1     M        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
2     S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
3     S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
4     V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
5     E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
6     R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
7     I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
8     K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
9     E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
10    Y        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
11    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
12    D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
13    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
14    P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
15    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
16    E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
17    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
18    N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
19    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
20    Y        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
21    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
22    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
23    P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
24    P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
25    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
26    N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
27    W        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
28    P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
29    Q        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
30    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
31    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
32    D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
33    V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
34    E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
35    L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
36    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
37    N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
38    L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
39    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
40    L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
41    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
42    Y        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
43    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
44    P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
45    H        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
46    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
47    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
48    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
49    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
50    L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
51    D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
52    N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
53    V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
54    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
55    F        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
56    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
57    V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
58    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
59    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
60    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
61    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
62    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
63    V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
64    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
65    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
66    V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
67    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
68    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
69    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
70    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
71    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
72    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
73    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
74    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
75    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
76    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
77    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
78    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
79    A        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
80    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
81    Y        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
82    R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
83    L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
84    S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
85    D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
86    W        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
87    E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
88    N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
89    G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
90    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
91    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
92    T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
93    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
94    D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
95    N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
96    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
97    D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
98    I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
99    K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
100   H        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
101   I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
102   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
103   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
104   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
105   R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
106   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
107   R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
108   N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
109   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
110   I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
111   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
112   C        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
113   I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
114   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
115   Q        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
116   D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
117   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
118   T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
119   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
120   F        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
121   D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
122   G        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
123   T        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
124   V        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
125   R        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
126   S        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
127   N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
128   L        -1.016  -1.016  -1.016  -0.979  -1.076  -0.979  -1.016  -1.016  -1.016
129   D         0.978   0.978   0.978   0.951   0.945   0.951   0.978   0.978   0.978
130   P        -1.016  -1.016  -1.016  -0.969  -0.887  -0.969  -1.016  -1.016  -1.016
131   F        -1.016  -1.016  -1.016  -0.694  -0.747  -0.694  -1.016  -1.016  -1.016
132   D        -1.016  -1.016  -1.016  -1.021  -1.032  -1.021  -1.016  -1.016  -1.016
133   R        -1.016  -1.016  -1.016  -0.845  -0.887  -0.845  -1.016  -1.016  -1.016
134   Y         0.978   0.978   0.978   1.151   1.143   1.151   0.978   0.978   0.978
135   S         0.978   0.978   0.978   0.789   0.884   0.789   0.978   0.978   0.978
136   D         0.978   0.978   0.978   0.951   0.945   0.951   0.978   0.978   0.978
137   V        -1.016  -1.016  -1.016  -0.906  -0.887  -0.906  -1.016  -1.016  -1.016
138   Q        -1.016  -1.016  -1.016  -0.855  -0.916  -0.855  -1.016  -1.016  -1.016
139   I         0.978   0.978   0.978   0.774   0.802   0.774   0.978   0.978   0.978
140   Y        -1.016  -1.016  -1.016  -1.097  -1.197  -1.097  -1.016  -1.016  -1.016
141   G        -1.016  -1.016  -1.016  -0.958  -0.930  -0.958  -1.016  -1.016  -1.016
142   V        -1.016  -1.016  -1.016  -1.086  -1.017  -1.086  -1.016  -1.016  -1.016
143   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
144   S        -1.016  -1.016  -1.016  -1.129  -1.047  -1.129  -1.016  -1.016  -1.016
145   K         0.978   0.978   0.978   1.023   1.065   1.023   0.978   0.978   0.978
146   V         0.978   0.978   0.978   1.080   1.104   1.080   0.978   0.978   0.978
147   G        -1.016  -1.016  -1.016  -0.704  -0.665  -0.704  -1.016  -1.016  -1.016
148   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
149   I         0.978   0.978   0.978   0.774   0.802   0.774   0.978   0.978   0.978
150   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
151   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
152   C        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
153   D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
154   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
155   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
156   C        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
157   L        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
158   I        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
159   F        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
160   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
161   Q        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
162   E        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
163   Q        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
164   P        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
165   N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
166   F        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
167   S        -1.016  -1.016  -1.016  -1.118  -1.047  -1.118  -1.016  -1.016  -1.016
168   S        -1.016  -1.016  -1.016  -1.075  -0.973  -1.075  -1.016  -1.016  -1.016
169   H        -1.016  -1.016  -1.016  -0.754  -0.733  -0.754  -1.016  -1.016  -1.016
170   K        -1.016  -1.016  -1.016  -0.969  -0.973  -0.969  -1.016  -1.016  -1.016
171   L        -1.016  -1.016  -1.016  -1.206  -1.290  -1.206  -1.016  -1.016  -1.016
172   R        -1.016  -1.016  -1.016  -0.845  -0.887  -0.845  -1.016  -1.016  -1.016
173   N        -1.016  -1.016  -1.016  -1.140  -1.076  -1.140  -1.016  -1.016  -1.016
174   R        -1.016  -1.016  -1.016  -0.958  -0.944  -0.958  -1.016  -1.016  -1.016
175   F         0.978   0.978   0.978   1.235   1.221   1.235   0.978   0.978   0.978
176   I        -1.016  -1.016  -1.016  -1.319  -1.243  -1.319  -1.016  -1.016  -1.016
