         0.020   0.021   0.034   0.164   0.166   0.190  -0.186  -0.185  -0.163
11    F         0.020   0.021   0.034   0.155   0.157   0.181  -0.186  -0.185  -0.163
12    S         0.020   0.021   0.034  -0.261  -0.260  -0.237  -0.186  -0.185  -0.163
13    L         0.020   0.021   0.034  -0.139  -0.138  -0.115  -0.186  -0.185  -0.163
14    G         1.925   1.927   1.944   2.202   2.208   2.234   2.086   2.089   2.111
15    L         0.020   0.021   0.034  -0.270  -0.269  -0.246  -0.186  -0.185  -0.163
16    S         0.020   0.021   0.034  -0.270  -0.269  -0.246  -0.186  -0.185  -0.163
17    V         1.925   1.927   1.944   2.018   2.024   2.050   2.086   2.089   2.111
18    A         0.020   0.021   0.034   0.138   0.140   0.163  -0.186  -0.185  -0.163
19    V         0.020   0.021   0.034   0.006   0.008   0.031  -0.186  -0.185  -0.163
20    L         0.020   0.021   0.034  -0.003  -0.001   0.022  -0.186  -0.185  -0.163
21    K         1.925   1.927   1.944   2.018   2.024   2.050   2.086   2.089   2.111
22    G         0.020   0.021   0.034  -0.158  -0.156  -0.133  -0.186  -0.185  -0.163
23    V         0.020   0.021   0.034  -0.270  -0.269  -0.246  -0.186  -0.185  -0.163
24    E         0.020   0.021   0.034  -0.242  -0.241  -0.218  -0.186  -0.185  -0.163
25    K         1.925   1.927   1.944   2.018   2.024   2.050   2.086   2.089   2.111
26    T         0.020   0.021   0.034   0.181   0.183   0.207  -0.186  -0.185  -0.163
27    V         0.176   0.168   0.144   0.115   0.101   0.050   0.066   0.055   0.015
28    R        -1.094  -1.093  -1.082  -0.837  -0.837  -0.815  -0.944  -0.941  -0.922
29    K        -1.094  -1.093  -1.082  -1.029  -1.028  -1.007  -0.944  -0.941  -0.922
30    H        -1.094  -1.093  -1.082  -0.956  -0.963  -0.935  -0.944  -0.941  -0.922
31    L         0.176   0.208   0.155   0.347   0.409   0.301   0.066   0.118   0.033
32    E        -1.094  -1.093  -1.082  -1.131  -1.124  -1.110  -0.944  -0.941  -0.922
33    R        -1.094  -1.093  -1.082  -0.629  -0.620  -0.606  -0.944  -0.941  -0.922
34    Q        -1.094  -1.093  -1.082  -1.046  -1.044  -1.024  -0.944  -0.941  -0.922
35    G         0.176   0.168   0.144   0.266   0.252   0.196   0.066   0.055   0.015
36    W         0.176   0.168   0.144   0.436   0.422   0.365   0.066   0.055   0.015
37    I        -1.094  -1.093  -1.082  -0.967  -0.970  -0.946  -0.944  -0.941  -0.922
38    E         1.925   1.927   1.944   1.739   1.745   1.770   2.086   2.089   2.111
39    P         0.176   0.156   0.136   0.261   0.226   0.200   0.066   0.035   0.001
40    Q        -1.094  -1.093  -1.082  -1.057  -1.059  -1.036  -0.944  -0.941  -0.922
41    K        -1.094  -1.093  -1.082  -0.896  -0.889  -0.874  -0.944  -0.941  -0.922
42    V        -1.094  -1.093  -1.082  -0.869  -0.868  -0.847  -0.944  -0.941  -0.922
43    D        -1.094  -1.093  -1.082  -1.126  -1.125  -1.105  -0.944  -0.941  -0.922
44    Y        -1.094  -1.093  -1.082  -0.670  -0.672  -0.647  -0.944  -0.941  -0.922
45    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
46    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
47    E        -1.094  -1.093  -1.082  -1.012  -0.995  -0.990  -0.944  -0.941  -0.922
48    L        -1.094  -1.093  -1.082  -1.298  -1.290  -1.277  -0.944  -0.941  -0.922
49    I        -1.094  -1.093  -1.082  -1.029  -1.033  -1.007  -0.944  -0.941  -0.922
50    F         1.925   1.927   1.944   2.179   2.183   2.211   2.086   2.089   2.111
51    T         0.020   0.021   0.034  -0.021  -0.019   0.004  -0.186  -0.185  -0.163