177   D        -1.016  -1.016  -1.016  -1.021  -1.032  -1.021  -1.016  -1.016  -1.016
178   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
179   N        -1.016  -1.016  -1.016  -1.021  -1.032  -1.021  -1.016  -1.016  -1.016
180   T         0.978   0.978   0.978   1.037   1.065   1.037   0.978   0.978   0.978
181   V         0.978   0.978   0.978   1.080   1.104   1.080   0.978   0.978   0.978
182   V        -1.016  -1.016  -1.016  -1.097  -1.076  -1.097  -1.016  -1.016  -1.016
183   K        -1.016  -1.016  -1.016  -0.948  -0.916  -0.948  -1.016  -1.016  -1.016
184   S        -1.016  -1.016  -1.016  -1.140  -1.106  -1.140  -1.016  -1.016  -1.016
185   G         0.978   0.978   0.978   1.094   1.163   1.094   0.978   0.978   0.978
186   G         0.978   0.978   0.978   1.094   1.163   1.094   0.978   0.978   0.978
187   S        -1.016  -1.016  -1.016  -1.075  -0.973  -1.075  -1.016  -1.016  -1.016
188   N         0.978   0.978   0.978   1.008   1.025   1.008   0.978   0.978   0.978
189   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
190   S         0.978   0.978   0.978   0.789   0.884   0.789   0.978   0.978   0.978
191   Q         0.978   0.978   0.978   1.179   1.143   1.179   0.978   0.978   0.978
192   G         0.978   0.978   0.978   1.094   1.163   1.094   0.978   0.978   0.978
193   Q        -1.016  -1.016  -1.016  -0.855  -0.916  -0.855  -1.016  -1.016  -1.016
194   R         0.978   0.978   0.978   1.023   1.025   1.023   0.978   0.978   0.978
195   Q         0.978   0.978   0.978   1.179   1.143   1.179   0.978   0.978   0.978
196   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
197   L        -1.016  -1.016  -1.016  -1.151  -1.228  -1.151  -1.016  -1.016  -1.016
198   C         0.978   0.978   0.978   1.318   1.317   1.318   0.978   0.978   0.978
199   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
200   A         0.978   0.978   0.978   1.151   1.182   1.151   0.978   0.978   0.978
201   R         0.978   0.978   0.978   1.023   1.025   1.023   0.978   0.978   0.978
202   S         0.978   0.978   0.978   0.789   0.884   0.789   0.978   0.978   0.978
203   M        -1.016  -1.016  -1.016  -0.979  -1.076  -0.979  -1.016  -1.016  -1.016
204   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
205   G        -1.016  -1.016  -1.016  -0.906  -0.873  -0.906  -1.016  -1.016  -1.016
206   A        -1.016  -1.016  -1.016  -0.875  -0.859  -0.875  -1.016  -1.016  -1.016
207   R        -1.016  -1.016  -1.016  -0.948  -0.944  -0.948  -1.016  -1.016  -1.016
208   N        -1.016  -1.016  -1.016  -0.969  -0.944  -0.969  -1.016  -1.016  -1.016
209   I         0.978   0.978   0.978   0.774   0.802   0.774   0.978   0.978   0.978
210   M        -1.016  -1.016  -1.016  -0.927  -0.930  -0.927  -1.016  -1.016  -1.016
211   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
212   I        -1.016  -1.016  -1.016  -1.388  -1.466  -1.388  -1.016  -1.016  -1.016
213   D         0.978   0.978   0.978   0.951   0.945   0.951   0.978   0.978   0.978
214   E         0.978   0.978   0.978   1.008   0.985   1.008   0.978   0.978   0.978
215   A         0.978   0.978   0.978   1.151   1.182   1.151   0.978   0.978   0.978
216   T        -1.016  -1.016  -1.016  -1.129  -1.106  -1.129  -1.016  -1.016  -1.016
217   A        -1.016  -1.016  -1.016  -1.032  -0.959  -1.032  -1.016  -1.016  -1.016
218   S         0.978   0.978   0.978   0.789   0.884   0.789   0.978   0.978   0.978
219   I         0.978   0.978   0.978   0.774   0.802   0.774   0.978   0.978   0.978
220   D         0.978   0.978   0.978   0.951   0.945   0.951   0.978   0.978   0.978
221   Y         0.978   0.978   0.978   1.151   1.143   1.151   0.978   0.978   0.978
222   I        -1.016  -1.016  -1.016  -1.151  -1.136  -1.151  -1.016  -1.016  -1.016
223   S        -1.016  -1.016  -1.016  -1.118  -1.047  -1.118  -1.016  -1.016  -1.016
224   D         0.978   0.978   0.978   0.951   0.945   0.951   0.978   0.978   0.978
225   A        -1.016  -1.016  -1.016  -0.774  -0.774  -0.774  -1.016  -1.016  -1.016
226   K        -1.016  -1.016  -1.016  -1.140  -1.106  -1.140  -1.016  -1.016  -1.016
227   I        -1.016  -1.016  -1.016  -1.388  -1.466  -1.388  -1.016  -1.016  -1.016
228   Q         0.978   0.978   0.978   1.179   1.143   1.179   0.978   0.978   0.978
229   K        -1.016  -1.016  -1.016  -0.845  -0.859  -0.845  -1.016  -1.016  -1.016
230   T        -1.016  -1.016  -1.016  -1.118  -1.047  -1.118  -1.016  -1.016  -1.016
231   I        -1.016  -1.016  -1.016  -1.388  -1.466  -1.388  -1.016  -1.016  -1.016
232   R         0.978   0.978   0.978   1.023   1.025   1.023   0.978   0.978   0.978
233   E         0.978   0.978   0.978   1.008   0.985   1.008   0.978   0.978   0.978
234   T        -1.016  -1.016  -1.016  -0.744  -0.733  -0.744  -1.016  -1.016  -1.016
235   M        -1.016  -1.016  -1.016  -0.606  -0.637  -0.606  -1.016  -1.016  -1.016
236   K        -1.016  -1.016  -1.016  -0.969  -0.944  -0.969  -1.016  -1.016  -1.016
237   N         0.978   0.978   0.978   1.008   1.025   1.008   0.978   0.978   0.978
238   T        -1.016  -1.016  -1.016  -1.118  -1.047  -1.118  -1.016  -1.016  -1.016
239   T        -1.016  -1.016  -1.016  -0.958  -0.944  -0.958  -1.016  -1.016  -1.016
240   I         0.978   0.978   0.978   0.774   0.802   0.774   0.978   0.978   0.978
241   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
242   T         0.978   0.978   0.978   1.037   1.065   1.037   0.978   0.978   0.978
243   I         0.978   0.978   0.978   0.774   0.802   0.774   0.978   0.978   0.978
244   A         0.978   0.978   0.978   1.151   1.182   1.151   0.978   0.978   0.978
245   H         0.978   0.978   0.978   1.304   1.317   1.304   0.978   0.978   0.978