52    I         0.020   0.021   0.034   0.068   0.070   0.093  -0.186  -0.185  -0.163
53    D        -1.094  -1.093  -1.082  -1.057  -1.055  -1.036  -0.944  -0.941  -0.922
54    R        -1.094  -1.093  -1.082  -1.137  -1.142  -1.116  -0.944  -0.941  -0.922
55    L         0.176   0.156   0.136   0.003  -0.027  -0.057   0.066   0.035   0.001
56    K        -1.094  -1.093  -1.082  -0.837  -0.829  -0.815  -0.944  -0.941  -0.922
57    N         1.925   1.927   1.944   2.018   2.023   2.050   2.086   2.089   2.111
58    L         1.925   1.927   1.944   1.721   1.726   1.752   2.086   2.089   2.111
59    V         1.925   1.927   1.944   2.087   2.093   2.119   2.086   2.089   2.111
60    D         0.020   0.021   0.034  -0.117  -0.116  -0.092  -0.186  -0.185  -0.163
61    N         0.020   0.021   0.034  -0.066  -0.064  -0.041  -0.186  -0.185  -0.163
62    K         0.020   0.021   0.034  -0.100  -0.099  -0.075  -0.186  -0.185  -0.163
63    R         0.020   0.021   0.034   0.018   0.020   0.043  -0.186  -0.185  -0.163
64    E         0.176   0.156   0.136  -0.054  -0.085  -0.118   0.066   0.035   0.001
65    A        -1.094  -1.093  -1.082  -0.989  -0.995  -0.968  -0.944  -0.941  -0.922
66    L         0.176   0.208   0.155   0.140   0.199   0.096   0.066   0.118   0.033
67    T        -1.094  -1.093  -1.082  -0.831  -0.828  -0.809  -0.944  -0.941  -0.922
68    A        -1.094  -1.093  -1.082  -1.085  -1.086  -1.064  -0.944  -0.941  -0.922
69    E        -1.094  -1.093  -1.082  -1.029  -1.017  -1.007  -0.944  -0.941  -0.922
70    Q        -1.094  -1.093  -1.082  -0.896  -0.899  -0.874  -0.944  -0.941  -0.922
71    P         0.176   0.156   0.136   0.241   0.204   0.177   0.066   0.035   0.001
72    D         0.176   0.168   0.144   0.149   0.136   0.082   0.066   0.055   0.015
73    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
74    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
75    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
76    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
77    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
78    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
79    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
80    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
81    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
82    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
83    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
84    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
85    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
86    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
87    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
88    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
89    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
90    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
91    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
92    -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
93    -         1.925   1.927   1.944   1.864   1.869   1.895   2.086   2.089   2.111
94    A         0.176   0.208   0.155   0.266   0.317   0.233   0.066   0.118   0.033
95    G         0.176   0.208   0.155   0.270   0.318   0.242   0.066   0.118   0.033
96    E         0.176   0.168   0.144   0.094   0.085   0.058   0.066   0.055   0.015
97    L         0.176   0.168   0.144  -0.010  -0.019  -0.058   0.066   0.055   0.015
98    S        -1.094  -1.093  -1.082  -1.390  -1.384  -1.370  -0.944  -0.941  -0.922
99    W         0.176   0.168   0.144   0.436   0.422   0.365   0.066   0.055   0.015
100   R        -1.094  -1.093  -1.082  -1.097  -1.098  -1.076  -0.944  -0.941  -0.922
101   K        -1.094  -1.093  -1.082  -1.214  -1.214  -1.193  -0.944  -0.941  -0.922
102   V         0.176   0.208   0.155  -0.010   0.042  -0.041   0.066   0.118   0.033
103   F         0.176   0.156   0.136   0.491   0.461   0.434   0.066   0.035   0.001
104   N         0.176   0.208   0.155  -0.028   0.024  -0.058   0.066   0.118   0.033
105   F        -1.094  -1.093  -1.082  -0.821  -0.823  -0.799  -0.944  -0.941  -0.922
106   I         0.176   0.168   0.144   0.261   0.246   0.208   0.066   0.055   0.015
107   S        -1.094  -1.093  -1.082  -1.378  -1.372  -1.358  -0.944  -0.941  -0.922
108   R        -1.094  -1.093  -1.082  -0.711  -0.704  -0.688  -0.944  -0.941  -0.922
109   Q        -1.094  -1.093  -1.082  -0.896  -0.896  -0.874  -0.944  -0.941  -0.922
110   S        -1.094  -1.093  -1.082  -1.068  -1.056  -1.047  -0.944  -0.941  -0.922
111   S        -1.094  -1.093  -1.082  -1.103  -1.092  -1.081  -0.944  -0.941  -0.922
112   E        -1.094  -1.093  -1.082  -1.126  -1.113  -1.105  -0.944  -0.941  -0.922
113   L        -1.094  -1.093  -1.082  -1.017  -1.008  -0.996  -0.944  -0.941  -0.922
114   D         1.925   1.927   1.944   2.071   2.079   2.103   2.086   2.089   2.111
115   T         0.176   0.156   0.136   0.191   0.154   0.122   0.066   0.035   0.001
116   R         0.176   0.156   0.136   0.323   0.292   0.255   0.066   0.035   0.001
117   I         0.176   0.168   0.144   0.140   0.124   0.075   0.066   0.055   0.015
118   Y        -1.094  -1.093  -1.082  -1.166  -1.178  -1.145  -0.944  -0.941  -0.922
119   V        -1.094  -1.093  -1.082  -0.810  -0.807  -0.788  -0.944  -0.941  -0.922
120   L         0.176   0.208   0.155   0.140   0.199   0.096   0.066   0.118   0.033
121   I         0.176   0.168   0.144   0.376   0.361   0.334   0.066   0.055   0.015
122   L         1.925   1.927   1.944   1.758   1.765   1.789   2.086   2.089   2.111
123   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
124   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
125   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
126   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
127   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
128   L         0.176   0.168   0.144   0.003  -0.008  -0.043   0.066   0.055   0.015
129   L        -1.094  -1.093  -1.082  -1.126  -1.116  -1.105  -0.944  -0.941  -0.922
130   S        -1.094  -1.093  -1.082  -0.984  -0.968  -0.962  -0.944  -0.941  -0.922
131   F        -1.094  -1.093  -1.082  -0.918  -0.923  -0.896  -0.944  -0.941  -0.922
132   L         0.176   0.156   0.136   0.003  -0.027  -0.057   0.066   0.035   0.001
133   L        -1.094  -1.093  -1.082  -0.945  -0.932  -0.923  -0.944  -0.941  -0.922
134   P         0.176   0.156   0.136   0.187   0.148   0.116   0.066   0.035   0.001
135   I         0.020   0.021   0.034  -0.292  -0.291  -0.268  -0.186  -0.185  -0.163
136   A         1.925   1.927   1.944   2.167   2.173   2.199   2.086   2.089   2.111
137   W         0.020   0.021   0.034   0.309   0.312   0.335  -0.186  -0.185  -0.163
138   T         0.020   0.021   0.034   0.142   0.144   0.167  -0.186  -0.185  -0.163
139   V         0.176   0.208   0.155  -0.010   0.042  -0.041   0.066   0.118   0.033
140   L         1.925   1.927   1.944   1.758   1.765   1.789   2.086   2.089   2.111