246   R         0.978   0.978   0.978   1.023   1.025   1.023   0.978   0.978   0.978
247   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
248   R         0.978   0.978   0.978   1.023   1.025   1.023   0.978   0.978   0.978
249   S        -1.016  -1.016  -1.016  -1.118  -1.047  -1.118  -1.016  -1.016  -1.016
250   V        -1.016  -1.016  -1.016  -1.097  -1.076  -1.097  -1.016  -1.016  -1.016
251   I         0.978   0.978   0.978   0.774   0.802   0.774   0.978   0.978   0.978
252   D         0.978   0.978   0.978   0.951   0.945   0.951   0.978   0.978   0.978
253   Y         0.978   0.978   0.978   1.151   1.143   1.151   0.978   0.978   0.978
254   D         0.978   0.978   0.978   0.951   0.945   0.951   0.978   0.978   0.978
255   K         0.978   0.978   0.978   1.023   1.065   1.023   0.978   0.978   0.978
256   I         0.978   0.978   0.978   0.774   0.802   0.774   0.978   0.978   0.978
257   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
258   V         0.978   0.978   0.978   1.080   1.104   1.080   0.978   0.978   0.978
259   M        -1.016  -1.016  -1.016  -0.979  -1.076  -0.979  -1.016  -1.016  -1.016
260   E        -1.016  -1.016  -1.016  -1.021  -1.061  -1.021  -1.016  -1.016  -1.016
261   M        -1.016  -1.016  -1.016  -0.665  -0.665  -0.665  -1.016  -1.016  -1.016
262   G         0.978   0.978   0.978   1.094   1.163   1.094   0.978   0.978   0.978
263   R        -1.016  -1.016  -1.016  -0.958  -0.944  -0.958  -1.016  -1.016  -1.016
264   V         0.978   0.978   0.978   1.080   1.104   1.080   0.978   0.978   0.978
265   K        -1.016  -1.016  -1.016  -0.917  -0.887  -0.917  -1.016  -1.016  -1.016
266   E         0.978   0.978   0.978   1.008   0.985   1.008   0.978   0.978   0.978
267   Y         0.978   0.978   0.978   1.151   1.143   1.151   0.978   0.978   0.978
268   D         0.978   0.978   0.978   0.951   0.945   0.951   0.978   0.978   0.978
269   H        -1.016  -1.016  -1.016  -0.764  -0.761  -0.764  -1.016  -1.016  -1.016
270   P         0.978   0.978   0.978   1.249   1.355   1.249   0.978   0.978   0.978
271   Y         0.978   0.978   0.978   1.151   1.143   1.151   0.978   0.978   0.978
272   T        -1.016  -1.016  -1.016  -0.906  -0.887  -0.906  -1.016  -1.016  -1.016
273   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
274   I         0.978   0.978   0.978   0.774   0.802   0.774   0.978   0.978   0.978
275   S        -1.016  -1.016  -1.016  -1.118  -1.047  -1.118  -1.016  -1.016  -1.016
276   D        -1.016  -1.016  -1.016  -1.021  -1.032  -1.021  -1.016  -1.016  -1.016
277   R        -1.016  -1.016  -1.016  -0.948  -0.944  -0.948  -1.016  -1.016  -1.016
278   N        -1.016  -1.016  -1.016  -1.021  -1.032  -1.021  -1.016  -1.016  -1.016
279   T        -1.016  -1.016  -1.016  -1.118  -1.047  -1.118  -1.016  -1.016  -1.016
280   I        -1.016  -1.016  -1.016  -1.388  -1.466  -1.388  -1.016  -1.016  -1.016
281   F         0.978   0.978   0.978   1.235   1.221   1.235   0.978   0.978   0.978
282   Y         0.978   0.978   0.978   1.151   1.143   1.151   0.978   0.978   0.978
283   R         0.978   0.978   0.978   1.023   1.025   1.023   0.978   0.978   0.978
284   L        -1.016  -1.016  -1.016  -0.979  -1.076  -0.979  -1.016  -1.016  -1.016
285   C         0.978   0.978   0.978   1.318   1.317   1.318   0.978   0.978   0.978
286   R        -1.016  -1.016  -1.016  -0.969  -1.003  -0.969  -1.016  -1.016  -1.016
287   Q        -1.016  -1.016  -1.016  -0.855  -0.887  -0.855  -1.016  -1.016  -1.016
288   S         0.978   0.978   0.978   0.789   0.884   0.789   0.978   0.978   0.978
289   G        -1.016  -1.016  -1.016  -1.075  -0.973  -1.075  -1.016  -1.016  -1.016
290   E         0.978   0.978   0.978   1.008   0.985   1.008   0.978   0.978   0.978
291   F        -1.016  -1.016  -1.016  -1.032  -1.136  -1.032  -1.016  -1.016  -1.016
292   E         0.978   0.978   0.978   1.008   0.985   1.008   0.978   0.978   0.978
293   N        -1.016  -1.016  -1.016  -1.140  -1.076  -1.140  -1.016  -1.016  -1.016
294   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
295   F        -1.016  -1.016  -1.016  -0.979  -0.988  -0.979  -1.016  -1.016  -1.016
296   E        -1.016  -1.016  -1.016  -0.969  -0.973  -0.969  -1.016  -1.016  -1.016
297   L         0.978   0.978   0.978   0.698   0.592   0.698   0.978   0.978   0.978
298   A         0.978   0.978   0.978   1.151   1.182   1.151   0.978   0.978   0.978
299   K         0.978   0.978   0.978   1.023   1.065   1.023   0.978   0.978   0.978
300   V        -1.016  -1.016  -1.016  -0.927  -0.944  -0.927  -1.016  -1.016  -1.016
301   S        -1.016  -1.016  -1.016  -1.032  -0.959  -1.032  -1.016  -1.016  -1.016
302   F        -1.016  -1.016  -1.016  -0.714  -0.747  -0.714  -1.016  -1.016  -1.016
303   D        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
304   N        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
305   K        -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000  -1.000     *
306   R        -1.016  -1.016  -1.016  -0.917  -0.916  -0.917  -1.016  -1.016  -1.016
* gap fraction no less than  0.50; conservation set to M-S
  M: mean;  S: standard deviation

al2co - The parameters are:

Input alignment file - ../mafft-mac/clustal/P0CE69
Output conservation file - output/P0CE69
All 9 methods are used - true 
   1. unweighted entropy measure; 2. Henikoff entropy measure;
   3. independent count entropy measure;
   4. unweighted variance measure; 5. Henikoff variance measure;
   6. independent count variance measure;
   7. unweighted matrix-based sum-of-pairs measure;
   8. Henikoff matrix-based sum-of-pairs measure;
   9. independent count matrix-based sum-of-pairs measure;
Window size - 1
Conservation normalized to zero mean and unity variance
Gap fraction to suppress calculation -  0.50