141   D         0.176   0.208   0.155  -0.023   0.029  -0.052   0.066   0.118   0.033
142   G        -1.094  -1.093  -1.082  -0.848  -0.853  -0.825  -0.944  -0.941  -0.922
143   D        -1.094  -1.093  -1.082  -1.172  -1.173  -1.151  -0.944  -0.941  -0.922
144   R         0.176   0.156   0.136   0.311   0.281   0.241   0.066   0.035   0.001
145   E        -1.094  -1.093  -1.082  -1.214  -1.205  -1.193  -0.944  -0.941  -0.922
146   T        -1.094  -1.093  -1.082  -1.214  -1.215  -1.193  -0.944  -0.941  -0.922
147   T         0.176   0.156   0.136   0.224   0.192   0.160   0.066   0.035   0.001
148   L        -1.094  -1.093  -1.082  -0.891  -0.876  -0.869  -0.944  -0.941  -0.922
149   E         0.176   0.156   0.136  -0.006  -0.034  -0.064   0.066   0.035   0.001
150   D        -1.094  -1.093  -1.082  -0.973  -0.972  -0.951  -0.944  -0.941  -0.922
151   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
152   K        -1.094  -1.093  -1.082  -1.034  -1.032  -1.013  -0.944  -0.941  -0.922
153   D         0.176   0.156   0.136   0.278   0.247   0.209   0.066   0.035   0.001
154   N         0.176   0.156   0.136   0.249   0.216   0.183   0.066   0.035   0.001
155   D         0.176   0.208   0.155  -0.006   0.045  -0.035   0.066   0.118   0.033
156   C        -1.094  -1.093  -1.082  -0.912  -0.924  -0.891  -0.944  -0.941  -0.922
157   N         0.176   0.168   0.144   0.106   0.093   0.040   0.066   0.055   0.015
158   V        -1.094  -1.093  -1.082  -1.166  -1.168  -1.145  -0.944  -0.941  -0.922
159   D        -1.094  -1.093  -1.082  -1.057  -1.060  -1.036  -0.944  -0.941  -0.922
160   L        -1.094  -1.093  -1.082  -1.074  -1.062  -1.053  -0.944  -0.941  -0.922
161   I        -1.094  -1.093  -1.082  -1.172  -1.176  -1.151  -0.944  -0.941  -0.922
162   E        -1.094  -1.093  -1.082  -1.063  -1.049  -1.041  -0.944  -0.941  -0.922
163   N        -1.094  -1.093  -1.082  -0.912  -0.908  -0.891  -0.944  -0.941  -0.922
164   E         1.925   1.927   1.944   1.739   1.745   1.770   2.086   2.089   2.111
165   R        -1.094  -1.093  -1.082  -1.103  -1.103  -1.081  -0.944  -0.941  -0.922
166   R         0.176   0.156   0.136   0.174   0.139   0.087   0.066   0.035   0.001
167   L         0.176   0.156   0.136  -0.028  -0.058  -0.091   0.066   0.035   0.001
168   K         1.925   1.927   1.944   1.972   1.976   2.003   2.086   2.089   2.111
169   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
170   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
171   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
172   H         1.925   1.927   1.944   2.291   2.297   2.324   2.086   2.089   2.111
173   Y         0.020   0.021   0.034   0.262   0.264   0.288  -0.186  -0.185  -0.163
174   N         0.020   0.021   0.034  -0.049  -0.047  -0.024  -0.186  -0.185  -0.163
175   D        -1.094  -1.093  -1.082  -1.097  -1.096  -1.076  -0.944  -0.941  -0.922
176   G        -1.094  -1.093  -1.082  -1.001  -1.009  -0.979  -0.944  -0.941  -0.922
177   E         0.176   0.156   0.136   0.025  -0.003  -0.030   0.066   0.035   0.001
178   R         0.176   0.168   0.144   0.294   0.284   0.239   0.066   0.055   0.015
179   A         0.176   0.168   0.144   0.278   0.263   0.223   0.066   0.055   0.015
180   V        -1.094  -1.093  -1.082  -1.103  -1.105  -1.081  -0.944  -0.941  -0.922
181   L         0.176   0.168   0.144  -0.010  -0.020  -0.058   0.066   0.055   0.015
182   Q         0.176   0.168   0.144   0.355   0.344   0.303   0.066   0.055   0.015
183   F         0.176   0.168   0.144   0.257   0.242   0.190   0.066   0.055   0.015
184   G        -1.094  -1.093  -1.082  -0.779  -0.778  -0.756  -0.944  -0.941  -0.922
185   K        -1.094  -1.093  -1.082  -1.137  -1.132  -1.116  -0.944  -0.941  -0.922
186   N         0.176   0.168   0.144   0.286   0.276   0.239   0.066   0.055   0.015
187   R        -1.094  -1.093  -1.082  -1.137  -1.139  -1.116  -0.944  -0.941  -0.922
188   S         0.176   0.168   0.144  -0.072  -0.082  -0.121   0.066   0.055   0.015
189   E         1.925   1.927   1.944   1.739   1.745   1.770   2.086   2.089   2.111
190   P         0.176   0.168   0.144   0.224   0.206   0.173   0.066   0.055   0.015
191   I         0.176   0.168   0.144   0.376   0.363   0.334   0.066   0.055   0.015
192   I        -1.094  -1.093  -1.082  -0.810  -0.810  -0.788  -0.944  -0.941  -0.922
193   L        -1.094  -1.093  -1.082  -1.225  -1.214  -1.205  -0.944  -0.941  -0.922
194   S        -1.094  -1.093  -1.082  -1.298  -1.283  -1.277  -0.944  -0.941  -0.922
195   Y         0.176   0.168   0.144   0.483   0.469   0.427   0.066   0.055   0.015
196   K        -1.094  -1.093  -1.082  -1.074  -1.068  -1.053  -0.944  -0.941  -0.922
197   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
198   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
199   -        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
200   D         0.176   0.156   0.136   0.149   0.112   0.064   0.066   0.035   0.001
201   M        -1.094  -1.093  -1.082  -0.978  -0.984  -0.957  -0.944  -0.941  -0.922
202   N         0.176   0.168   0.144   0.220   0.208   0.166   0.066   0.055   0.015
203   V         0.176   0.156   0.136   0.098   0.060   0.013   0.066   0.035   0.001
204   L        -1.094  -1.093  -1.082  -1.341  -1.334  -1.320  -0.944  -0.941  -0.922
205   E        -1.094  -1.093  -1.082  -1.085  -1.073  -1.064  -0.944  -0.941  -0.922
206   G        -1.094  -1.093  -1.082  -0.721  -0.720  -0.699  -0.944  -0.941  -0.922
207   E         0.176   0.168   0.144  -0.054  -0.065  -0.104   0.066   0.055   0.015
208   H         0.176   0.208   0.155   0.111   0.157   0.089   0.066   0.118   0.033
209   E         0.176   0.208   0.155   0.081   0.137   0.037   0.066   0.118   0.033
210   F        -1.094  -1.093  -1.082  -0.858  -0.859  -0.836  -0.944  -0.941  -0.922
211   T        -1.094  -1.093  -1.082  -0.896  -0.893  -0.874  -0.944  -0.941  -0.922
212   S         0.176   0.168   0.144  -0.063  -0.073  -0.111   0.066   0.055   0.015
213   K        -1.094  -1.093  -1.082  -0.995  -0.994  -0.973  -0.944  -0.941  -0.922
214   E         1.925   1.927   1.944   1.739   1.745   1.770   2.086   2.089   2.111
215   E         1.925   1.927   1.944   1.739   1.745   1.770   2.086   2.089   2.111
216   H         0.176   0.208   0.155   0.351   0.399   0.326   0.066   0.118   0.033
217   S        -1.094  -1.093  -1.082  -1.334  -1.325  -1.314  -0.944  -0.941  -0.922
218   N        -1.094  -1.093  -1.082  -1.091  -1.086  -1.070  -0.944  -0.941  -0.922
219   S        -1.094  -1.093  -1.082  -0.896  -0.880  -0.874  -0.944  -0.941  -0.922
220   H         0.176   0.156   0.136   0.331   0.292   0.241   0.066   0.035   0.001
221   L         0.176   0.168   0.144  -0.148  -0.159  -0.209   0.066   0.055   0.015
222   T         0.176   0.156   0.136   0.203   0.170   0.136   0.066   0.035   0.001
223   S        -1.094  -1.093  -1.082  -0.956  -0.940  -0.935  -0.944  -0.941  -0.922
224   K        -1.094  -1.093  -1.082  -0.923  -0.920  -0.901  -0.944  -0.941  -0.922
225   S        -1.094  -1.093  -1.082  -1.074  -1.058  -1.053  -0.944  -0.941  -0.922
226   E        -1.094  -1.093  -1.082  -1.178  -1.169  -1.157  -0.944  -0.941  -0.922
227   N         0.176   0.208   0.155   0.212   0.261   0.178   0.066   0.118   0.033
228   A         0.176   0.156   0.136   0.157   0.118   0.071   0.066   0.035   0.001
229   L         0.176   0.156   0.136  -0.023  -0.055  -0.086   0.066   0.035   0.001
230   N         0.020   0.021   0.034   0.150   0.152   0.175  -0.186  -0.185  -0.163
231   Q        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
232   V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
233   G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
234   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
235   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
236   D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
237   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
238   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
239   G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
240   C        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
241   H        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
242   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
243   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
244   K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
245   Q        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
246   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
247   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
248   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
249   D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
250   K         0.176   0.156   0.136   0.174   0.138   0.106   0.066   0.035   0.001
251   N        -1.094  -1.093  -1.082  -1.114  -1.114  -1.093  -0.944  -0.941  -0.922
252   E         0.176   0.156   0.136  -0.041  -0.074  -0.103   0.066   0.035   0.001
253   P         1.925   1.927   1.944   1.999   1.999   2.031   2.086   2.089   2.111
254   N         0.176   0.156   0.136   0.115   0.079   0.032   0.066   0.035   0.001
255   G         0.176   0.208   0.155   0.294   0.339   0.267   0.066   0.118   0.033
256   E         0.176   0.208   0.155  -0.184  -0.123  -0.225   0.066   0.118   0.033
257   A        -1.094  -1.093  -1.082  -0.789  -0.787  -0.767  -0.944  -0.941  -0.922
258   D         0.176   0.208   0.155   0.224   0.275   0.192   0.066   0.118   0.033
259   G         0.020   0.021   0.034   0.166   0.168   0.192  -0.186  -0.185  -0.163
260   E         0.020   0.021   0.034  -0.257  -0.256  -0.233  -0.186  -0.185  -0.163
261   D         1.925   1.927   1.944   1.995   2.000   2.026   2.086   2.089   2.111
262   D         1.925   1.927   1.944   1.995   2.000   2.026   2.086   2.089   2.111
263   N         0.020   0.021   0.034  -0.066  -0.064  -0.041  -0.186  -0.185  -0.163
264   N         0.020   0.021   0.034  -0.265  -0.265  -0.241  -0.186  -0.185  -0.163
265   R         1.925   1.927   1.944   2.110   2.116   2.142   2.086   2.089   2.111
266   E         0.020   0.021   0.034  -0.204  -0.203  -0.179  -0.186  -0.185  -0.163
267   K         0.020   0.021   0.034   0.101   0.103   0.126  -0.186  -0.185  -0.163
268   D         0.020   0.021   0.034   0.134   0.136   0.159  -0.186  -0.185  -0.163
269   C         0.020   0.021   0.034  -0.023  -0.022   0.001  -0.186  -0.185  -0.163
270   S         0.020   0.021   0.034  -0.283  -0.282  -0.259  -0.186  -0.185  -0.163
271   S         0.020   0.021   0.034  -0.292  -0.291  -0.268  -0.186  -0.185  -0.163
272   S         0.020   0.021   0.034  -0.513  -0.512  -0.489  -0.186  -0.185  -0.163
273   S         0.020   0.021   0.034  -0.337  -0.336  -0.313  -0.186  -0.185  -0.163
274   E         0.020   0.021   0.034  -0.429  -0.428  -0.405  -0.186  -0.185  -0.163
275   V         0.020   0.021   0.034  -0.015  -0.014   0.010  -0.186  -0.185  -0.163
276   E         1.925   1.927   1.944   1.805   1.810   1.836   2.086   2.089   2.111
277   S         0.020   0.021   0.034  -0.301  -0.300  -0.277  -0.186  -0.185  -0.163
278   Q         0.020   0.021   0.034   0.068   0.070   0.093  -0.186  -0.185  -0.163
279   S         0.020   0.021   0.034  -0.160  -0.159  -0.136  -0.186  -0.185  -0.163
280   K         1.925   1.927   1.944   1.948   1.953   1.979   2.086   2.089   2.111
281   C         0.020   0.021   0.034   0.302   0.304   0.328  -0.186  -0.185  -0.163
282   R         0.020   0.021   0.034  -0.032  -0.030  -0.007  -0.186  -0.185  -0.163
283   K         0.020   0.021   0.034  -0.117  -0.116  -0.092  -0.186  -0.185  -0.163
284   E         0.020   0.021   0.034  -0.221  -0.220  -0.197  -0.186  -0.185  -0.163
285   S         1.925   1.927   1.944   1.696   1.701   1.727   2.086   2.089   2.111
286   T         0.020   0.021   0.034  -0.074  -0.073  -0.050  -0.186  -0.185  -0.163
287   A         0.020   0.021   0.034   0.109   0.111   0.135  -0.186  -0.185  -0.163
288   E         1.925   1.927   1.944   1.805   1.810   1.836   2.086   2.089   2.111
289   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
290   D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
291   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
292   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
293   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
294   R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
295   D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
296   T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
297   R        -1.094  -1.093  -1.082  -1.074  -1.078  -1.053  -0.944  -0.941  -0.922
298   T         0.176   0.168   0.144   0.064   0.048  -0.003   0.066   0.055   0.015
299   T        -1.094  -1.093  -1.082  -1.149  -1.148  -1.128  -0.944  -0.941  -0.922
300   S         1.925   1.927   1.944   1.720   1.728   1.751   2.086   2.089   2.111
301   S         0.176   0.156   0.136  -0.072  -0.101  -0.135   0.066   0.035   0.001
302   L         1.925   1.927   1.944   1.758   1.765   1.789   2.086   2.089   2.111
303   K        -1.094  -1.093  -1.082  -1.001  -1.000  -0.979  -0.944  -0.941  -0.922
304   S         0.176   0.156   0.136   0.042   0.018  -0.008   0.066   0.035   0.001
305   S        -1.094  -1.093  -1.082  -1.012  -0.996  -0.990  -0.944  -0.941  -0.922
306   T        -1.094  -1.093  -1.082  -0.848  -0.842  -0.825  -0.944  -0.941  -0.922
307   S         0.176   0.156   0.136  -0.175  -0.207  -0.251   0.066   0.035   0.001
308   F        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
309   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
310   I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
311   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
312   F        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
313   K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
314   G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
315   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
316   I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
317   D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
318   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
319   K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
320   S         0.020   0.021   0.034  -0.299  -0.298  -0.275  -0.186  -0.185  -0.163
321   L         1.925   1.927   1.944   1.714   1.719   1.745   2.086   2.089   2.111
322   N         0.020   0.021   0.034  -0.261  -0.260  -0.237  -0.186  -0.185  -0.163
323   Q         0.020   0.021   0.034   0.068   0.070   0.093  -0.186  -0.185  -0.163
324   P         0.020   0.021   0.034  -0.251  -0.250  -0.227  -0.186  -0.185  -0.163
325   S         1.925   1.927   1.944   1.675   1.680   1.705   2.086   2.089   2.111
326   S         0.020   0.021   0.034  -0.261  -0.260  -0.237  -0.186  -0.185  -0.163
327   L         0.020   0.021   0.034  -0.223  -0.222  -0.199  -0.186  -0.185  -0.163
328   L        -1.094  -1.093  -1.082  -1.126  -1.116  -1.105  -0.944  -0.941  -0.922
329   H         0.176   0.208   0.155   0.327   0.370   0.302   0.066   0.118   0.033
330   I         0.176   0.208   0.155   0.003   0.053  -0.027   0.066   0.118   0.033
331   Q         0.176   0.156   0.136   0.199   0.161   0.112   0.066   0.035   0.001
332   V         0.176   0.156   0.136   0.249   0.215   0.183   0.066   0.035   0.001
333   S         1.925   1.927   1.944   1.720   1.728   1.751   2.086   2.089   2.111
334   P         1.925   1.927   1.944   1.999   1.999   2.031   2.086   2.089   2.111
335   T        -1.094  -1.093  -1.082  -1.149  -1.152  -1.128  -0.944  -0.941  -0.922
336   K         1.925   1.927   1.944   1.972   1.976   2.003   2.086   2.089   2.111
337   S        -1.094  -1.093  -1.082  -1.143  -1.135  -1.122  -0.944  -0.941  -0.922
338   S        -1.094  -1.093  -1.082  -0.956  -0.942  -0.935  -0.944  -0.941  -0.922
339   N         0.176   0.156   0.136   0.249   0.216   0.183   0.066   0.035   0.001
340   L        -1.094  -1.093  -1.082  -1.341  -1.329  -1.320  -0.944  -0.941  -0.922
341   D        -1.094  -1.093  -1.082  -0.973  -0.972  -0.951  -0.944  -0.941  -0.922
342   A         0.176   0.156   0.136   0.278   0.242   0.207   0.066   0.035   0.001
343   Q         1.925   1.927   1.944   2.134   2.139   2.166   2.086   2.089   2.111
344   V         0.176   0.168   0.144   0.249   0.236   0.198   0.066   0.055   0.015
345   N         0.176   0.156   0.136   0.098   0.061   0.013   0.066   0.035   0.001
346   T        -1.094  -1.093  -1.082  -1.190  -1.192  -1.169  -0.944  -0.941  -0.922
347   E         0.176   0.168   0.144   0.046   0.036   0.007   0.066   0.055   0.015
348   Q         1.925   1.927   1.944   2.134   2.139   2.166   2.086   2.089   2.111
349   A         1.925   1.927   1.944   2.089   2.093   2.121   2.086   2.089   2.111
350   Y         0.176   0.156   0.136   0.471   0.437   0.398   0.066   0.035   0.001
351   S         0.176   0.156   0.136  -0.015  -0.042  -0.071   0.066   0.035   0.001
352   Q         0.176   0.156   0.136   0.208   0.169   0.121   0.066   0.035   0.001
353   P         1.925   1.927   1.944   1.999   1.999   2.031   2.086   2.089   2.111
354   F         1.925   1.927   1.944   2.179   2.183   2.211   2.086   2.089   2.111
355   R        -1.094  -1.093  -1.082  -0.984  -0.986  -0.962  -0.944  -0.941  -0.922
356   Y         0.176   0.156   0.136   0.538   0.506   0.472   0.066   0.035   0.001
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/P38881
Output conservation file - output/P38881
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
